Name : tktA (ERWE_CDS_05870) Accession : YP_197463.1 Strain : Ehrlichia ruminantium Welgevonden Genome accession: NC_006832 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : - Position : 942928 - 944943 bp Length : 2016 bp Strand : - Note : Similar to sp|P58333|TKT1_RHIME sp|P51010|TKT_XANFL sp|P56900|TKT2_RHIME sp|P29277|TKT_RHOSH sp|Q52723|TKT_RHOCA; Ortholog to ERGA_CDS_05780 DNA sequence : ATGAGTCAAAAATATAGTAATATGATTGCCATGGCTAATGCTGTAAGAGTACTTTCAATAGATGCTATACAAAAAGCCGC TTCTGGACATCCAGGTATGCCTCTTGGTATGGCAGATGTAGGAACTATGTTATTTGCTAAGTTTTTAAAATTTAATCCTA AGGATCCTAATTGGTTTGATAGGGATAGGTTTGTTTTATCAAATGGACATGGGTCAATGTTATTGTATTCTATATTATAT TTCTTAGGATGTTTGGATATAGAAGAGATAAAAAAGTTTAGGCAAATACATTCTCTGACACCTGGCCATCCAGAATATGG TTGTACTCCTGGAGTTGATGCTACAACTGGTCCGCTAGGTCAGGGATTGGCTTCTGCTGTGGGTATGGCAATAGCAGAAA AAATACTATCTGAAAAATTTGGAGCTGATATTGTATCTCATAATACTTATGTTATGGTTGGGGATGGATGTCTTATGGAG GGAATTAGCCATGAAGCTGCGTCTTTAGCTGGACATTTGCAGTTAGATAAATTAATAGTATTATTTGATGATAATAATGT TTCTATCGATGGTCCTATATCATTGTCTGTTTCTGATAATGTTAAAGGTAGATTTTTATCTTATGGATGGGATGTTGATG AAATAGATGGGCATGATTTTTCTCAGATTGAATCATCAATTAAAAATGCAAAAAATTCTAAAAAGCCATCTCTAATTTGT TGTAAGACTATTATTGGCAAAACTATTCCTTCAAAAGAAAATACTTGTGATATACATAGTTGGCCAGTGACTGAAGAAGA TATCATTGTAATGAAGAAGAGATTAGGGTGGGCTTATAAGCCATTTGAGTTCCCAGAGGAAATTCTGCAATTATGGCAAG ATATTGCGTGTAATTCAGAGGAAGAGTATAAATTATGGGTAGAACGAGTTAGTGAGTATGGCAAGACATCACAAGATTTT ATGGATGTGATGGCTGATGGTGTATCTAATGAGGTTTTTTTGAATTTGAAGAGTTTAAAAGAGGAATTATGTAGCTTGAA TTTGAATGAAGCAACACGTAAATCTTCAGGTAGAGTATTAGATGTTATAATGGGTAGTACTGGTAAGTTGATAGGTGGTT CTGCAGATCTTAGTAATTCTAATAATACTAAACCAAAATTTACATCGGTAATTAATAAAGATAATTTCTCTGGTTCTTAT TTACATTATGGAGTTAGAGAACATGCTATGGCAGCATGTATGAATGGTATGGCATTGCATAAGGGAGTAATCCCTTATGG TGGTACATTTTTAATTTTCTCTGATTATTGTAGACCAGCTATAAGGTTGTCTGCCTTGATGAAAAGGCAAGTTATTTATA TTATGACCCATGATTCAATAGGGGTTGGGGAAGATGGTCCTACTCATCAACCTGTTGAGCATCTACCATCTTTGAGGTTA ATTCCTAATTTGTATGTTTTTAGACCAGCTGATGCTATAGAAGTATTAGAGTGTTGGGAGATTGCATTAAAGTTAATAGA TGCTCCATCGGTTCTGATATTATCTAGACAGAATGTTAAATGTGTACGTAGTACTTATGTTGCAGAGAATATGTCAAACA AAGGTGCATATATTATTCGTGAATATAAGAATGATCTCGATGTAACAATTTTTGCTACTGGGTCTGAGGTTGAGATTGCA TTAAAAGCAAGTGATATTTTAATAGGTAAAGGATTAGGTGTCCGGGTAGTTTCTGTACCTTGTTGGGAATTGTTTTATAA ACAAGATAAAAAATATATTATAAGTCTGTTAAATAATAAAAGTATAAAGGCAGCAGTAGAAGCTGCTAATTCATTTGGTT GGTGTAAGTATATAGGAGAAGATGGAATTTTTGTAGGTTTGGAAGATTTTGGAATATCTGCTCCATTCAAAGATTTGTAT AAGTATTTTGGAATTACTCCAGAAAACTTAGTGGATAAAATACTCAGTAAATTAAGAATTAATAGTAATTACGAAAGTAA TGTTACTGCGGATTGA Protein sequence : MSQKYSNMIAMANAVRVLSIDAIQKAASGHPGMPLGMADVGTMLFAKFLKFNPKDPNWFDRDRFVLSNGHGSMLLYSILY FLGCLDIEEIKKFRQIHSLTPGHPEYGCTPGVDATTGPLGQGLASAVGMAIAEKILSEKFGADIVSHNTYVMVGDGCLME GISHEAASLAGHLQLDKLIVLFDDNNVSIDGPISLSVSDNVKGRFLSYGWDVDEIDGHDFSQIESSIKNAKNSKKPSLIC CKTIIGKTIPSKENTCDIHSWPVTEEDIIVMKKRLGWAYKPFEFPEEILQLWQDIACNSEEEYKLWVERVSEYGKTSQDF MDVMADGVSNEVFLNLKSLKEELCSLNLNEATRKSSGRVLDVIMGSTGKLIGGSADLSNSNNTKPKFTSVINKDNFSGSY LHYGVREHAMAACMNGMALHKGVIPYGGTFLIFSDYCRPAIRLSALMKRQVIYIMTHDSIGVGEDGPTHQPVEHLPSLRL IPNLYVFRPADAIEVLECWEIALKLIDAPSVLILSRQNVKCVRSTYVAENMSNKGAYIIREYKNDLDVTIFATGSEVEIA LKASDILIGKGLGVRVVSVPCWELFYKQDKKYIISLLNNKSIKAAVEAANSFGWCKYIGEDGIFVGLEDFGISAPFKDLY KYFGITPENLVDKILSKLRINSNYESNVTAD |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 1e-134 | 47 |
APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 6e-136 | 45 |