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Name : PBPRA2406 (PBPRA2406) Accession : YP_130592.1 Strain : Genome accession: NC_006370 Putative virulence/resistance : Resistance Product : AcrB, cation/multidrug efflux pump Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0841 EC number : - Position : 2779283 - 2782351 bp Length : 3069 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAACAAGATATCGCAGCCTATTTTATCAAGAATAAAGTCGTTAGTTGGATGATTACCTTAATCTTCCTGATCGGCGG CACAATGGCTTTCTTCGGGCTAGGAAGATTGGAAGATCCCGCGTTTACGATCAAAGACGCGATGGTGGTAACTGCGTACC CTGGTGCCACACCTCTTCAAGTTGAAGAAGAAGTCACTTATCCAATAGAAAAAGCCATTCAGCAGTTAACCTATGTTGAT GAAGTTAACTCTGTATCCAGCCGAGGTTTATCGCAGATCACCGTGACCATGAAAAATAATTATGGTCCTGATGATTTACC CCAAATTTGGGATGAATTGCGTCGGAAAGTGAATGATATCAGGCCCAACTTACCACCAGGCGTTGCTGATCCCTCAATCA TTGATGATTTCGGTGATGTATATGGCATTATGCTGGCGATAACAGGTGACGGCTATTCGTATAAAGAATTGAATGATTAT GTTGATTATTTCCGCCGAGAAATTGAGTTAGTTGATGGGGTTGGAAAGGTTGCAGTTACGGGGATCCAGCAAGAGCAAGT CTTCATTGAAATATCGATGCAACGTTTGAGCAGCTTGGGTATTTCACCTAAGACAATCTATAGCACCTTGGCAACACAGA ATTTGGTGACCAGTGCGGGTGCAGTAAAAATAGGGACTGAATATATTCGAGTTCACCCTACCGGTGAGTTTAAAGATGTT GATGCCCTTGGTGATTTAATTATTACAGACACAGGTGCTGAAGGGTTAATTTACTTACGTGATGTTGCAACGATTACGCG TGACTTTAAAGAAGTGCCCGATAACCTTATAAGCTATAACGGCAAAGTCGCACTGAATGTGGGTGTATCCTTCATTGAGG GGGTGAACGTTGTAGAAAAAGGTAAGGGCGTTTATCAGCGGTTAAATGAGCTAAAAGAACAACAGCCTGTCGGTATTGAT ATTGGTGTTGTTTACAGCCAACCTGATGAAGTAGACCAATCTGTACGGGGCTTTATTGTTAGCCTTGGTCAAGCGGTTGC GATTGTTATTGTCGTACTGATTTTCTTCATGGGGGTACGTTCAGGTATCCTAATCGGCTTGATCCTGTTGCTTACAGTGT TGGGTACGTTTGTATTCATGAACATAATGGCAATAGATTTACAGCGTATTTCTTTGGGGGCATTGGTTATTGCGCTGGGT ATGCTGGTGGATAACGCTATTGTGGTCGTCGAAGGTATTCTGATTGGAATACAAAAAGGGCGAACAAGGATGCAAGCTGC ATCCGACATTGTTACCCAAACAAAATGGCCGCTATTAGGGGCTACAGTTATTGCTGTTACGGCATTTGCACCGATAGGCT TATCTCAAGACTCTACGGGTGAATATTGTGCAACGCTATTTAGCGTGTTGTTAATATCACTCATGCTTAGCTGGTTTACT GCGATATCGTTGACACCATTTTTTGCTGATATGTTCTTCAAAGGCGTTAAAAGTAGTAGTGATGGTGAAGACAATGATCC TTATAAAGGTCTGGTCTTTGTTTTATATAAGCAATCGCTAGAAAAATGCATGAAGTACGCTTGGACAACTGTGATCGTAT TGATTGTAATGCTAGGTGCAAGCTTGTATGGCTTTACACAATTGAAGCAGTCATTCTTTCCGTCATCAACAACACCTATG TTTATGGTTGATGTATGGTTGCCAGAAGGTACGGATATTCGTTCAACGAACGACAAGTTAAACGAATTGGAAGGGTGGGT TAATCAGCAAGATACTGTTAGCTATGTTTCCTCAAGTGCGGGTAAAGGCTCTCAGCGTTTCATGTTGACCTATTCACCAG AGAAGAGTTACTCGTCGTACGGTGAACTGATTATACGTGTCGATGATTATGATGCAGTGATGCCGATGCTGCGTAAAGTG AGTGCTGAGTTAGATGCTAACCACCCTGATATTGAATACAAACTCAAACGGATTGAATTAGGTCCTTCATCTGGTTCTAA AATTGAAGCGCGTTTAGTGGGCCCAGATCCAACGATTCTTCGTGGTTTAGCCCAGAAATCACTTGATATTATGAGAGCAG ATCCGGGTGCTTTCAACGTACGTCATGACTGGCGTGAACGTACGAAAGTGATTGAACCTATCTTTAATGAAAGCCAAGCA