Gene Information

Name : VF_1061 (VF_1061)
Accession : YP_204444.1
Strain :
Genome accession: NC_006840
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : anaerobic C4-dicarboxylate transporter
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG3069
EC number : -
Position : 1172014 - 1173381 bp
Length : 1368 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGCTTCGTTATTACTTGTTCTTATCGTTGTTGTTATTGCGGCAAGGATGATTTTAAAGGGGTATAAAGCTGAACCTAC
TTTATTAATGTCAGGGACGATATTGATTTTCGCAACTGGACTTTTTGGCTGGGGCCCAATGTTGCCAGCTTCGGTTACAT
CGACTAATTTTTCAGGATTTGAGCCCTTTAAATACATACAATTTTTAATGGGGTATCGAGCGGGAGCGCTGGGGTTAATG
ATTATGGCTTTGGTCGGTTTTGCTGATTATATGAGTCATATTGGAGCTAACGATGTTGTCGTTCGTTTAGCCACTAAGCC
ACTAAGTCGTATTCAAAATAAAAACATTATGTTGTTCTTTGCTTACTGTATGGCAAGTATCTTACAACTGGCAATTCCTT
CAGCTACCGGTCTTGGCGTGTTATTGATGGGAACACTTTATCCTGTGATGTTGGGATTGGGTATTTCTCGTGGTAGCGCC
GCGGCGGTTATTGCTAGTTCATTAGCGGTAAGTTTTACGCCAACAGGGGTGGATGCAATACGTGCAAGTGAAGCTTTAGG
TATGGACTTGATGAGTTATGTTTCTCATTATCAAGCTCCAACATCGGTAGCAACTATGGTGGTTATCGGTATTATGCATG
TTATTTGGCAGACACAGGTTGATAAAAAGCATCCTGAACAATTCGAACAAGCATCAATTGAACAGACACAAAAAGAGGAA
GTGTTAGCACCTAGTTATTATGTCATTTTACCTTTGCTTCCTATTATTATGGCTGTTGTGTTTTCTAAACTCGTCATTTC
AACGATCAATATGGATGTGACGACGATTGTATTTGTTTCAATGTTTGTTGCTATGTTGTGTGAATGCATAACGAAAAGAA
GTTTAAAAACGGTTTTTGATGGTTTCAATGTGTTCTCAAAAGGAATGGGGAGTGCATTTAGCAGTGTGGTTGTATTATTA
GTTGCTGCTGGTGTTTTTGCTTATGGAATTCAAGCGACAGGAGCGATTACCAACCTAATCATGATGGCTAAATCAGTGGG
CTTACCAAGTGTAGCGATGACATTTGTTTTTGCTGTTGTGACGTTAATGGCTGCGGTGATTATGGGGTCGGGGAATGCGC
CATTCTTGGCGTTTGTTGAATTAATTCCTACTATAGCTTCCAGTATGGGAGCCAACGCAGCGGCAATGCTAATGCCAATG
CAACAAGCCTCAGCAATAGGTCGAGCAATGTCTCCTGTTTCTGCTGTTGTTATTGCTTCAGCAACGGGTGCCAAGTTAAG
TCCATTTGAAGTTGCAAAGCGAACATCTGTTCCAGTCTTAGTAGGCTTTGTGTTTCATTTTGTTATTGTTTACGCTTTTT
ATAGCTAA

Protein sequence :
MASLLLVLIVVVIAARMILKGYKAEPTLLMSGTILIFATGLFGWGPMLPASVTSTNFSGFEPFKYIQFLMGYRAGALGLM
IMALVGFADYMSHIGANDVVVRLATKPLSRIQNKNIMLFFAYCMASILQLAIPSATGLGVLLMGTLYPVMLGLGISRGSA
AAVIASSLAVSFTPTGVDAIRASEALGMDLMSYVSHYQAPTSVATMVVIGIMHVIWQTQVDKKHPEQFEQASIEQTQKEE
VLAPSYYVILPLLPIIMAVVFSKLVISTINMDVTTIVFVSMFVAMLCECITKRSLKTVFDGFNVFSKGMGSAFSSVVVLL
VAAGVFAYGIQATGAITNLIMMAKSVGLPSVAMTFVFAVVTLMAAVIMGSGNAPFLAFVELIPTIASSMGANAAAMLMPM
QQASAIGRAMSPVSAVVIASATGAKLSPFEVAKRTSVPVLVGFVFHFVIVYAFYS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AAQ07475.1 DcuC-like protein Not tested Not named Protein 5e-48 46