|
Name : polA (SH1234) Accession : YP_253149.1 Strain : Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 Genome accession: NC_007168 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 1269552 - 1272182 bp Length : 2631 bp Strand : + Note : - DNA sequence : TTGAATAAATTAGTTTTAATTGATGGTAATAGTTTAAGTTTTAGAGCATTTTATGCATTACCACTACTTTCTAACAAAGC AGGAATACATACGAATGCAGTATACGGTTTTGCTATGTTATTGGAAAAGATTATGAGAGAAGAACAACCATCGCACTTTT TAGTTGCGTTTGACGCCGGCAAAACAACATTTAGACATTCAAAATATAGTGAATATAAAGGCGGAAGACAAAGTACACCA CCTGAGTTAAGCGAACAGTTCCCATACATTCGACAATTATTAGATACTTACCATATCAAACACTATGAGTTAGAAAATTA TGAAGCTGACGATATTATAGGCACATTAAGTAAAGAAGCTAATGACCAAGGGTTTGAAACGATTATAGTTACTGGGGATC GAGATTTAACACAGTTAGCAACTGATAATGTTACTATTTATTACACAAAGAAAGGTGTAACAGATGTTGATCATTATACG CCAGAATTCATTGCTGAAAAATATGATGGACTTAATCCCAATCAAATTATAGATATGAAAGGACTAATGGGGGATGCATC TGATAACATCCCTGGCGTTGCTGGTGTAGGCGAAAAGACAGCTATCAAGCTATTGAAACAATTTAATACAGTTGAAGGTG TTTATGACAATATAGATTCAGTCTCTGGAAAAAAATTAAAAGAAAAACTCGAAAATAGTCGTGAAGACGCATTCATGAGT AAAGACTTAGCAACGATTAATAAAAATAGTCCAATTGAAGTAACATTACAAGACACTGTGTTAAAAAATCAAGATGATAA TAAAGATAAAATTGAATTATTCAAAAAGTTAGAATTCAAACAATTATTATCTGATATAGATAGTAATAATACTGAAGAGA AACACGAAGATAAAGTCATTGAAGTGAGTAATGATTTTAACAACATAAATTTTAAAGAATTAAAAGAAGCTGTGATTCAC ATCGAAGTAGATGGTACCAATTACTTACAGGATACAATTTTAAAATTTGGATTTTATGATGGAGTGGACCATGTTGTAAT AGATTCCGATCAACTAAAGGAATATCCTGAATTGATTAAATGGCTAGAGAATGAGACTACAGAAAAAATTGTTTATGATG CTAAAAAAACATACGTTGTTGCGCATAGATTAGATATAGATATAAAAAATATTGTATTTGATGTTATGTTAGCAAGTTAT ATTATCGATCCATCAAGAACGATAGATGATGTAAACTCTGTAGTAAGTAATTATAATCAAAATTTTGTCCAAGATGATAT TTCAATTTATGGAAAAGGGAAAAAGAGACATGTCCCAGAAGACACAATATTAAATAAGCATATTGCTTCAATCACAGAGG CAATTTATGCCTGCAAACGTGAAATGGTTGCTGAATTAGAATCGCACCAACAAATTGATCTATTGTTGAATTTAGAACTT CCACTTGCACGTATCTTAAGTGAAATGGAAGAAACAGGAATTTATACGGATATTAATGACTTAAGACAAATGCAGTCAGA AATCCAAGGAAAATTAGATTTACTAATAAGTAATATTCACGAAGCGGCTGGGGAAGAATTTAACATTAACTCTCCTAAAC AATTAGGTGTAGTATTATTTGAAACGCTAGAACTACCAGTCATTAAAAAAACAAAAACTGGATATTCTACTGCAGTTGAT GTGTTGGAGCAATTACAAGGTCAACACCCAATAATTGACTATATACTTGAATATCGTCAATTATCAAAATTACAATCCAC TTATGTAGAGGGATTACAAAAAGTCATAAGTAAAGATAACAGAATTCATACTCGCTTCAATCAAACATTAGCGCAAACTG GTCGTTTATCAAGTGTAGATCCTAATTTACAAAATATACCAGTCCGTCTTGAAGAAGGACGTAAGATTAGAAAAGCTTTT AAGCCTACTTCAAATGATAGTGTGATATTATCAGCTGACTACTCTCAAATTGAATTACGTGTACTCGCTCATATTACCCA AGATGAAAGTATGAAAGAAGCATTTATCAATGAAAAAGATGTTCATACTGCTACTGCGATGAAAGTATTTGATGTAGAAG CGAATGAAGTTAACGCTTTAATGCGAAGACAGGCTAAAGCTGTTAACTTTGGAATAGTGTATGGTATTAGTGATTATGGT TTGAGCCAGAGCTTAAACATTACTCGAAAAAAAGCAAAAGCATTTATAGATGATTATTTGGCAAGTTTTCCAGGTGTAAA ACAATACATGTCTGATATTGTTAAAGATGCGAAAGCAGATGGATATGTTGAAACATTATTGCACCGTCGCAGATATATAC CAGATATTAATAGTAGGAACTTTAATTTGAGAGGTTTTGCTGAACGTACGGCAATGAATACTCCAATACAGGGTAGTGCA GCAGATATTATTAAATTAGCAATGGTAGAATTTGATAGACAAATTAAACAAACGTCTTATCATGCTCAGTTATTACTACA AGTACATGATGAATTAATTTTCGAAGTACCTGCCAATGAAGTTGAAGATTTTAGTTTATTTGTTGAGGAAATTATGGAAC ACGCATTACAATTAGATGTGCCGTTAAAAGTAGATTCTAACTATGGATCTACATGGTATGATGCAAAATAG Protein sequence : MNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAVYGFAMLLEKIMREEQPSHFLVAFDAGKTTFRHSKYSEYKGGRQSTP PELSEQFPYIRQLLDTYHIKHYELENYEADDIIGTLSKEANDQGFETIIVTGDRDLTQLATDNVTIYYTKKGVTDVDHYT PEFIAEKYDGLNPNQIIDMKGLMGDASDNIPGVAGVGEKTAIKLLKQFNTVEGVYDNIDSVSGKKLKEKLENSREDAFMS KDLATINKNSPIEVTLQDTVLKNQDDNKDKIELFKKLEFKQLLSDIDSNNTEEKHEDKVIEVSNDFNNINFKELKEAVIH IEVDGTNYLQDTILKFGFYDGVDHVVIDSDQLKEYPELIKWLENETTEKIVYDAKKTYVVAHRLDIDIKNIVFDVMLASY IIDPSRTIDDVNSVVSNYNQNFVQDDISIYGKGKKRHVPEDTILNKHIASITEAIYACKREMVAELESHQQIDLLLNLEL PLARILSEMEETGIYTDINDLRQMQSEIQGKLDLLISNIHEAAGEEFNINSPKQLGVVLFETLELPVIKKTKTGYSTAVD VLEQLQGQHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISKDNRIHTRFNQTLAQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEEGRKIRKAF KPTSNDSVILSADYSQIELRVLAHITQDESMKEAFINEKDVHTATAMKVFDVEANEVNALMRRQAKAVNFGIVYGISDYG LSQSLNITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMSDIVKDAKADGYVETLLHRRRYIPDINSRNFNLRGFAERTAMNTPIQGSA ADIIKLAMVEFDRQIKQTSYHAQLLLQVHDELIFEVPANEVEDFSLFVEEIMEHALQLDVPLKVDSNYGSTWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 48 |
