Name : tktA (ERGA_CDS_05780) Accession : YP_196504.1 Strain : Ehrlichia ruminantium Gardel Genome accession: NC_006831 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : - Position : 937938 - 939953 bp Length : 2016 bp Strand : - Note : Similar to sp|P58333|TKT1_RHIME sp|P51010|TKT_XANFL sp|P56900|TKT2_RHIME sp|P29277|TKT_RHOSH sp|Q52723|TKT_RHOCA; Ortholog to ERWE_CDS_05870 DNA sequence : ATGAGTCAAAAATATAGTAATATGATTGCCATGGCTAATGCTGTAAGAGTACTTTCAATAGATGCTATACAAAAAGCCGC TTCTGGACATCCAGGTATGCCTCTTGGTATGGCAGATGTAGGAACTATGTTATTTGCTAAATTTTTAAAATTTAATCCTA AGGATCCTAATTGGTTTGATAGGGATAGGTTTGTTTTATCAAATGGACATGGGTCAATGTTATTGTATTCTATATTATAT TTCTTAGGATGTTTGGATATAGAAGAGATAAAAAAGTTTAGGCAAATACATTCTCTAACACCTGGCCATCCAGAATATGG TTGTACTCCTGGAGTTGATGCTACAACTGGTCCGCTAGGTCAGGGATTGGCTTCTGCTGTGGGTATGGCAATAGCAGAAA AAATACTATCTGAAAAATTTGGAGCTGATATTGTATCTCATAATACTTATGTTATGGTTGGGGATGGATGTCTTATGGAG GGAATTAGCCATGAAGCTGCGTCTTTAGCTGGGCATTTGCAGTTAGATAAATTAATAGTATTATTTGATGATAATAATGT TTCTATCGATGGTCCTATATCATTGTCCGTTTCTGATAATGTTAAAGGTAGATTTTTATCTTATGGATGGGATGTTGATG AAATAGATGGGCATGATTTTTCTCAGATTGAATCATCAATTAAAAATGCAAAAAATTCTAAAAAGCCATCTCTAATTTGT TGTAAGACTATTATTGGTAAAACTATTCCTTCAAAAGAAAATACTTGTGATATACATAGTTGGCCAGTGACTGAAGAAGA TATAATTGTAATGAAGAAGAGATTAGGGTGGGCTTATAAGCCATTTGAGTTCCCAGAGGAAATTCTGCAATTATGGCAAG ATATTGCGTGTAATTCAGAGGAAGAGTATAAATTATGGGTAGAGCGAGTTAGTGAGTATGGCAAGACATCACAAGATTTT ATGGATGTGATGGCTGACGGTGTATCTAATAAGGTTTTTTTGAATTTGAAGAGTTTAAAAGAAGAATTATGTAGCTTGAA TTTGAATGAAGCAACACGTAAATCTTCAGGTAGAGTATTAGACGTTATAATGGGTAGTACTGGTAAGTTGATAGGTGGTT CTGCAGATCTTAGTAATTCTAATAATACTAAACCAAAATTTACATCGGTAATTAATAAAGATAATTTCTCTGGTTCTTAT TTACATTATGGAGTTAGAGAGCATGCTATGGCAGCATGTATGAATGGTATGGCATTGCATAAGGGAGTAATCCCTTATGG TGGTACATTTTTGATTTTCTCTGATTATTGTAGACCAGCTATAAGGTTGTCTGCCTTAATGAAAAGGCAAGTTATTTATA TTATGACCCATGATTCAATAGGGGTTGGGGAAGATGGTCCTACTCATCAACCTGTTGAGCATCTACCATCTTTGAGGTTA ATTCCTAATTTGTATGTTTTTAGACCAGCTGATGCTATAGAAGTATTAGAGTGTTGGGAGATTGCATTAAAGTTAATAGA TGCTCCATCGGTTCTGATATTATCTAGACAGAATGTTAAATGTGTACGTAGTACTTATGTTGCAGAGAATATGTCAAGCA AAGGTGCATATATTATTCGTGAATATAAGAATGATCTCGATGTAACAATTTTTGCTACTGGGTCTGAGGTTGAGATAGCA TTAAAAGCAAGTGATATTTTAATAGGTAAAGGATTAGGTGTCCGGGTAGTTTCTGTACCTTGTTGGGAATTGTTTTATAA ACAAGATAAAAAATATATTATAAGTCTGTTAAATAATAAAAGTATAAAGGCAGCAGTAGAAGCTGCTAGTTCATTTGGTT GGTGTAAGTATATAGGAGAAGATGGAATTTTTGTAGGTTTGGAAGATTTTGGAATATCTGCTCCATTCAAAGATTTGTAT AAGTATTTTGGAATTACTCCAGAAAACTTAGTGGATAAAATACTCAGTAAATTAAGAATTAATAGTAATTACGAAAGTAA TGTTACTGCGGATTGA Protein sequence : MSQKYSNMIAMANAVRVLSIDAIQKAASGHPGMPLGMADVGTMLFAKFLKFNPKDPNWFDRDRFVLSNGHGSMLLYSILY FLGCLDIEEIKKFRQIHSLTPGHPEYGCTPGVDATTGPLGQGLASAVGMAIAEKILSEKFGADIVSHNTYVMVGDGCLME GISHEAASLAGHLQLDKLIVLFDDNNVSIDGPISLSVSDNVKGRFLSYGWDVDEIDGHDFSQIESSIKNAKNSKKPSLIC CKTIIGKTIPSKENTCDIHSWPVTEEDIIVMKKRLGWAYKPFEFPEEILQLWQDIACNSEEEYKLWVERVSEYGKTSQDF MDVMADGVSNKVFLNLKSLKEELCSLNLNEATRKSSGRVLDVIMGSTGKLIGGSADLSNSNNTKPKFTSVINKDNFSGSY LHYGVREHAMAACMNGMALHKGVIPYGGTFLIFSDYCRPAIRLSALMKRQVIYIMTHDSIGVGEDGPTHQPVEHLPSLRL IPNLYVFRPADAIEVLECWEIALKLIDAPSVLILSRQNVKCVRSTYVAENMSSKGAYIIREYKNDLDVTIFATGSEVEIA LKASDILIGKGLGVRVVSVPCWELFYKQDKKYIISLLNNKSIKAAVEAASSFGWCKYIGEDGIFVGLEDFGISAPFKDLY KYFGITPENLVDKILSKLRINSNYESNVTAD |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 3e-134 | 46 |
APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 4e-136 | 45 |