|
Name : VF_1184 (VF_1184) Accession : YP_204567.1 Strain : Genome accession: NC_006840 Putative virulence/resistance : Resistance Product : acriflavin resistance plasma membrane protein Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0841 EC number : - Position : 1314373 - 1317450 bp Length : 3078 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGCCAAGAAAAAGGAATTGCAGCTTATTTCATACAGAATAAAGTCATCAGTTGGATGTTAACACTGATCTTTATGAT TGGTGGTACATCCGCATTTTTTGGTTTAGGACGTTTAGAAGACCCTGCGTTTACCATTAAAGATGCAATGGTCGTAACCA ATTATCCTGGTGCGACACCAGAGCAAGTGGAAGAAGAAGTAACCTACCCACTAGAAAAAGCAATTCAACAGTTAACTTAT GTAGATGAAGTTAACTCGCTGTCTAGTCGTGGACTGTCTCAGATCACTGTAACCATGAAAAACAATTATGGTCCTGATGA TTTACCACAAATCTGGGATGAACTACGCCGTAAGGTGAATGACTTAAAACGTCAATTACCTCCTGGTGTTGGTGAACCAT CAGTTATCGATGATTTTGGTGATGTTTATGGTGTGCTTTTAGCCGTAACAGGAAAAGGCTACTCATATAAAGAAATCTTA GATTATGTTGATTATTTGCGTCGTGAATTAGAGCTTGTTGATGGCGTTAGTAAGGTATCTGTTAGTGGTGTTCAACAAGA ACAAGTCTTTATTGAAGCGTCATTAAAGCGTATGACAAGTTTAGGAATTTCTCCTCAGACTTTGTATAGCTTATTGTCTA ATCAAAATACGGTATCGAGTGCTGGTGCTGTAAAAATCGGAACGGAATATATTCAAATTCACCCAACAGGGGAGTTTGAA GATGTGGCACAGCTCGGTGATTTGATTATTACTGATGGTGGTGCTCAAGGACTAATTTATTTAAAAGACATCGCAGAAGT TAAGCGTGGTTATGTTGAAGTGCCAAGTAATATTGTGAACTTTAATGGTAATTTTGCTCTAAACCTCGGTGTTTCATTTA GTGCAGGTGTTAACGTAGTTGAAATTGGTAAATTAGTTGATCAACGAATGGCTGAGCTTAAAGAGCAGCAGCCTATTGGT ATTGATATCTCTGAAATTTACAGTCAACCAAAAGAAGTGGATAAATCGGTAAGTGGTTTTGTTGTCAGTCTGGGGCAGGC TGTTGCGATTGTAATTATCGTTTTACTTTTCTTTATGGGAGTACGTTCAGGCCTATTAATTGGTCTTATCTTATTATTGA CCGTTGCTGGTACTTTCGTCTTTATGAAGTATTTTGCTATCGATTTACAACGTATTTCTCTTGGTGCTCTGGTTATTGCT CTCGGTATGCTCGTAGATAACGCCATTGTGGTGGTGGAAGGCATACTCATCGGGATGCAAAAAGGAAGGACACGTTTACA AGCCGCTACCGATATTGTGACACAAACAAAATGGCCATTGCTAGGAGCAACGGTTATTGCGGTAACCGCGTTTGCGCCAA TTGGTTTATCTGATGATGCGACCGGTGAATACTGTGGAACGCTCTTTACCGTCTTGCTAATTTCGTTAATGCTAAGCTGG TTTACTGCTATTTCACTTACGCCTTTCTTTGCTTCTTTATTCTTTAAGGAGAGAGTACAAAGCGAAGAAGAGAGTCTTGA AGAGAAAGACCCATACAATGGGATGATCTTTGTTGTTTATAAGCGTTTCCTAGAGTTTTGTATGCGCTACTCTGTAGCAA CCATGGTAATACTGGTTGTAGCTCTTGGTGGTAGTTTATATGGCTTTACCAAAGTTAAACAATCTTTCTTCCCATCATCA ACAACGCCAATCTTCATGGTGGATGTATGGATGCCTGAAGGGACAGATATTCGTTCAACTAATGCGACATTAAAAGAGTT AGAAGAATGGATATTAGAACAGCAACATATTGAACACGTAACAACAACCGCTGGTAAAGGTTTACAGCGTTTCATGTTGA CTTATGCACCAGAGAAAAGTTATGCAGCTTATGGTGAGATAATGACTCGTGTTGATAACTATGAAGCATTACAGCCCTTG ATGGCGAAGTTCCGTCAGCATATCGAAGATCAATACCCACAAATTCAATATAAATTGAAACAAATTGAATTAGGTCCGGG TGGCGGTGCGAAAGTTGAAGCTCGTATTGTTGGTGCTGATCCAACGGTATTACGTGGCTTAGCGGCGCAAGTTATCGACA TTATGCATAATGACCCAGGAGCAACAAACGTACGTCATGATTGGCGTGAGCGTACAAAAGTACTTGAGCCTCAATTTAAT GAGAGTCAGGCTCGTCGTTATGGTATTTCAAAGACAGATGTAAACGAACTATTAGAAATGGCGTTCTCAGGTAAAGCAAT