Gene Information

Name : VF_A0046 (VF_A0046)
Accession : YP_206004.2
Strain :
Genome accession: NC_006841
Putative virulence/resistance : Resistance
Product : acriflavin resistance plasma membrane protein
Function : -
COG functional category : V : Defense mechanisms
COG ID : COG0841
EC number : -
Position : 50498 - 53563 bp
Length : 3066 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAACATTGCTGAATATTCAATTAAAAATAAAGTCATTAGCTGGTTATTTATTACCATTTTAACGATTGGCGGTATTAC
TTCATTTCTTGATTTAGGACGCTTGGAGGACCCTGCATTTACGATTAAAGATGCAATGGTTGTTGCTACCTATCCAGGAG
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CACCATCATGGCTGGTTTGGGTTTTGCTACCGTATTAACCTTAATTGTGGTGCCTGTTATGTTCGCTATTTTATTTAAGA
TAAAGCCAGCAGCACAAACTATTTAA

Protein sequence :
MNIAEYSIKNKVISWLFITILTIGGITSFLDLGRLEDPAFTIKDAMVVATYPGATSKEVEEELTYPLEKAIRKLPYIDKI
TSTSSNGMSQIMVSMKMDYGPDELPQIWDEMRRKINDLKPTLPQGIQSLQIIDDFGDVFGVMMMLTGDDYNYVELKRYAD
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PVSMAALTTILGLIPLLFDAFFSSMAITIMAGLGFATVLTLIVVPVMFAILFKIKPAAQTI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
VC0395_A1355 YP_001217299.1 AcrB/AcrD/AcrF family transporter Not tested VPI-2 Protein 6e-170 41

• Homologs from CARD and BacMet (resistance genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
VF_A0046 YP_206004.2 acriflavin resistance plasma membrane protein BAC0526 Protein 0.0 86
VF_A0046 YP_206004.2 acriflavin resistance plasma membrane protein BAC0428 Protein 0.0 58
VF_A0046 YP_206004.2 acriflavin resistance plasma membrane protein BAC0519 Protein 0.0 57
VF_A0046 YP_206004.2 acriflavin resistance plasma membrane protein BAC0425 Protein 3e-170 41