Gene Information

Name : VF_1096 (VF_1096)
Accession : YP_204479.1
Strain :
Genome accession: NC_006840
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : nucleoside permease NupC
Function : -
COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism
COG ID : COG1972
EC number : -
Position : 1210685 - 1211890 bp
Length : 1206 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGACATCTTTACTTGGTATTTTTGCCATTTTACTGTTTGCTTATTTGTGTTCGACTGACCGCCGTAACATCCCTCTTAG
AACTGTCTCTTTGGCGTTTGGACTACAAATTATTTTTGCCTTACTGGTTCTATATGTTCCTGCTGGTAAAGAGGTTTTAA
ACTCTGTTACAGCAGGCGTATCAGGCGTGATTGATTATGGTCAACAAGGTATTGCCTTTTTATTCGGCGGTTTAGCTACT
GGCAAAGTTGGCTTTGTATTTGCCATTAACGTGCTTGGTATTATCATTTTCTTCTCGGCACTCATTTCTGCGCTTTACCA
CATTGGTGTGATGCCTAAAGTGATTAATTTCATTGGTGGTGGATTACAACGTCTACTTGGTACAGGGCGTGCAGAATCCC
TTGCAGCAACGGCTAATATCTTTGTTAGTATGGTAGAAGCTCCATTAGTTGTTCGTCCTTACTTAAAGCACATGAGTGAT
TCTCAGTTTTTTGCTGTGATGACATGTGGCCTAGCTTCTGTAGCTGGCGGAACCATGGTTGGTTATGCATCATTAGGTGT
GGATCTAAACTTCCTTATCTCTGCTGCATTCATGTCTGCACCAGCAGGATTATTAATGGCTAAGATGATGGTTCCACCGG
GTGATGAAGCAAATAATGATGATGAAATTACCTCTGTTGAGATTGATCATGCAACTAATGTATTTGAAGCATTAGCTGAT
GGTGCTATGTCTGGCTTGCGTATCGCTGTTGCGGTAGGTACGACGTTATTAGCGTTTGTCAGTGTGATTGCTTTACTTAA
CGGCTTACTAGGGCATGTTGGTGATATCTTTGGTATCAAACTAAGTTTTGAATTAATTCTTGGTTACTTGTTTGCTCCTG
TAGCTTTCATCTTAGGTGTGCCATGGAATGAAGCGATTCTTGCTGGTTCATTAATCGGTAATAAGATCGTGGTAAATGAA
TTTGTTGCCTTTATTCAATTAATGGAAGTGAAAGATCAACTAAGTCCACATTCTGTTGCGATAGTTACATTCGCACTGTG
CGGCTTTGCAAATATTTCAACCATGGCAATTTTGATTGGTGGTTTAGGTAGTCTTGTTCCTGAACGTCGTCCATTTATTG
CGAGAATGGGGTTCAGAGCGATTACTGCAGGTGTATTGGCTAACTTAATGAGTGCAGCGATCGCTGGTGTGATTTTGTCA
CTTTAA

Protein sequence :
MTSLLGIFAILLFAYLCSTDRRNIPLRTVSLAFGLQIIFALLVLYVPAGKEVLNSVTAGVSGVIDYGQQGIAFLFGGLAT
GKVGFVFAINVLGIIIFFSALISALYHIGVMPKVINFIGGGLQRLLGTGRAESLAATANIFVSMVEAPLVVRPYLKHMSD
SQFFAVMTCGLASVAGGTMVGYASLGVDLNFLISAAFMSAPAGLLMAKMMVPPGDEANNDDEITSVEIDHATNVFEALAD
GAMSGLRIAVAVGTTLLAFVSVIALLNGLLGHVGDIFGIKLSFELILGYLFAPVAFILGVPWNEAILAGSLIGNKIVVNE
FVAFIQLMEVKDQLSPHSVAIVTFALCGFANISTMAILIGGLGSLVPERRPFIARMGFRAITAGVLANLMSAAIAGVILS
L

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
yutK YP_005163383.1 putative sodium/nucleoside cotransporter Not tested Not named Protein 8e-70 45