Name : VF_A0046 (VF_A0046) Accession : YP_206004.2 Strain : Genome accession: NC_006841 Putative virulence/resistance : Resistance Product : acriflavin resistance plasma membrane protein Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0841 EC number : - Position : 50498 - 53563 bp Length : 3066 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAACATTGCTGAATATTCAATTAAAAATAAAGTCATTAGCTGGTTATTTATTACCATTTTAACGATTGGCGGTATTAC TTCATTTCTTGATTTAGGACGCTTGGAGGACCCTGCATTTACGATTAAAGATGCAATGGTTGTTGCTACCTATCCAGGAG CAACGTCAAAAGAAGTGGAAGAAGAATTAACCTACCCGTTAGAAAAAGCGATCCGTAAATTACCTTATATTGATAAAATT ACGTCGACCTCATCCAATGGCATGTCACAGATTATGGTGAGCATGAAAATGGACTATGGCCCAGATGAACTACCTCAAAT CTGGGATGAAATGCGTAGAAAAATTAATGATTTAAAACCAACTCTGCCTCAAGGTATTCAATCTTTACAAATCATTGATG ATTTTGGTGACGTGTTTGGTGTGATGATGATGCTTACTGGAGACGATTATAATTACGTTGAACTTAAGCGTTATGCTGAC ACATTAACTCGTGAATTAGAGCTTATTGATGGTGTTGGTAAGATCTCGATTGCGGGTGATCAACAAGAAATGCTGTTTGT AGAGATTTCGTTGGATCGCCTAGCTGCCCTTAATCTAGATATGAATACGGTTGCAGGCTTATTGAATCAACAAAACAATG TGGTTCAAGCGGGTGAAGTATTAGTGAATGGAGAAAGCTTAACGATTCGACCAAGTGGAACATTAACTACTGTTGAATCG TTGGGGGACTTGATCATCCATGGCCGTGATACTGGTAATCTTATCCGTCTAAAGGATGTTGCAACGATCACTCGTGGTTT ACAAGAAAAGCCGGGCAACATTATTCGATTTAATGGTAAAAATGCCTTAAATATCGGACTATCTTTTGCATCAGGTGTGA ACGTGGTGGAAGTTGGTCAACGTGTCCAAGAAGAACTAACGTACTTAGAGTCGATAAAACCTGCAGGACTTGAGTTAAGC TATTTCTATAATCAAGCTCAAGAAGTTGATACATCTGTTCGTGACTTTATTATTAGTTTAGCGGAAGCAGTAGCAATCGT TATTGTTGTTTTATTGTTTGCGATGGGGATGCGAAGCGGCCTAATTATTGGTGTGGTGTTACTACTGACCGTGTTTGGTA CGTTTATCTTAATGAGCTACAACAACATTGATCTTCACCGTATCTCATTAGGTGCGCTGATCATTGCGCTAGGGATGTTG GTTGATAATGCCATTGTAGTGGTTGAGGGGATTTTAGTTGGTCTCAAAAAAGGACGAACCAAAGTTCAAGCAGCTGCGGA CATTGTAAAACAAACGCAATGGCCTTTATTGGGTGCAACAGTCATCGCAATTGCTGCGTTTGCTCCGATTGGTTTATCAG AAGATGCCACTGGCGAGTTCATGGGTGATTTGTATTGGGTGTTGTGTTATTCACTGTTTTTAAGTTGGGTAACGGCTATT ACGATCACGCCATTCTTAGCTGACTTGTTATTAAAAGAAGAAGATAAAAACACAGGTGTAGAAGAAGACGCTTACAAAGG GTTCTTATTTACTGCATTTGGTTCATCGCTTAAGTTGGCATTACGTTTCCGTTGGTTAACAGTGGCATCGCTAGTGGGTT TACTTGTTGTTGCGGTAATGGCGTTTGGTAATGTGAAGCAGCAATTCTTCCCAGCATCTAACACGCCAATGTTCTATGTG GATATGTGGATGCCAGAAGGTACAGATATTCGTGAAACAATTAAGCAATCAGAAGCGGTTGAGAGTTACATTAATAAGCA AGACAACATTGAGTTTGTATCAGCGTCGATTGGTCAAGGTATGCAGCGTTTTGCGCTAACTTATCAACCAGAAAAAAGCT ATGAAGCGTATGCACAATTTCAGATCCGAACCACAGATCGCGAATCAATGTTTAGCTTGTTAGAAAACCTAACCAATTCA TTAGATCAACGCTTTGATAAGCCAACATTCCAATTCAAAATGATGGAGTTTGGCCCGTCTCCAGCATCAAAAATTGAAGT TCGAATTTCAGGACCAGATCCTCAAATCTTACGTAACTTAGCTACAAATGTTGAAGATATTATATTAACGGATCCAGGTT CGAGAAATATTCGACATGATTGGCGTGAGCGAACAAAGGAACTTACGCCAATATTTAATGAATCAAAAGCGCGTCGTTTA