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Name : PBPRA2318 (PBPRA2318) Accession : YP_130505.1 Strain : Genome accession: NC_006370 Putative virulence/resistance : Resistance Product : AcrB/D/F family transporter Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0841 EC number : - Position : 2666739 - 2669843 bp Length : 3105 bp Strand : - Note : - DNA sequence : TTGATGAATATCGCGCATTACAGTATCAAAAACAAAGTCATCAGTTGGATGTTTATTTTACTGATGTTAATTGGTGGTGG AATTTCATTTACGGGATTAGGCCAATTAGAATTTCCTGAATTTACGTTAAAAAACGCCCTTGTTATTACCGCTTACCCAG GGGCTTCACCTGAACAAGTTGAAGAAGAAGTAACACTTCGGTTGGAAGATGCTATTCAGCAGATGCCACAGATAAAGCAC ATTACATCGATCAATAGTGCGGGTTTATCTCAAATTGAAATCGAGATGAAAGAGCAGTATGACGCAAAAGCTTTACCACA GATCTGGGATGAGCTACGCCGTAAGGTGAATGATGCGGTTGCCGATTTACCGCCAGGCGCTGTAATGCCGCAAGTGATTG ATGATTTTTCCGATGTCTACGGTGTTTTAATGAACATCACAGGCGAAGGATATAGCTATCGAGAACTTAAAAATTATGCC AATTACTTACGTCGTGAATTGGTATTAATTGAGGGTGTTAAAAAGGTTTCTGTCGTCGGCGATCCGCAAGAGCAAGTCGT TGTCGAAATTAGCCAACAGAAACTGGCAACATTAGGGCTTGATCAAAATACGATATACAGCCAAATAAAGAATCAAAATG GTGTGTCTAACGCCGGAAAAATTCGAGTAGGTGAAGGGCGAATTCGTATTCACCCTACGGGCGAGTTTATCGATGTTACT GATATGAAACGCTTATTGGTGAGCCCGCCAGGCAGTAAAGATATGGTGTATCTGGGTGATATTGCTAATGTCTATAAAAC GGAAAGTGAAACCCCAAAGCTGATTTACCACAACATGGGCGAGAATGCGCTGTCTTTAGGGATATCCTTTAGCCAAGGTG TTAATGTTGTTGATATCTCGAATGAAATATCAGCAAAGATCACACAGTTTGAATCAGGTTTACCAGTAGGAATGAGCTTG AATACCGTGTATGACCAAGGTGCAATGGTTGATGTGTCTGTTACGGGCTTTTTGATCAATCTTGCTCAGTCTGTGGCAAT TGTGATCGTGGTGCTATTGATATTCATGGGCGTGCGCTCTGGGCTATTAATGGGTGCAGTGCTGTTACTGACTATTTTTG GTACGTTCATTGCGATGAGTGTATTGAATATTCAGCTGCAAATTATCTCATTGGGCGCACTCATTATTGCATTAGGTATG CTGGTCGATAACGCCATTGTGGTTACTGAAGGCATTTTAATCGGTATAAAACGGGGTCAAACCCGTTATGAAGCGGCAGG TCAGGTCGTTAAGCAAACCCAGTGGCCATTATTGGGCGCGACAATTATTGCAATTTTAGCCTTTGCACCGATTGGATTGT CACAAAATGCCACCGGTGAATTCTGTAAATCGTTATTTCAAGTGCTGCTAGTTTCACTGTTTATCAGTTGGGTTACAGCG ATTACCATTACGCCATTATTCTGTAATTTATTATTTAAAGATGGCGACGTTAGCGATACAACTGAAGACTTATATAAAGG CTGGTTCTTTACGGCTTATCGTTCAATGCTTTCGTTAGCCATGCGATTTCGTGTGCTCAGTTTAGGCTTAGTTATTGCGA TGTTGTTTGTAGCGATAGTGGGTATGGGGCATGTGAAAAATGTATTCTTCCCACCATCAAGTACACCTATTTTCTTTGTT GATGTATGGTTGCCAGAAGGCTCAGATATTCGTGCAACAGAAGGTTTTGTACGCGAACTTGAAGAAAAAATCATCGCAAC CGACAAAGAGGTTGGCGTTGGGCTTAAAAATGTCACCTCGGTGATAGGTAAAGGTGCACAACGATTCGTCTTGCCGTATG TGCCAGAAAAAGGCTACGACTCGTATGCGCAGTTAATTATCGAAATGACCGATTTAGAATCGTTGAATGCAGGCGTACCT GAACTCACGAAAGTATTGCGTGATAATTATCCTGAAGCTGAGTTTCGCGTGAAGTTGCTGAGTAATGGCCCATCACCAGC CGCTGCAATTGAAGCGCGATTCTATGGTGAAGATCCTGTTGTTCTGCGTCAGCTTGCTACTCAGGCAGAGCAGATCATGA TTGATGAGCCGACCGCTGAAAATATTCGTCATAATTGGCGTAATCAGGTGAATGTTATTCGTCCACAAGTGAATAATGCT