Name : nrdE (mhp158) Accession : YP_115672.1 Strain : Mycoplasma hyopneumoniae 232 Genome accession: NC_006360 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 188455 - 190617 bp Length : 2163 bp Strand : + Note : Catalyzes the rate-limiting step in dNTP synthesis DNA sequence : ATGAAAAAAATGGGTTTGGATCTGAATTTTGATAAAAATCAGGAAAAAAGTTATCTTAGCTTAAATGCGAATAGCAAAAT TTTTACAAATCATCCTGATTCACATAAATTTGATTTATTAGCAGCAGAAAAATATATTAATGAAGAAATTAATCCAAAAT TTAAATTTTTCAATTCTTTTAAAGAAAGAATTGAATTTTTAGTTCAAAATAATTATTATGATCCGAAAGTTTTAGGACAA TATTCATTCCAAGAACTTGAGAAATTAAATACAAAAGCTTGAAGTTATAATCATTTTTTTTCTTCTTTTATGGGGGCTTT TAAATTTTATTCAACTTATGGACTAAAATCAAATGATAATTTAGTATATTTTGAGCATTTTCCCGATCGGGTTTTACTAA ATAGTTTATTTTTAGGAAAAGGAGATTTTCAAAAAGCTGAAAAAATTCTTGAACAAATTATGTTAGGTCGATTTCAACCC GCAACCCCGACATTTTTAAATGCCGGAAAATTAAACAGAGGTGAATTTGTCTCTTGTTATTTGATCCGAGTTGAAGATAA TATGGAATCAATCTCCAGGGCAATTACTACTTCACTCCAACTTTCAAAACGTGGCGGTGGTGTTAGTGTTTTACTTTCAA ATTTGCGCGAACAAGGTGCCCCGATTAAAAACATTGAAAATCAAGCAACTGGTGTAATTCCGGTAATGAAAATTCTTGAA GATTCATTTTCTTATGCCAACCAGTTAGGGCAACGTCAAGGTGCTGGGGCTGTTTATTTAAATGTCCACCATCCGGATAT TCTGGCTTTTTTAGATACCAAAAGGGAAAATGCTGATGAAAAAATCAGGATAAAATCGCTTTCTCTTGGGATAATAATTC CGAATATTACTTTTGAATTAGCAAAAAATAATGAAAAAATGGCGCTTTTTTCTGTCTATGATGTTGAAAAAGTATATCAA AAAGCTTTTAGTGATATTTCTATTAGTGAAAAATATTATCAAATGCTAGCAAATCCAGAAATTAAAAAAACATTTATTTC GGCAAGAAAGTTATTTAAAATTATTGCCGAGCTACATTTTGAAAGTGGTTATCCTTATATTTTATTTGAAGATATTGTCA ATAAAGAAAATGCTCATCCTGATCGCGTTGTAATGTCAAATTTATGTAGCGAAATCACACAGCCTTCAACTCCAAGCACA TTTTTACCCGATCTAAGTTTTAAAGAAATAGGCAAGGATATTTGTTGTAATTTAGGATCGCTAAATATTGATAAAGCGAT GGAATCAGGCCCTGATTTTGAACAAATGGTTTATTATTCAGTGTTAGCTCTTGATGTTGTCTCGCGAAATTCTGATCTTT CAGTAGCCCCTTCAATTCAAAAAGGAAATAATTTAAATCATGCAATTGGTCTTGGGGCGATGAATTTACACGGGTTTTTG GCTAAAAATGAAATTTTTTATGACTCAGAGGAAGCGCTTGATTTTACTAACATTTTTTTCTATACTTTAGCTTTTTCAGC TTTTAAAGCCTCTGAAAAACTTGCAAAAAAATATGGTCCTTTTTCTGGATTTGAAAAAACCAAATTTGCATCAGGAGAAT ATTTTGATAAATATACAAAAGTTTCCCCGAATACTTTTTTACCAAAAACACATAAAATTAAAGAACTTTTTGCAAAATAT CAAGTTGAAATTCCGACTCAAGAAGATTGAATTCATCTTGTTGAAAAAATTAAAAAAACAGGAATTGCCAACTCGCATCT AATGGCGATTGCTCCTACAGGCTCAATTTCCTATCTTAGTTCCTGCACGCCTTCGCTTCAGCCAGTTGTTGCCCCAGTTG AGATAAGAAAAGAAGGAAAATTAGGTAGAATTTATGTTCCTTCATATAAATTAAGTCCTAAAACATACAAATTTTATCAA AACGGAGCTTATGAATTAGGTCCAATTCCGATTATAAACATTGTCTCAGAAGCACAAAAACATGTTGATCAAGCAATCTC GATGACCTTATTTATGACCGACAAGGCGACTACTCGAGACTTAAATCGAGCTTATATTTATGCTTTTAAAAAAAATTGTA AGTCAATTTACTATGTAAGAATTCGTCAAGATGTCCTTGAGGATTCAGAAAATTATGAAACTTGTCAATCTTGCCAGATT TAA Protein sequence : MKKMGLDLNFDKNQEKSYLSLNANSKIFTNHPDSHKFDLLAAEKYINEEINPKFKFFNSFKERIEFLVQNNYYDPKVLGQ YSFQELEKLNTKAWSYNHFFSSFMGAFKFYSTYGLKSNDNLVYFEHFPDRVLLNSLFLGKGDFQKAEKILEQIMLGRFQP ATPTFLNAGKLNRGEFVSCYLIRVEDNMESISRAITTSLQLSKRGGGVSVLLSNLREQGAPIKNIENQATGVIPVMKILE DSFSYANQLGQRQGAGAVYLNVHHPDILAFLDTKRENADEKIRIKSLSLGIIIPNITFELAKNNEKMALFSVYDVEKVYQ KAFSDISISEKYYQMLANPEIKKTFISARKLFKIIAELHFESGYPYILFEDIVNKENAHPDRVVMSNLCSEITQPSTPST FLPDLSFKEIGKDICCNLGSLNIDKAMESGPDFEQMVYYSVLALDVVSRNSDLSVAPSIQKGNNLNHAIGLGAMNLHGFL AKNEIFYDSEEALDFTNIFFYTLAFSAFKASEKLAKKYGPFSGFEKTKFASGEYFDKYTKVSPNTFLPKTHKIKELFAKY QVEIPTQEDWIHLVEKIKKTGIANSHLMAIAPTGSISYLSSCTPSLQPVVAPVEIRKEGKLGRIYVPSYKLSPKTYKFYQ NGAYELGPIPIINIVSEAQKHVDQAISMTLFMTDKATTRDLNRAYIYAFKKNCKSIYYVRIRQDVLEDSENYETCQSCQI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 1e-178 | 53 |