TGGTGTTTACCGTGATGGTACAACATTAATGCCAATTGTCACTCGATTACCCGAAAATGAACGTGTTGATATTAGTACGA TTGAAGGAATGAAAATTTGGAGTCCAGCTCTGTCTCAATACATCCCATTACAGCAAGTTGTACTTGGTTATGATGTGATT TGGGAAGACCCACAAATCGTACGTAAAAACCGTAAACGTATGCTAACTGTAATGGCTGACCCTGATATTTTAGGTGAAGA AACTGCAGCTACATTGCAGAAACGATTACAAACTCAAATTGAGGCGATCGATTTTCCTACGGGTTACAGTTTAGAGTGGG GCGGTGAATATGAATCGTCTCGTGACGCTCAGGCATCATTATTCCAAACGATGCCATTGGGTTATCTATTCATGTTCTTA GTTACTGTCTTCTTATTTAACAGTGTGAAAGAGTCGGTGATTGTTTGGCTAACGGTACCATTAGCTATTATTGGTGTAAC CAGTGGTCTATTGTTACTTAATACGCCATTTGGTTTTATGGCTTTACTCGGTTTCTTGAGCTTGAGTGGTATGCTGTTGA AAAATGGTATCGTATTGCTTGATCAGATTGAAATTGAAATCAAGTCAGGTAAAGAGCCTTATCATGCGGTGGTTGATGCG GCATTAAGTCGTGTGCGTCCTGTTTGTATGGCAGCGATTACAACAATTCTTGGTATGATACCTCTATTGCCTGACATATT CTTTAAGCCAATGGCGGTAACGATTATGTTCGGTTTAGGTTTTGCAACGGTTCTTACTCTAATTGTGGTTCCGGTTCTAT ATCGAATGTTCCACAGAATTAAAGTGGTTGAATACTAA Protein sequence : MSQEKGIAAYFIQNKVISWMLTLIFMIGGTSAFFGLGRLEDPAFTIKDAMVVTNYPGATPEQVEEEVTYPLEKAIQQLTY VDEVNSLSSRGLSQITVTMKNNYGPDDLPQIWDELRRKVNDLKRQLPPGVGEPSVIDDFGDVYGVLLAVTGKGYSYKEIL DYVDYLRRELELVDGVSKVSVSGVQQEQVFIEASLKRMTSLGISPQTLYSLLSNQNTVSSAGAVKIGTEYIQIHPTGEFE DVAQLGDLIITDGGAQGLIYLKDIAEVKRGYVEVPSNIVNFNGNFALNLGVSFSAGVNVVEIGKLVDQRMAELKEQQPIG IDISEIYSQPKEVDKSVSGFVVSLGQAVAIVIIVLLFFMGVRSGLLIGLILLLTVAGTFVFMKYFAIDLQRISLGALVIA LGMLVDNAIVVVEGILIGMQKGRTRLQAATDIVTQTKWPLLGATVIAVTAFAPIGLSDDATGEYCGTLFTVLLISLMLSW FTAISLTPFFASLFFKERVQSEEESLEEKDPYNGMIFVVYKRFLEFCMRYSVATMVILVVALGGSLYGFTKVKQSFFPSS TTPIFMVDVWMPEGTDIRSTNATLKELEEWILEQQHIEHVTTTAGKGLQRFMLTYAPEKSYAAYGEIMTRVDNYEALQPL MAKFRQHIEDQYPQIQYKLKQIELGPGGGAKVEARIVGADPTVLRGLAAQVIDIMHNDPGATNVRHDWRERTKVLEPQFN ESQARRYGISKTDVNELLEMAFSGKAIGVYRDGTTLMPIVTRLPENERVDISTIEGMKIWSPALSQYIPLQQVVLGYDVI WEDPQIVRKNRKRMLTVMADPDILGEETAATLQKRLQTQIEAIDFPTGYSLEWGGEYESSRDAQASLFQTMPLGYLFMFL VTVFLFNSVKESVIVWLTVPLAIIGVTSGLLLLNTPFGFMALLGFLSLSGMLLKNGIVLLDQIEIEIKSGKEPYHAVVDA ALSRVRPVCMAAITTILGMIPLLPDIFFKPMAVTIMFGLGFATVLTLIVVPVLYRMFHRIKVVEY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| VC0395_A1355 | YP_001217299.1 | AcrB/AcrD/AcrF family transporter | Not tested | VPI-2 | Protein | 0.0 | 44 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| VF_1184 | YP_204567.1 | acriflavin resistance plasma membrane protein | BAC0428 | Protein | 0.0 | 83 |
| VF_1184 | YP_204567.1 | acriflavin resistance plasma membrane protein | BAC0519 | Protein | 0.0 | 82 |
| VF_1184 | YP_204567.1 | acriflavin resistance plasma membrane protein | BAC0526 | Protein | 0.0 | 57 |
| VF_1184 | YP_204567.1 | acriflavin resistance plasma membrane protein | BAC0425 | Protein | 0.0 | 44 |