CGTCGTTATGGCATAACTAAAGAAGATGTTGATGATTTATTACAAATGGCATTTTCAGGGTTATCTGTAGGTATCTATCG TGATGGCACAAATTTAATGCCTATTGTTGCGCGTTTACCTGAACAAGAGCGTGTTGATGTAAGTAGCATTGAAGGCATGA AAATTTGGAGCCCAGTGATTCAAGGTTATGTTCCACTGCAACAAGTGATGCTAGGTGTCAATATTCAGTGGGAAGATCCG TTAGTAGTGCGTAAAAACCGTAAGCGTATGCTAACCATTATGGCTGACCCTGATCCACTGGGAGATGAAACGGCTGCGAC GCTGCAAGCTCGAATTCAACCACAAATTGAAGCGTTAGATTTTCCTTCTGGTTATTCATTAGAGTGGGGTGGGGAATATG AATCATCGGCAGATGCCAAAGCATCGTTATTCCAAACAATGCCAATGGGTTATTTGTTCATGTTCTTAATCACTATCTTC TTGTTTAACAAGGTTAAAGAGGCTGTGATTGTATGGGCGACGGTTCCGCTTGCCATTATCGGTGTAACAACAGGGTTACT TGTCTTGAATACGCCGTTTGGTTTTATGGCGTTGCTGGGCTTTTTGAGTCTATCAGGAATGCTCGTTAAAAATGGTATTG TACTGCTAGATCAAATCGAGATTGAAATTAGCAGTGGTAAAGACAAATACCAAGCGGTGGTTGATGCGGCAGTGAGCCGT GTTCGTCCTGTATGTATGGCTGCTATAACAACGGTATTGGGTATGATTCCTCTATTACCTGATGTGTTCTTCAAGCCAAT GGCCGTTACCATCATGTTTGGTCTTGGGTTTGCGACAGTACTCACTCTGATTGTTGTTCCAGTGTTATACCGCATGTTCC ATCATCTCAAAGTACCTGAAGCTCAGTAG Protein sequence : MKQDIAAYFIKNKVVSWMITLIFLIGGTMAFFGLGRLEDPAFTIKDAMVVTAYPGATPLQVEEEVTYPIEKAIQQLTYVD EVNSVSSRGLSQITVTMKNNYGPDDLPQIWDELRRKVNDIRPNLPPGVADPSIIDDFGDVYGIMLAITGDGYSYKELNDY VDYFRREIELVDGVGKVAVTGIQQEQVFIEISMQRLSSLGISPKTIYSTLATQNLVTSAGAVKIGTEYIRVHPTGEFKDV DALGDLIITDTGAEGLIYLRDVATITRDFKEVPDNLISYNGKVALNVGVSFIEGVNVVEKGKGVYQRLNELKEQQPVGID IGVVYSQPDEVDQSVRGFIVSLGQAVAIVIVVLIFFMGVRSGILIGLILLLTVLGTFVFMNIMAIDLQRISLGALVIALG MLVDNAIVVVEGILIGIQKGRTRMQAASDIVTQTKWPLLGATVIAVTAFAPIGLSQDSTGEYCATLFSVLLISLMLSWFT AISLTPFFADMFFKGVKSSSDGEDNDPYKGLVFVLYKQSLEKCMKYAWTTVIVLIVMLGASLYGFTQLKQSFFPSSTTPM FMVDVWLPEGTDIRSTNDKLNELEGWVNQQDTVSYVSSSAGKGSQRFMLTYSPEKSYSSYGELIIRVDDYDAVMPMLRKV SAELDANHPDIEYKLKRIELGPSSGSKIEARLVGPDPTILRGLAQKSLDIMRADPGAFNVRHDWRERTKVIEPIFNESQA RRYGITKEDVDDLLQMAFSGLSVGIYRDGTNLMPIVARLPEQERVDVSSIEGMKIWSPVIQGYVPLQQVMLGVNIQWEDP LVVRKNRKRMLTIMADPDPLGDETAATLQARIQPQIEALDFPSGYSLEWGGEYESSADAKASLFQTMPMGYLFMFLITIF LFNKVKEAVIVWATVPLAIIGVTTGLLVLNTPFGFMALLGFLSLSGMLVKNGIVLLDQIEIEISSGKDKYQAVVDAAVSR VRPVCMAAITTVLGMIPLLPDVFFKPMAVTIMFGLGFATVLTLIVVPVLYRMFHHLKVPEAQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| VC0395_A1355 | YP_001217299.1 | AcrB/AcrD/AcrF family transporter | Not tested | VPI-2 | Protein | 0.0 | 44 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| PBPRA2406 | YP_130592.1 | AcrB, cation/multidrug efflux pump | BAC0519 | Protein | 0.0 | 76 |
| PBPRA2406 | YP_130592.1 | AcrB, cation/multidrug efflux pump | BAC0428 | Protein | 0.0 | 76 |
| PBPRA2406 | YP_130592.1 | AcrB, cation/multidrug efflux pump | BAC0526 | Protein | 0.0 | 58 |
| PBPRA2406 | YP_130592.1 | AcrB, cation/multidrug efflux pump | BAC0425 | Protein | 0.0 | 44 |
