Gene Information

Name : VF_1322 (VF_1322)
Accession : YP_204705.1
Strain :
Genome accession: NC_006840
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : nucleoside permease NupC
Function : -
COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism
COG ID : COG1972
EC number : -
Position : 1470652 - 1471872 bp
Length : 1221 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGAACTTTTTGGTCAGTATTTTAGGCATTGTTTGCCTATTCGCGATTGCAATTCTTTTCTCAGAAAACCGTCAAGCCAT
AAAATGGAGAACAGTATTAGGTGCTTTCCTAATTCAACTGTTATTTGCCGGTTTTATCTTATACGTTCCTATTGGTCGAA
CTATTCTAAATAGTATTTCTATGGCAGTATCAAGCATTATTGATTATGGTCGTGTAGGTACAGAATTCCTTTTTGGTGAT
CTTGCACAGTACAAACTGGGCTTCATTTTTGCCGTCAACGTTTTACCTACGATTGTATTCTTCTCTGCTCTTATCTCAGT
ACTCTATTACCTAGGTGTTATGGGTTGGGTTATTCGCACCATTGGTGGCGGATTACAACGCTTCTTAGGTACAACTCGTA
CAGAATCTATGTCTGCAACCGCAAATATTTTTGTTGGTTCTGTTGAAGCACCACTGGTTGTTCGCCCTTTCCTTGCAAAA
ATGTCACGCTCTGAACTGTTTGCTGTTATGGTTGGTGGTCTTGCCTCTGTAGCTGGCGGTACAATGGTTGGTTACGCAGG
ATTAGGTGTTGAACTTAGATACTTAATTGCCGCAAGTTTCATGTCAGCACCTGCTGGCCTAATGATGGCAAAACTTTTGG
TTCCTCAAACAGAAGAAATCAATGAAGCAGAACAATACTCAGAAGATGAAGTTGATGATGCTCCAGTAAACATTATTGAT
GCCGCTTCACAAGGTGCATTAAATGGCTTACAAATTGTATTTGCTGTTGGTGCGAGCTTATTAGCTATTATTAGCTTAAT
TGCACTACTAAATGGTGGCTTACATAAATTAGGATTATTTGTTGGCTTAGACAATTTAAGCTTAGAGTTAATCTTTGGTT
ACCTATTTGCACCTGTAGCATGGTTAATCGGTGTTCCATGGTCAGAGGCAACAATTGCAGCAAGTCTAATCGGTAAAAAA
ATTGCGATTAATGAATTCGTAGCTTTTGCTGATCTAATGGCAGTAAAAGATCAATTAAGTGAACATTCTCAAGCTATCGT
TACCTTTGCCTTATGTGGCTTTGCTAACTTAACCTCTATTGCAATGTTAATGGGTGGTTTAGGAGGTGTAGTACCAAGCC
GTCGCCCTGATATCGCACGTTTAGGTATGAAAGCAATCTTTGCAGCAACATTAGCAAACTTAATGAGTGCAACCGTTGCA
GGCATCTTCCTGTCTTTCTAA

Protein sequence :
MNFLVSILGIVCLFAIAILFSENRQAIKWRTVLGAFLIQLLFAGFILYVPIGRTILNSISMAVSSIIDYGRVGTEFLFGD
LAQYKLGFIFAVNVLPTIVFFSALISVLYYLGVMGWVIRTIGGGLQRFLGTTRTESMSATANIFVGSVEAPLVVRPFLAK
MSRSELFAVMVGGLASVAGGTMVGYAGLGVELRYLIAASFMSAPAGLMMAKLLVPQTEEINEAEQYSEDEVDDAPVNIID
AASQGALNGLQIVFAVGASLLAIISLIALLNGGLHKLGLFVGLDNLSLELIFGYLFAPVAWLIGVPWSEATIAASLIGKK
IAINEFVAFADLMAVKDQLSEHSQAIVTFALCGFANLTSIAMLMGGLGGVVPSRRPDIARLGMKAIFAATLANLMSATVA
GIFLSF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
yutK YP_005163383.1 putative sodium/nucleoside cotransporter Not tested Not named Protein 2e-67 45