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Name : LBA1871 (LBA1871) Accession : YP_194702.1 Strain : Lactobacillus acidophilus NCFM Genome accession: NC_006814 Putative virulence/resistance : Unknown Product : neopullulanase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.135 Position : 1881740 - 1883461 bp Length : 1722 bp Strand : - Note : COG0366 Glycosidases DNA sequence : ATGCAATTAGCCGCTTTAAGACACAGAACAGAAAGTGAAGATAGTTTTGTAGTTGATCCAAAACATGTTCGTGTTCGTTT TCACACTGCAAAAAATGATGTTGAAAAAGTAATTGTTCATTACTGTGATAATTATTTACCATTAAAATTTGCAGAAACTA CTGAAATGGAAAAGATCGGTGAGGGTCAAGTTGAAGACTATTGGGGTATTACACTTGATGCACCATATCATCGTTTAAAG TACACTTTTGAAGTTATTGGTAAGGACGGTACAAGTGTAGTTTATGGTGACCGTGCGATTAGCGATGATATTAAAGACGC AATCAATGAAGATGGATCATATTTTAAAATTCCATATTGTCATGAAATTGATATGGTCAAAACACCAGACTGGGTTAAGA ATACCGTTTGGTATCAGATATTCCCTGAACGTTATGCTAATGGGGATAAATCAAACGATCCTAAGAATATTAAGCCATGG AATCCAACTGATCATCCTGGTAGAGAGGATTATTATGGCGGTGATTTGCAAGGTGTCTTAGATCATTTAGATTATTTACA AAAGCTAGGCGTTAATGGTTTATACTTTTGTCCAATTTTTAAAGCGAGCTCTAATCATAAATATGACACGATTGATTATT TACAAGTAGATCCGGAATTTGGTGATAAAGATTTATTTGCTAAAGTGGTTAACGAAGCACATGCACGTGGTATGAAGATT ATGCTCGATGCCGTATTTAATCACTTAGGTGATCAATCAATGCAATGGCAAGATGTAGTGCAAAATGGATCTAAGTCACG TTTTGCAGATTGGTTCCATATTAATGAGTATCCAGTTGAACCATATCGTAATCCATTAAAAGGCGAAAAGAATCCGCAAT ATGATACTTTTGCCTTTGAAGAACATATGCCAAAGTTGAATACTGCTAATCCTGAGGTTCAAGATTTCTTGTTAGAAATT GCTACATACTGGGTGAAGTATTTTGATATCGATGCATGGCGTCTTGATGTGGCAAATGAAGTTGATCATCACTTCTGGAA GAAGTTCCATAAAGCAGTCACTGATATTAAGCCAGACTTTTACATTGTAGGTGAAGTTTGGCATTCGGCTCGTCCATGGC TTAATGGCGATGAATTTACAGGTGTAATGAACTATCCGTATACTTTGCAAATTGAAGACCACTTTTTCAAGCATAAGTTA ACTGCTGATCAAATGACTACACGCTTGACTGATCAACTTATGAAATATCGTGATTCTACTAATGAAGCAATGATGAATAT GCTCGATTCACATGATACTGCCAGAATTTTGACAGTTGCAAAAGGTGATCAAGACTTGGCGCTTCAAGCATTAACTTTTG AATTCATGCAAAAAGGTAGTCCATGTATTTATTACGGAACTGAAATGGGGATGGCTGGAGATAATGATCCAGATTGTCGT AAGCCAATGGATTGGTCAAAAGAAGATGGACCTGTATGGCAAAGGGTTCATAAGCTAATTAAATTCCGTTTAGCTCATGA TAAAACGCTCAGTGAAGGTAAAATCAAGTTAAGCGTAACAGAAAATAGGCTAATTGAAGTTATTAGAGAGGGCAAAGAAA GTATTCATGCTTACTTTAATACAACTAAAAATGATGTAAAACTTGATGGTAAAGCTGAATTAAGTCAAGATTTTGAAAAA GGAATACTCGCTCCAAAAGGCTTTGTAATCATGGTTGATTAA Protein sequence : MQLAALRHRTESEDSFVVDPKHVRVRFHTAKNDVEKVIVHYCDNYLPLKFAETTEMEKIGEGQVEDYWGITLDAPYHRLK YTFEVIGKDGTSVVYGDRAISDDIKDAINEDGSYFKIPYCHEIDMVKTPDWVKNTVWYQIFPERYANGDKSNDPKNIKPW NPTDHPGREDYYGGDLQGVLDHLDYLQKLGVNGLYFCPIFKASSNHKYDTIDYLQVDPEFGDKDLFAKVVNEAHARGMKI MLDAVFNHLGDQSMQWQDVVQNGSKSRFADWFHINEYPVEPYRNPLKGEKNPQYDTFAFEEHMPKLNTANPEVQDFLLEI ATYWVKYFDIDAWRLDVANEVDHHFWKKFHKAVTDIKPDFYIVGEVWHSARPWLNGDEFTGVMNYPYTLQIEDHFFKHKL TADQMTTRLTDQLMKYRDSTNEAMMNMLDSHDTARILTVAKGDQDLALQALTFEFMQKGSPCIYYGTEMGMAGDNDPDCR KPMDWSKEDGPVWQRVHKLIKFRLAHDKTLSEGKIKLSVTENRLIEVIREGKESIHAYFNTTKNDVKLDGKAELSQDFEK GILAPKGFVIMVD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SPN23F_09660 | YP_002510949.1 | alpha-amylase | Not tested | PPI-1 | Protein | 5e-134 | 46 |
