Name : VF_A0967 (VF_A0967) Accession : YP_206925.1 Strain : Genome accession: NC_006841 Putative virulence/resistance : Unknown Product : nucleoside permease NupC Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG1972 EC number : - Position : 1088475 - 1089695 bp Length : 1221 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTCATTATTCATGAGCTGTGTTGGAATCTTGGTGCTATTGTTCATTGGATTTTTACTATCCGAGAATAAAAAAGCCAT CAATGTAAGAACGATTGTCATTGCGCTTATTACTCAAATATCATTCGGTGCTTTTGTAATGTACGTTCCTTTAGGTCAAG GAATACTACAAATGATGAGTGATGCCGTTAACCATATTATTAATTTCTCAAATGAGGGATTAACCTTCGTATTTGGCGAT CTCGCTAACTATAAAGTCGGCTTTATTTTTGTAATTAACGTTCTTTGTGTCGTTATCTTTATTTCTGCTCTTATCTCCGT GCTTTATTACCTCAAAATAATGCAGTTCGTAATTAATTTAATCGGTGGTGCGTTATCTAAATTGTTCGGTACGAGTAAGG CGGAATCAATGTCTGCTACTGCCAACATTTTTGTTGGTCCTATCGAAGCTCCTTCAATGGTACGTCCGTTAATCAAAAAA ATGACTCGTTCTGAACTGTTTGCGGTAATGACAGGCGGATTAGCGAGCGTTGCTGGCGGCACAATGATTGGCTACATCAA TTTAGGGATAGACCCAAAATATATTTTAACCGCTTGCTTTATGACGGCTCCTGCTGGACTTCTGTTTGCCAAATTACTTT GCCCACAAACAGAACAAGAAAAAATCACTAATGAAATTGAAATCGATGACGAAACCACACCTAAATCACTCTTAGATGCG ATAACTGATGGTTCTATCATGGGGATGAATCAAGTCGCCACCGTGACAGCCTTACTTATCTCCTTTGTTGCTTTGATCGC ATTAGTAAATAGCTTAGTTGGCGGTATTGGTGATTTAATCTCGATTGAAGGTTTAAGCCTAGAACTGATTATCGGTTATA TATTATCTCCTCTGGCTTTTTTAATGGGGGTTCCTTGGAGCGAAGCCGTTACCGCAGCATCACTAATTGGCCAAAAAATT GCGGTTAATGAGTTTGTTGCCTATATCAACTTTATTGAAATAGCGGAAACCTTATCTCCAAAAACTCAAGCTATTGTTGT ATTTAGCCTTTGTGGTTTTGCCAACATTGGTTCTTTAGCGATGGTTATTGGTGGCCTTGGTGCTATATGTCCAAATAAAC GCCATATTCTTTCGGAAATTGGACCTCGTGTTTTAATGGCCGCAATTCTTGCAAACTTAATGTCAGGTACCATTGCTGGT GCGCTTCTTTCATTTTCTTAA Protein sequence : MSLFMSCVGILVLLFIGFLLSENKKAINVRTIVIALITQISFGAFVMYVPLGQGILQMMSDAVNHIINFSNEGLTFVFGD LANYKVGFIFVINVLCVVIFISALISVLYYLKIMQFVINLIGGALSKLFGTSKAESMSATANIFVGPIEAPSMVRPLIKK MTRSELFAVMTGGLASVAGGTMIGYINLGIDPKYILTACFMTAPAGLLFAKLLCPQTEQEKITNEIEIDDETTPKSLLDA ITDGSIMGMNQVATVTALLISFVALIALVNSLVGGIGDLISIEGLSLELIIGYILSPLAFLMGVPWSEAVTAASLIGQKI AVNEFVAYINFIEIAETLSPKTQAIVVFSLCGFANIGSLAMVIGGLGAICPNKRHILSEIGPRVLMAAILANLMSGTIAG ALLSFS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 9e-71 | 44 |