CAAGCCAAAAAAGTGGGTATCAGTAAGCAAGATCTTGATACAGCCATGCTGATTAACTTTAGTGGCATGTCGGTTGGTAC GTACCGTGAACAATCGCATTTATTGCCCATTGTTGCACGTGCACCAGAGCAAGAGCGCCTTGATGCCGATAGTTTATTAA AGCTACAAGTGTGGAGCGCTGAAAATAGTGCGTTTGTACCAGTAACCCAAATTGTATCGTCATTCGATACTGAGTGGGAA AATCCTATTATTATGCGTCGCGATCGCAAACGGGTATTAACCGTATTAGCTGATCCACTTTTAGGCAGTAATGAAACAGC AGATTCAGTGCTAAAGATATTACGCCCTAAAATAGAAGCGATCCCTCTGCCAGCAGGCTATGAACTCGAGTGGGGAGGCG AATATGAAACAGCAGGTGAAGCACAAGCAGGTATTGCTAGCTCTTTACCATTGGGTTATTTAGCGATGTTCTTGATAACT GTTGTACTGTTTAATTCCGTAAGACTCCCGCTGATCATTTGGTTCAATGTGCCTTTGGCGCTTATAGGTATTGCTGCTGG TTTATTGATATTCGATGCACCATTTAGCTTCATGGCGATACTGGGTACATTAAGTTTAAGTGGTATGGTTATCAAAAATG GGATTGTATTGGTTGATCAAATCCAGGTTGAATTGGCTGAGGGTAAAGATCCGTATGATGCAGTATTTGAATCTTCAGTG AGTCGTGTTCGTCCTGTGTGTATGGCGGCCATTACGACAATGCTTGGCATGATCCCGTTATTGTTTGACCCATTTTTCAA ATCGATGGCAGTGACAATTATATTTGGTTTAGGTTTCGCTACATTACTTACATTGATTGTGTTACCCGTTAGCTATGTTG TTATTTTCCGAATACCTAACAAGCAAAAAGAATCAATGAAGAATGCAACACTGGTGACAGTGTAA Protein sequence : MMNIAHYSIKNKVISWMFILLMLIGGGISFTGLGQLEFPEFTLKNALVITAYPGASPEQVEEEVTLRLEDAIQQMPQIKH ITSINSAGLSQIEIEMKEQYDAKALPQIWDELRRKVNDAVADLPPGAVMPQVIDDFSDVYGVLMNITGEGYSYRELKNYA NYLRRELVLIEGVKKVSVVGDPQEQVVVEISQQKLATLGLDQNTIYSQIKNQNGVSNAGKIRVGEGRIRIHPTGEFIDVT DMKRLLVSPPGSKDMVYLGDIANVYKTESETPKLIYHNMGENALSLGISFSQGVNVVDISNEISAKITQFESGLPVGMSL NTVYDQGAMVDVSVTGFLINLAQSVAIVIVVLLIFMGVRSGLLMGAVLLLTIFGTFIAMSVLNIQLQIISLGALIIALGM LVDNAIVVTEGILIGIKRGQTRYEAAGQVVKQTQWPLLGATIIAILAFAPIGLSQNATGEFCKSLFQVLLVSLFISWVTA ITITPLFCNLLFKDGDVSDTTEDLYKGWFFTAYRSMLSLAMRFRVLSLGLVIAMLFVAIVGMGHVKNVFFPPSSTPIFFV DVWLPEGSDIRATEGFVRELEEKIIATDKEVGVGLKNVTSVIGKGAQRFVLPYVPEKGYDSYAQLIIEMTDLESLNAGVP ELTKVLRDNYPEAEFRVKLLSNGPSPAAAIEARFYGEDPVVLRQLATQAEQIMIDEPTAENIRHNWRNQVNVIRPQVNNA QAKKVGISKQDLDTAMLINFSGMSVGTYREQSHLLPIVARAPEQERLDADSLLKLQVWSAENSAFVPVTQIVSSFDTEWE NPIIMRRDRKRVLTVLADPLLGSNETADSVLKILRPKIEAIPLPAGYELEWGGEYETAGEAQAGIASSLPLGYLAMFLIT VVLFNSVRLPLIIWFNVPLALIGIAAGLLIFDAPFSFMAILGTLSLSGMVIKNGIVLVDQIQVELAEGKDPYDAVFESSV SRVRPVCMAAITTMLGMIPLLFDPFFKSMAVTIIFGLGFATLLTLIVLPVSYVVIFRIPNKQKESMKNATLVTV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| VC0395_A1355 | YP_001217299.1 | AcrB/AcrD/AcrF family transporter | Not tested | VPI-2 | Protein | 0.0 | 43 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| PBPRA2318 | YP_130505.1 | AcrB/D/F family transporter | BAC0519 | Protein | 0.0 | 53 |
| PBPRA2318 | YP_130505.1 | AcrB/D/F family transporter | BAC0428 | Protein | 0.0 | 53 |
| PBPRA2318 | YP_130505.1 | AcrB/D/F family transporter | BAC0526 | Protein | 0.0 | 51 |
| PBPRA2318 | YP_130505.1 | AcrB/D/F family transporter | BAC0425 | Protein | 0.0 | 43 |
