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Name : treC (LBA1014) Accession : YP_193894.1 Strain : Lactobacillus acidophilus NCFM Genome accession: NC_006814 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose 6-P hydrolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.93 Position : 992021 - 993685 bp Length : 1665 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTAATTTAGGCAAAAAAATAATTTATCAAATTTATCCTAAATCTTTCTATGATTCAAATGGCGATGGGGTAGGAGA TCTTCAAGGAATCATTCAAAAGATTGATTATATTAAGAAGTTAAATGTAGACATGATCTGGTTTAATCCATTTTTTGTTT CACCGCAAAATGATAATGGTTATGATATTGCTGATTATTACAACATTGATCCTCGCTTTGGTACAATGGCTGATTTTGAG AAATTGGTAAAGAAGCTGAAAGAAATCGGTGTGGGTGTAATGCTAGATATGGTGCTCAATCACTGCTCAACTGAAAATAT TTGGTTTAAAAAAGCACTTGCTGGCAATGAAAAGTATCGTAAATTTTTCTACTTGAGAAAAGGAAAAAACGGAGGTTTAC CTAATAATTGGCAAAGTAAATTCGGTGGTACTGCTTGGTCAAAATTTGGTGATACCGATTACTACTACCTTCACTTGTAT GATCCAACTCAAGCAGATCTTGATTGGCATAATCCTGAAGTTCGTAAAGAATTATTTAAAGTGGTTAACTTTTGGCGTAG TAAAGGTGTCCATGGCTTCCGCTTTGATGTAATTAATGTTACGGGTAAAGCGGAAAAACTAGTTGATTCAACAGATCCTG TAGAAGAAAAGAGTTTGTACACTGATACTCCAATTGTTCATAAATACTTAAAAGAGCTTAATGCTGCAACTTTTGGTCAA GACCCTGAATCAATTACTGTGGGAGAAATGTCATCAACGACGATTGCCAACTCAATTGAATATTCAAAACCAAGTGAACA TGAATTATCAATGGTTTTCACTTTCCATCATTTGAAAGTTGACTATCAGGATGGTGAAAAGTGGTCTAAGATGCCATTTG ATTTTATGAAATTAAAGGAATTATTCACTGAATGGCAAGAAAAAATGGATCAAGGTGATGGCTGGAACGCATTATTCTGG GACAATCATGATCAGCCTTGGGCATTAACTAGATTTGGTGATACTGGTAAGTATCGTGGAAAGTCAGCTGAAATGCTTGC CACAGCAACTCATCTTATGCGGGGAACACCATATATTTATATGGGTGAAGAAATTGGTATGATTGATCCTGATTATTCTT CAATGGATGATTACGTAGATGTTGAGGCCAAGAATGCTTTTAAGGCTTTAACTAAAAAAGGTTTGAGTGATAAAGAAGCT TTTGAAATAGTTAAATCAAAAGCTCGTGACAATTCACGTGTACCAATGCATTGGAATAGTGAAAAATATGCAGGTTTTAG TGAACATAAGCCGTGGCTCATACCAACTGATCAAGAAAAAATTAATGTTGAAGAGGAATTAGCACATGGTGAAATTTTTA ATTACTATCAAAAGTTAATTAAGCTGCGTAGAAGCGAAGATTTAATCTCTGATGGTCATATTAAGATGTTCTTGAAAGAT GATCCGCAGGTTTTTGCTTATGAACGCTACTTAAAAGATAGTGATAAAAAGTTATTGGTATTTACTAACTTCTATGGTAA AGAACATAGTGTTAAATTACCCGAAGAATATCAAAACAAAGAATACCAAGTTTTAATTAACAATTATGATACTAAAGATA GCCAATTAACCGATGAAATTATATTGAAGCCATATGAAGCATTAGCTATTAAAATTAAACAATAA Protein sequence : MINLGKKIIYQIYPKSFYDSNGDGVGDLQGIIQKIDYIKKLNVDMIWFNPFFVSPQNDNGYDIADYYNIDPRFGTMADFE KLVKKLKEIGVGVMLDMVLNHCSTENIWFKKALAGNEKYRKFFYLRKGKNGGLPNNWQSKFGGTAWSKFGDTDYYYLHLY DPTQADLDWHNPEVRKELFKVVNFWRSKGVHGFRFDVINVTGKAEKLVDSTDPVEEKSLYTDTPIVHKYLKELNAATFGQ DPESITVGEMSSTTIANSIEYSKPSEHELSMVFTFHHLKVDYQDGEKWSKMPFDFMKLKELFTEWQEKMDQGDGWNALFW DNHDQPWALTRFGDTGKYRGKSAEMLATATHLMRGTPYIYMGEEIGMIDPDYSSMDDYVDVEAKNAFKALTKKGLSDKEA FEIVKSKARDNSRVPMHWNSEKYAGFSEHKPWLIPTDQEKINVEEELAHGEIFNYYQKLIKLRRSEDLISDGHIKMFLKD DPQVFAYERYLKDSDKKLLVFTNFYGKEHSVKLPEEYQNKEYQVLINNYDTKDSQLTDEIILKPYEALAIKIKQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 5e-102 | 41 |
