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Name : polA (LBA1550) Accession : YP_194398.1 Strain : Lactobacillus acidophilus NCFM Genome accession: NC_006814 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 1538174 - 1540834 bp Length : 2661 bp Strand : - Note : DpoI DNA sequence : ATGGCAGATAAAAAATTACTTCTAATAGATGGAAATTCAGTTGCTTTTCGTGCCTTTTATGCTTTGTATCGGCAACTTGA TCGCTTTACTAGTCCAGATGGGTTGCACACTAATGCGATTTTTACCTTTAAAAACATGTTGGATGCCATTCTTAAACAAG TAGATCCAACTAATATCTTAGTTGCTTTTGATGCGGGCAAAGTTACTTTCAGAACTGCCATGTATAAAGACTACAAGGGC GGCAGACAGAAGACACCTAGTGAATTGCTTGAACAAATGCCTGTTATTCGTGAAATGTTAACGGATTTAGGGATTACAAG CTATGAACTGAAGAATTATGAAGCCGACGATATTATTGGTACTTTATCAAAAATGGGTGAAGATGCTGGCTACGAAGTTA CAGTAGTTACCGGTGACCGTGACTTAACTCAACTTGCTTCAGACAAGACTACAGTTTTGATCACTAAAAATGGTGTGGGT GACACCGAAGCCTACACGCCTGAACACATGAAGGAAGTTAACGGCATAACTCCAACCGAATTCATTGATATGAAGGCTTT GATGGGTGATAACTCCGATAATTATCCTGGTGTTGAAGGCATTGGCCCTAAGACAGCTTCTAATTTGATTCAAAAGTATG GTTCAGTAGAGAATCTTTATGACCACATTGACGATTTGAAGAAGTCTAAGCGTAAAGAACGTTTAATTCGTGATAAGGAT AAGGCATTTTTAGCTAAAAAACTTGCCGCTATTGACCGTGAATCACCAGTTACGGTTACTCTTGAAGACACGATTAAAAA AGATCCAAATTATGAAAAATTGCGTGATCTTTATGAAAGATTAGGCTTTAGAAAATTTTTAGCTGAATTGAATCTAGAGA CTGCTGGTGAAGATTCTGGTGATACCGAGAATTACGATTACGTTGAGCTGACTGAGGATAATGTTGCTGAATTAGACGAC TTGAAAGAAAATGAGATAAGTTTTTATCTTGAAATGCTTGGCGATAATTATCATTTAGCACCATTTGAAGGTTTTAGCTT GAAGGTGGGCGATAAAGTTTATGTCTCAAAAGATATTGCTTTATTACAAGAAAAGCCACTTAAAGATATCCTTGAAAATA GGAAAATTCAAAAGGATGTCTTTGACCTAAAGCGGATGACTGTTGGTTTACATCGACTAGACGTTATTGTTGAAGGACTC AACTATGATATGCTTCTTGCTTCATATTTGGTCAATAATGAAAAGAACTCTAATGACTTAGGTGAAATTGCCCACCTTTA TGATGAATATTCAATCAAGACGGACCTTGAAGTATATGGTAAAGGTAAGAAACAAGCAATCCCAGAAGATAAAGAATTCT TCAAGCACTTAGCCGCTAAAGTATGTGTAATTGAAAAACTTAAACCAGAGTTACTTAAACAACTCAAAGAACATGAACAA GATGATTTGTTTGAAACCATTGAGATTCCAACTGCTCGTGTTTTGGCTAAAATGGAAATTAATGGTATCAAGGTGGAAGC AAGTACATTAATTGAATTGCAAAATGAATTTGCCGTTAAATTAAAGGAACTTGAAGACAAAATTTATAAACAAGCTGGCG AAGAATTCAATTTAAATTCTCCTAAGCAATTAGGTCATATTTTATTTGAAAAATTGAATTTACCAGTATTGAAAAAGACA