GGTATTTCAAAAGAAGACTTATCGAACACATTACAAATGGCGTTTGGTGGCTCTACGTTAGGTATGTTGCGTGATGGTAC TCATACATTGCCGATCGTGACACGTTTACCAGAGTCAGAACGTGTGGATTTTGAATCTTTACAAAACGTAAAAATCTGGA GTCCATCGCTTCAAACTTATATTCCAGTAGATCAAGTAATTGATGGAGTAAATTTAGATTGGAGTGAACCATTGATTCAG CGTCGTGATAGAAAACGTACGATCACAGTAATGGCAGATCATGATTTATTAAGTGATGACACTCCAGCAAGCCTGCTAGC GCGTATTCAACCAAAAGTAATGGAATTACCATTGCCTGAAGGGTATGAGATTACGTGGGGTGGTGAATATGAATCGTCTA AAGATGCACAGGAGTCTTTATTTGGTTCATTACCAATGGGCTACCTATTTATGTTTATTATCACCATGTTGCTATTTAAC TCGGTTAAAAAACCATTAAAGGTGATTTGGTTTACGGTTCCACTGTCTATTATTGGTGTGGCTTTTGGTTTACTTGGTAC AAACATGCCATTCAGCTTTACGGCATTTTTGGGACTATTGAGCTTAAGTGGAATGATTTTGAAAAATGGTATTGTTTTGC TTGATCAAATCAACCTTGAATTGGCGTCAGGTAAAGATCCATACCTTGCTATCGTAGACAGTGCTATTAGTCGTGTTCGT CCCGTAAGTATGGCGGCATTGACGACAATTTTGGGGCTTATCCCATTACTGTTTGATGCGTTCTTTAGCTCAATGGCGAT CACCATCATGGCTGGTTTGGGTTTTGCTACCGTATTAACCTTAATTGTGGTGCCTGTTATGTTCGCTATTTTATTTAAGA TAAAGCCAGCAGCACAAACTATTTAA Protein sequence : MNIAEYSIKNKVISWLFITILTIGGITSFLDLGRLEDPAFTIKDAMVVATYPGATSKEVEEELTYPLEKAIRKLPYIDKI TSTSSNGMSQIMVSMKMDYGPDELPQIWDEMRRKINDLKPTLPQGIQSLQIIDDFGDVFGVMMMLTGDDYNYVELKRYAD TLTRELELIDGVGKISIAGDQQEMLFVEISLDRLAALNLDMNTVAGLLNQQNNVVQAGEVLVNGESLTIRPSGTLTTVES LGDLIIHGRDTGNLIRLKDVATITRGLQEKPGNIIRFNGKNALNIGLSFASGVNVVEVGQRVQEELTYLESIKPAGLELS YFYNQAQEVDTSVRDFIISLAEAVAIVIVVLLFAMGMRSGLIIGVVLLLTVFGTFILMSYNNIDLHRISLGALIIALGML VDNAIVVVEGILVGLKKGRTKVQAAADIVKQTQWPLLGATVIAIAAFAPIGLSEDATGEFMGDLYWVLCYSLFLSWVTAI TITPFLADLLLKEEDKNTGVEEDAYKGFLFTAFGSSLKLALRFRWLTVASLVGLLVVAVMAFGNVKQQFFPASNTPMFYV DMWMPEGTDIRETIKQSEAVESYINKQDNIEFVSASIGQGMQRFALTYQPEKSYEAYAQFQIRTTDRESMFSLLENLTNS LDQRFDKPTFQFKMMEFGPSPASKIEVRISGPDPQILRNLATNVEDIILTDPGSRNIRHDWRERTKELTPIFNESKARRL GISKEDLSNTLQMAFGGSTLGMLRDGTHTLPIVTRLPESERVDFESLQNVKIWSPSLQTYIPVDQVIDGVNLDWSEPLIQ RRDRKRTITVMADHDLLSDDTPASLLARIQPKVMELPLPEGYEITWGGEYESSKDAQESLFGSLPMGYLFMFIITMLLFN SVKKPLKVIWFTVPLSIIGVAFGLLGTNMPFSFTAFLGLLSLSGMILKNGIVLLDQINLELASGKDPYLAIVDSAISRVR PVSMAALTTILGLIPLLFDAFFSSMAITIMAGLGFATVLTLIVVPVMFAILFKIKPAAQTI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
VC0395_A1355 | YP_001217299.1 | AcrB/AcrD/AcrF family transporter | Not tested | VPI-2 | Protein | 6e-170 | 41 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
VF_A0046 | YP_206004.2 | acriflavin resistance plasma membrane protein | BAC0526 | Protein | 0.0 | 86 |
VF_A0046 | YP_206004.2 | acriflavin resistance plasma membrane protein | BAC0428 | Protein | 0.0 | 58 |
VF_A0046 | YP_206004.2 | acriflavin resistance plasma membrane protein | BAC0519 | Protein | 0.0 | 57 |
VF_A0046 | YP_206004.2 | acriflavin resistance plasma membrane protein | BAC0425 | Protein | 3e-170 | 41 |