Name : recG (RT0582) Accession : YP_067529.1 Strain : Rickettsia typhi Wilmington Genome accession: NC_006142 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 750897 - 753008 bp Length : 2112 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATATTAGCTACTTTAGAACAATTCTTATTTGCTCCTGTAAAAGCATTTATCAATATACGTGAAGATACAGTATCTGC TTTTAAAAGGCTTGGTATTAACAATATTCGTGATTTATTATTTTATCTACCTGTTTCATATCAAAATAAAATATTATCAC CTAATTTAACTGAAGTTAGAGGTGGTGAAATAATACAAACAGAAATTATAGTTAATAGTATTAATTTACAAAAAAAAGGT AATCAGCCTTTAAAGATTACAGCTAGTAATAATACAGGTTCTATATTATTAGTGTTCTTTCATAAGCCACCACAGTTTAT TTTAAATAAGCTGAAAGTTGGAACGAAGCATATTATTAGTGGAAAAGTACAATTCTTTAATTATCAATTACAAATTTTGC ATCCTGAATTTATTACGAATCCTAAACTTTCAAAAGCTATAGAACCACTTTATTCGATTACATATTCACTTAGTAACAAG CAGTTATATTCATATATAATAAAAGCAATAGAAATATTTGAAGAAAAGTGTAAGGGTATAGAAGATAAAGAAGTACATGA ATATTTGGATGTTATATTGCAGAATTTGAAGATTTTGCATGTTTTTTTCTCACCACATAACTTGATCTCATGGTCTAGCA CAATGGATATCGTTGTTAATCCGCGTTATGCCACTGTGGCTGCCAAAAAACAACTAGCCATTAAAGAATTAATCGCTAAT CAAATATCTCTTTTAAATGTACGTATGCAAATAAATAGAAAACAAGGTAATATTTACCCTAAAGCTACATCTATTCAAGA CAATATATTAAGAGAGTTAGGATTTGAGTTAACCTATTATCAAAAGCAAGTGATAGAAGAAATCGAGTCTGAGCAAAGCG ATAAAGTAGAGATGATGAGATTGTTACAAGGCGATGTTGGCTCTGGTAAAACTTTGGTAGCTTTACTCACGATGGTAAAT GTTGTCACCACTGGACTTCAAGCAACACTTATGGCTCCAACCGATTTACTTGCAAATCAGCATTATGATTTTTTTGTTAA AGCTTTAAAAAATACTAATATCAAGGTTGGATTACTTACAGGTAAGATACTTGGCAAAGCTCGTAAAAATATTATTATTC AACTTGTAAACGGTAAGATTGATATATTAATTGGTACTCATGCGTTATTTCAAGAAAAAGTCAGTTTTAAAAAACTAGGT TATATAGTTATCGATGAGCAGCATAGATTTGGAGTGCAGCAACGTTTGAATCTAATAAATAAAGGAGTTAATCCTGATGT TTTAATTATGACTGCAACACCAATTCCAAGAAGTTTAGCACTCACTATGTTTGGTGATATGACTATTTCCAAGCTAATGG GAAAACCAAAAGATCGTTTATCTATTGTTACAAAGACTATGTCGATTAATAAGATAGGATATATTATAGAAGCAATAAAT AAGCGGCTTATTGCAGGTGAAAGGGTATATTGGATATGCCCGTTGATAACGCAAAGAGAGAAAGAAGCGCTGCAAGAAGA TCATTTATTAATGGATGTGATAAATCGTTTTAACTCTATCGAAAATGTATATCAAGGTTATACTGGTATTATTCATGGTA AAATGGCAAATGATCAGAAAGAGCGAATAATGAAGCAGTTTAAGGAAGGTAAAATTAAGATATTAGTTGCAACAAACGTT ATTGAAGTTGGAATAGACGTATCTGAGGCTACTTTAATTGTTATTGAAAATGCTGAGCAATTTGGTTTAGCGCAACTTCA TCAGCTGAGAGGTAGAGTAGGGCGATGTAGTTTGCAGTCATATTGTATATTATTATACAATCCAAAAAGGCTTGGAAAAG TGGCACAAAACAGGTTTAAGATAATGAAACACACTAATGATGGATTTTATATTGCTGAGCAGGATTTAAAACTACGTGGT AGTGGTGAGATTTTAGGTATAAAACAAAGTGGCGAAATCGACTTTTTCTTTGCAGATTTAAAAGACGATTATGAACTACT CATAAAAGCGCATAAAGTTGCAGAAAGAGCAATATGCACAAAAGATAATGTGAATTTTATTAACTTTCAGATTAAACTCT TCGCAAAATCGCAAGTAAGTTATTTGATTTAA Protein sequence : MILATLEQFLFAPVKAFINIREDTVSAFKRLGINNIRDLLFYLPVSYQNKILSPNLTEVRGGEIIQTEIIVNSINLQKKG NQPLKITASNNTGSILLVFFHKPPQFILNKLKVGTKHIISGKVQFFNYQLQILHPEFITNPKLSKAIEPLYSITYSLSNK QLYSYIIKAIEIFEEKCKGIEDKEVHEYLDVILQNLKILHVFFSPHNLISWSSTMDIVVNPRYATVAAKKQLAIKELIAN QISLLNVRMQINRKQGNIYPKATSIQDNILRELGFELTYYQKQVIEEIESEQSDKVEMMRLLQGDVGSGKTLVALLTMVN VVTTGLQATLMAPTDLLANQHYDFFVKALKNTNIKVGLLTGKILGKARKNIIIQLVNGKIDILIGTHALFQEKVSFKKLG YIVIDEQHRFGVQQRLNLINKGVNPDVLIMTATPIPRSLALTMFGDMTISKLMGKPKDRLSIVTKTMSINKIGYIIEAIN KRLIAGERVYWICPLITQREKEALQEDHLLMDVINRFNSIENVYQGYTGIIHGKMANDQKERIMKQFKEGKIKILVATNV IEVGIDVSEATLIVIENAEQFGLAQLHQLRGRVGRCSLQSYCILLYNPKRLGKVAQNRFKIMKHTNDGFYIAEQDLKLRG SGEILGIKQSGEIDFFFADLKDDYELLIKAHKVAERAICTKDNVNFINFQIKLFAKSQVSYLI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 2e-108 | 42 |