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Name : coxA (RF_0627) Accession : YP_246643.1 Strain : Rickettsia felis URRWXCal2 Genome accession: NC_007109 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 670636 - 672234 bp Length : 1599 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATGACCACCACACTCCGCACGGTTGGAAGCGGTGGCTTTTTTCTACCAA TCATAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCCGGAATTGTCGGAGGGTTATTTTCTCTTCTCTTTA GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGTACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTGCTTATCACGGCACATGCG GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGTGGTTTTGGTAACTATTTCGTACCTCTGTTAATAGGGGC TCCTGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTGTTAGTTACTGCTTTCATCCTGCTTATGGGTTCTG CTTTTGTTGACGGCGGTCCCGGAACGGGTTGGACGCTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTGAGCGGTCACCCGGGGGCAGCC GTTGATATGGCTATTTTCAGCTTACATTTAACCGGTCTATCGTCAATCCTTGGATCAATTAATTTAATCGTTACTATATT TAATATGAGAGCTCCTGGCATGGGGCTTTTCAAGATGCCATTATTTGTTTGGTCTATATTAGTTACTGCATTCCTTATAA TCTTAGCCATGCCAGTACTTGGCGGAGCTATAACTATGCTGCTTACCGACCGTAACTTTGGAACTAATTTCTTTAAACCG GACGGCGGTGGCGATCCTGTATTATTCCAGCATCTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC GGGCTTTGGTATAGTTAGCCAGGTTATCTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGAATGGTCGGAGCTA TGGTAATAATCGGATTCGTCGGGTTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTTGGTCTTTCTTATAATGCACTTATA TATTTCACTGCCGGAACAATGATTATAGCAGTTCCGACAGGCATTAAAATATTTAGTTGGATAGCGACTATGTGGGGTGG TTCGATTACATTCCCGACTCCTATGCTATTTTCAATAGGGTTTATTATATTATTCACGATTGGCGGCGTAACTGGCATAA TCCTATCAAATTCAGCACTTGATAGGGTACTGCACGATACTTACTATGTTGTGGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTC GGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGATTTTATTACTGGTTCGGCAAAATATCCGGTAAACAATATCCGGAAATTTTAGG AAAAATCCATTTTTGGATTACATTTATTGGTGTTAATTTAACTTTCTTCCCACAGCACTTTTTAGGGCTTGCGGGTATGC CAAGAAGAATACCAGACTACCCTGAAGCTTTCGCAGGTTGGAATATGGTTTCATCGATAGGAGCAGGTATCTCTATGGCG GCTGCTCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACACTAAAATACGGAAAAGATTGTCCTAACAATCCTTGGGGTGATGG TGCTGATACGCTTGAGTGGACGCTTACCTCACCACCGCCATTCCATACTTTTGAAACACCACCGCATATTGAGGGGTAA Protein sequence : MDITTTEIYHDDHHTPHGWKRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVTAFILLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTNFFKP DGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMVGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL GALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPEILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFAGWNMVSSIGAGISMA AALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGDGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 1e-93 | 47 |
