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Name : recG (LBA1309) Accession : YP_194169.1 Strain : Lactobacillus acidophilus NCFM Genome accession: NC_006814 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : - Position : 1289068 - 1291104 bp Length : 2037 bp Strand : - Note : catalyzes branch migration in Holliday junction intermediates DNA sequence : ATGATAAATAATGCATTGTTTGCTCCTGTAACGGATTTAAAAGGTGTAGGGACAAAGACTGCAGCTGATCTTGGAAGCTT AGGTATATATAGCATTTATGATTTGCTTTTTTACTTTCCTTTTCGATATGATGAACTTCAGACATTACCGTTAGATCAAA TCATGGATGGTCAAAAGGTAGTATTAAAAGGAATAGTAGCAACTGAACCTTTCGTTAGTCGTTTTGGTTATAAGAAAAGT CGACTAAGCTTCAAAATGAGAATTGACCATGAGGTAATCATGGTCAATTTTTTTAATCAACCATGGTTAAAAAACAAGAT TGAAATTGGTCAAGAAATTGCAATTTACGGCAAGTATAATGTAGCTCGTCAAAGTCTCTCTGCTTTTAAATTTGTAGCAG CAAAAGAAAATGATAGTGGTATGGCACCAATTTATCCGGTTAACCGTCACATAAAGCAAAAAAAGCTAGTTAGCCTGATT GATTTAGCAATTGAAGAATTTTTAGATCAAGTTAATGATATAGTCCCAGAGAAAATCAGACAGGAATATCATTTATTAAA TGATCGAGAAATTATTACCAAAATGCATCATCCCAAAAATAGTAATGACGCAGAAATAGGTAAAAGAAGTGCGATTTTTC GTGAATTTTTTATTTTTGAATTACAATTAGCACTTTTGACTAAAAAAGATGGTAATCAACTAGGTTATGCCAAAAAATAT GATCTAAAAGAGGTTGCTAATCTAACTAAATCGTTACCCTTTGAACTTTCTGATGATCAAAAACATGTTGTTAATGAAAT TTTCGCTGATTTACATTCATCTAATCAAATGAGAAGGCTGCTTCAAGGTGATGTGGGATCAGGTAAAACAGTTGTTGCAG TTTATGCGATTTTTGCTGCAATTACTGCTGGTTATCAAGCTGCTTTGATGGTACCTACAGAAATTTTAGCAACGCAGCAT TTTAAGAAAATCGATGAATTATTACGCCCATTTGGTATAAGAGTGGCGCTTTTAACCAGTAATACTAAAACTTTAGAACG GCGTGAAATATATCGTGAGCTAACTGATGGAACTATTAATGTGGTGATTGGCACACATGCATTGATTCAGAAAAATGTGA TTTTTAAAAAATTGGGTTTAGTTATCATTGATGAACAACATAGATTTGGTGTGGGACAAAGACAGGCTTTAATTAATAAG GGCGATAATCCGGATGTTTTGGCTATGACGGCTACCCCAATTCCTAGAACTCTTGCCCTTACCGTTTATGGAGATATGAC ACTTTCTGAAATTCACCACTTACCATCTGGTAGAAAACCGATTATTTCATCTTGGAAAACAAGTTCTCAGATGAAAGATG TTTATAAACGAATGCATGAGCAATTAGATCAAGGTTTTCAAATATATGCAGTTACACCTTTAATTACGGATTCAGAAACT TTAGATTTGAAGAATGCAGAAGAACTGCATGAAAAACTAAGTCATGATTTTCCTGATAAAAAGGTTGTACTTCTACATGG GCAAATGCCTGGTGTAAAAAAAGATGAAATCATGTCAGCTTTTGCTAGCGGTGAAATTAATATTTTGGTAACTACTAGTG TAATTGAGGTTGGTGTGGACGTGGCTAATGCTAATATGATGATTATTTATAACGCTGATCGATTTGGGTTGAGTCAGCTG CATCAGTTACGAGGAAGAATCGGACGTGGAGAAACACAGAGTTATTGTGTATTTATTGCGGATCCTAGAACTGATACAGG TAAGGCAAGAATGAAGATTATTTCTGCTACTAATGATGGCTTTAAATTAGCTGAAGAAGATTTAAAAATGCGTGGTGAAG GTGACTTGTTTGGTAAAGCACAATCTGGATTACCTGAATTTCGCGTGGGAGATGTAGTTAACAATTATAATACCTTGGTT GTAGCTCAAAAAATCGCAAGAAAATTAGTTAATGATGATCCAGATTTACTTGATCCCGAACATAAAATACTAAAACAAAT GCTAGAATATAAGCAATTAGAACAAAATAGAATATAG Protein sequence : MINNALFAPVTDLKGVGTKTAADLGSLGIYSIYDLLFYFPFRYDELQTLPLDQIMDGQKVVLKGIVATEPFVSRFGYKKS RLSFKMRIDHEVIMVNFFNQPWLKNKIEIGQEIAIYGKYNVARQSLSAFKFVAAKENDSGMAPIYPVNRHIKQKKLVSLI DLAIEEFLDQVNDIVPEKIRQEYHLLNDREIITKMHHPKNSNDAEIGKRSAIFREFFIFELQLALLTKKDGNQLGYAKKY DLKEVANLTKSLPFELSDDQKHVVNEIFADLHSSNQMRRLLQGDVGSGKTVVAVYAIFAAITAGYQAALMVPTEILATQH FKKIDELLRPFGIRVALLTSNTKTLERREIYRELTDGTINVVIGTHALIQKNVIFKKLGLVIIDEQHRFGVGQRQALINK GDNPDVLAMTATPIPRTLALTVYGDMTLSEIHHLPSGRKPIISSWKTSSQMKDVYKRMHEQLDQGFQIYAVTPLITDSET LDLKNAEELHEKLSHDFPDKKVVLLHGQMPGVKKDEIMSAFASGEINILVTTSVIEVGVDVANANMMIIYNADRFGLSQL HQLRGRIGRGETQSYCVFIADPRTDTGKARMKIISATNDGFKLAEEDLKMRGEGDLFGKAQSGLPEFRVGDVVNNYNTLV VAQKIARKLVNDDPDLLDPEHKILKQMLEYKQLEQNRI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 4e-96 | 41 |