AAGACAGGTTACTCAACTTCCGTTGAAGTCCTTGATCAATTAAAAACACAGAGTCCAATCGTGAGCGAGATTTTGGATTA TCGTCAAATTGCCAAAATTCAATCTACTTATGTTAAGGGATTACTTGATGTAATTCAACGAGATGGTCGTGTTCACACCC GTTATCTGCAAACTTTAACAGCTACTGGACGTTTATCTAGTGTTGATCCTAACTTGCAGAATATCCCTACTCGTACAGAA GAGGGTAAGCAAATTAGAAAGGCTTTTGTACCTAGTGAACCTGATGGCTATATCTTTTCTTGCGACTATTCACAAGTTGA ACTTCGTGTTTTAGCCCATGTTTCAGGTGATCAAAACATGCAAGAAGCCTTCAAGACTGGCTATGACATTCACGCTCATA CCGCAATGAGGATTTTCCATTTGGACTCACCAGATGAAGTAACGCCACTTATGCGTCGTCACGCTAAGGCCGTTAACTTC GGTATCGTTTACGGAATTTCAGATTATGGTTTGTCAAAGAATTTAGGCATTTCTAGAAAGCGTGCCAAAGAATTTATTGA TAATTACTTTGAACAATATCCTCAAATCAAGGACTATATGGATAAGGCAGTCCAAGAAGCACGTGAAAAGGGCTATGCCG AAACTATTATGCATAGACGTAGATATTTGCCAGATATCCATGCTAAAAAATTCACTGTCCGTTCATTTGCGGAAAGAACA GCAATTAATTCACCAATTCAAGGGTCTGCGGCCGATATTATTAAGATTGCGATGATTAATATGCAAAAGAAACTTGATGA ATTGCATCTTAAAACTAAAATGGTAATTCAGGTTCACGACGAATTAATTTTTGATGTTCCAAAAGATGAACTTGAAACAA TTAAGAAGATTGTTCCAGAAATAATGCAATCAGCAGTTAAATTGGATGTTCCTTTAATTGCCGATTCAGGTTGGGGACAC AATTGGTATGATGCAAAGTAG Protein sequence : MADKKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLDRFTSPDGLHTNAIFTFKNMLDAILKQVDPTNILVAFDAGKVTFRTAMYKDYKG GRQKTPSELLEQMPVIREMLTDLGITSYELKNYEADDIIGTLSKMGEDAGYEVTVVTGDRDLTQLASDKTTVLITKNGVG DTEAYTPEHMKEVNGITPTEFIDMKALMGDNSDNYPGVEGIGPKTASNLIQKYGSVENLYDHIDDLKKSKRKERLIRDKD KAFLAKKLAAIDRESPVTVTLEDTIKKDPNYEKLRDLYERLGFRKFLAELNLETAGEDSGDTENYDYVELTEDNVAELDD LKENEISFYLEMLGDNYHLAPFEGFSLKVGDKVYVSKDIALLQEKPLKDILENRKIQKDVFDLKRMTVGLHRLDVIVEGL NYDMLLASYLVNNEKNSNDLGEIAHLYDEYSIKTDLEVYGKGKKQAIPEDKEFFKHLAAKVCVIEKLKPELLKQLKEHEQ DDLFETIEIPTARVLAKMEINGIKVEASTLIELQNEFAVKLKELEDKIYKQAGEEFNLNSPKQLGHILFEKLNLPVLKKT KTGYSTSVEVLDQLKTQSPIVSEILDYRQIAKIQSTYVKGLLDVIQRDGRVHTRYLQTLTATGRLSSVDPNLQNIPTRTE EGKQIRKAFVPSEPDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDQNMQEAFKTGYDIHAHTAMRIFHLDSPDEVTPLMRRHAKAVNF GIVYGISDYGLSKNLGISRKRAKEFIDNYFEQYPQIKDYMDKAVQEAREKGYAETIMHRRRYLPDIHAKKFTVRSFAERT AINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVIQVHDELIFDVPKDELETIKKIVPEIMQSAVKLDVPLIADSGWGH NWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 54 |
