Name : PBPRA1225 (PBPRA1225) Accession : YP_129438.1 Strain : Genome accession: NC_006370 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 1380685 - 1382367 bp Length : 1683 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATGACAGAGCATAATGAATGGTGGCGTACAGCGACCATTTATCAGATTTATCCTAAAAGTTTTTGTGACAGTGGATG TCAGGGCACGGGCGATATTAAAGGGATTATTTCAAAGCTCGGTTATCTCCAAAAGTTAGGTATTGATGCGATTTGGTTAA CCCCGATTTATTGTTCACCGATGATCGATAATGGCTACGATATATCTGATTACTATAATGTGAATCCAGATTTTGGCACT ATGAACGATTTCGACCTGCTATTAGATGAAGCGCATCAAAAAGGTATCCGTATTGTTATGGATATTGTGGTTAATCATAC CTCGACTGAACATGCATGGTTTAAATCGGCACTAGGTAATAAGCAAAGCCCATATCGTGATTATTATATTTGGAAAGATC CGGTTGATGGCGCAGAGCCAACGAATTGGGCATCTAAGTTTGGTGGCAATGCGTGGGCATTAGACGAAGCAACCAATCAG TATTACCTGCACCTTTTTGCTAAAGAACAAGCCGATTTGAATTGGGAAAACCCAAAAGTTCGGGATGAAGTGAAAGAGGT CATTAGCTTCTGGGCTGAAAAAGGGGTCGATGGTTTTCGTTTAGATGTGATTAATTTAATCTCTAAACAACAAGATTTCC CAAATGATCACATCGGTGATGGGCGTTGTTTCTATACTGATGGCCCACATGTACATGAGTATCTTAGAGATATCAGTGAA AGCGTTTTTCAAAAATACGGTTCAGTAACTGTGGGTGAAATGTCATCGACAACCTTGGAACACTGTCAGCAGTATTCAGC GAATGACGGTAAAGAGTTGTCTATGGTGTTTAATTTTCACCATCTAAAAGCTGATTATGAAAATGGTGAAAAGTGGACCA AAGCACCGTTTGATTTTCTGCAACTTAAGCAGATTTTTAACCATTGGCAACAAGGCTTAAACGGCAAAGGGTGGGGCGCT TTATTCTGGTGTAACCATGACCAACCTCGTGTAGTCAGCCGTTTAGGGGATGATCAGCAATACCGAGTTGAGTCAGCCAA AATGCTCGCGACGTCTATTCATATGATGCAGGGTACGCCGTATATTTATCAAGGTGAAGAAATTGGCATGACCAACCCAG CTTATACCTCGATAGAACAATACCGCGATGTGGAAAGTACCAATATGTACGACATTATGGTAAATCAACAAGGTGTAAGT GAAGCGGATATGCTCGCTATTTTGGCGCAAAAATCCCGCGATAACGCCCGTACCCCGATGCAATGGGATGCTACCGAGCA AGCTGGATTTACTCAAGGAAAGCCTTGGCTAGCTGTTGCAGAAAACTATCACGAGATAAACGCGCAGCAAGCCGTTGAAG ATCCCAACTCTGTATTCTATTTCTACCGTAAGTTGATTGAATTACGTAAAGAGATTGCAGTGATCACAACGGGAGATTAC AGCGATTTAATGCCAGATAACATGCAGCTGTTTTGTTATCGCCGAGAGTCAGAACAACAACTGCTTGTCTGTATTAACAA TTATTATGGTACTGATATTGAGTGCGATCTACCGTCTGATATTGATACTACTCAGGGGCGTTATATTTTAGGTAACTATG AAGGTTATCAAGATCGAACAGCAAGCCAAACGGTACGACTAAAACCATATGAATGTTTGGTGCTATTAATTGATAAAGTG TAA Protein sequence : MMTEHNEWWRTATIYQIYPKSFCDSGCQGTGDIKGIISKLGYLQKLGIDAIWLTPIYCSPMIDNGYDISDYYNVNPDFGT MNDFDLLLDEAHQKGIRIVMDIVVNHTSTEHAWFKSALGNKQSPYRDYYIWKDPVDGAEPTNWASKFGGNAWALDEATNQ YYLHLFAKEQADLNWENPKVRDEVKEVISFWAEKGVDGFRLDVINLISKQQDFPNDHIGDGRCFYTDGPHVHEYLRDISE SVFQKYGSVTVGEMSSTTLEHCQQYSANDGKELSMVFNFHHLKADYENGEKWTKAPFDFLQLKQIFNHWQQGLNGKGWGA LFWCNHDQPRVVSRLGDDQQYRVESAKMLATSIHMMQGTPYIYQGEEIGMTNPAYTSIEQYRDVESTNMYDIMVNQQGVS EADMLAILAQKSRDNARTPMQWDATEQAGFTQGKPWLAVAENYHEINAQQAVEDPNSVFYFYRKLIELRKEIAVITTGDY SDLMPDNMQLFCYRRESEQQLLVCINNYYGTDIECDLPSDIDTTQGRYILGNYEGYQDRTASQTVRLKPYECLVLLIDKV |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 1e-134 | 47 |