Name : cyoB (pc1190) Accession : YP_008189.1 Strain : Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 Genome accession: NC_005861 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome o ubiquinol oxidase chain I cyoB Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 1418523 - 1420484 bp Length : 1962 bp Strand : + Note : strongly similar to cytochrome o ubiquinol oxidase chain I cyoB DNA sequence : ATGTTTGGTAAACTTACTTTAGAATCTTTTAAACATGAATCCAGTCAAAATTTTGCTGTAGTGATGATGCTTATTAGCGG TATCGCTTTGATTGGCCTGATTTTTTATCTTAAAAGATGGAAATGGCTTTGGAATGAATGGATCACGACAGTTGATCCCA AACGCATCGGAATTATGTATATTATTGTTGTATTGATCATGTTTTTTAAAGGATTTACAGATGCTTTAATGATTAGATTG CAACAAGCCTTATCTGTCGGAGAATCTCAAGGGTTTATTTCTTCTACACATTTTCAAGAAGTTTTTTCTGCCCATGGAAC AACAATGATCTTTTTTGTAGCCATGGGAGCAGTCTTTGGGCTTTTAAATTTAATTATTCCTTTGCAAATCGGCGCTAGAG ACGTTGCTTTCCCCTTCTTAAATGCGGTTAGCTTTTGGCTTTTTACAGCCGGGGCAATGCTAACACTCATTTCACTTGCC ATTGGTCAATTTTCAATAGCCGGATGGTTAGCCTATCCTCCTCTTTCGGCTCTAGAATACAGTCCCGGCGAAGGAGTTGA TTACTGGATTTGGATGTTACAAATTTCAGGAATCGGAAGCACACTTTCCGGGATTAACTTTCTTGTAACCATCCTAAAAA TGCGCTGTCCTGGAATGACTTTAATGAAGATGCCTATCTTTGTTTGGAGTAGTTTGTGCTCAATGGTTTTAATCATCTTT GCCTTCCCAATTCTAACTGCAACTTTATTTATGTTTTCGCTAGATCGTTACCTAGACATGCACTTTTTTACGACTGGTGG TGGAGGAAACCCGATGATGTATGTGAACTTGATTTGGGCATGGGGGCATCCGGAGGTCTATATTCTGATTTTACCCATTT TTGGAGTTTTCTCTGAAATTGTTCCCACTTTTTCAGAAAAAAGGTTATTTGGGTATGTCTCTATGGTTTGGGCTCTCGTT TTAATTGCTTTTTTCTCTTTTGTCGTTTGGGTCCACCATTTCTTTACAATGGGAGCTAGCCCACATGTCAATGCCCTTTT CGGGATTTTGACGATGATTATCGCTATTCCAACAGGTGTTAAAATCTTTAATTGGCTCTTCACAAAATTTCGAGGGCGGG TTCATTTTACCTCTCCCATGCTTTGGTTCTTCGCTTTCTTGTTAAATTTTACAATTGCTGGAATGACAGGTATTTTACTA GCTTCCCCTCCCGTTGATTACCAAGTTCATAATAGTTTATTTTTAATTGCCCATTTTCATGGAATGGTAATTGGCGGTGT TCTATTTGGATTTTTTGCGGGATTTACTTATTGGTTTCCTAAGTTTACGGGTTTTATGTTGGATGAAAAACTAAATAGAT ATGCTTTTTGGTGTTGGCTAAGTGGATTTTTGCTAGCCTTTATGCCTCTTTATATGCTTGGTTTCATGGGGGCGACAAGA CGATTAGACCACTATGACGTTTCGACAGGATGGCACCCTCTCTTCTTGATTGTTGCTTTTGGAGCTTTTATCATAGCATG TGGAGCATTTATTCAATTTTTTGGATTATTTTGGAGTATTAAAAATCGCAAAAAGAATTGGGATAGTACAGGTGGCGATC CATGGAATGGAAGAACTCTAGAATGGTCTATTCCTTCTCCTGTTCCCATTTATAATTTTGCCATTATTCCAACAGTCGAT CAAATCGACCCTTTTTGGGCAATTAAGCGAGGTGTCGCACCCGAACAGAAAAAAAATTATGAAGATATTTATTTACCTAA AAATACCCCTATGGCTTTTTATATAGGGACTTTAAGTTTGATTTTCGGATTTGCAATGACATGGCATATTTGGTGGCTTG CTTTAGGAAGTTTTGTCGGAATTCTAGCTTGTCTGATTGTTCGATTATCTCACGATGATCCTCATGAAGTCATTACTGTT GCTGAAATCAAAAAAATAGAAGCTTCCTATTCAAAGAGGTAA Protein sequence : MFGKLTLESFKHESSQNFAVVMMLISGIALIGLIFYLKRWKWLWNEWITTVDPKRIGIMYIIVVLIMFFKGFTDALMIRL QQALSVGESQGFISSTHFQEVFSAHGTTMIFFVAMGAVFGLLNLIIPLQIGARDVAFPFLNAVSFWLFTAGAMLTLISLA IGQFSIAGWLAYPPLSALEYSPGEGVDYWIWMLQISGIGSTLSGINFLVTILKMRCPGMTLMKMPIFVWSSLCSMVLIIF AFPILTATLFMFSLDRYLDMHFFTTGGGGNPMMYVNLIWAWGHPEVYILILPIFGVFSEIVPTFSEKRLFGYVSMVWALV LIAFFSFVVWVHHFFTMGASPHVNALFGILTMIIAIPTGVKIFNWLFTKFRGRVHFTSPMLWFFAFLLNFTIAGMTGILL ASPPVDYQVHNSLFLIAHFHGMVIGGVLFGFFAGFTYWFPKFTGFMLDEKLNRYAFWCWLSGFLLAFMPLYMLGFMGATR RLDHYDVSTGWHPLFLIVAFGAFIIACGAFIQFFGLFWSIKNRKKNWDSTGGDPWNGRTLEWSIPSPVPIYNFAIIPTVD QIDPFWAIKRGVAPEQKKNYEDIYLPKNTPMAFYIGTLSLIFGFAMTWHIWWLALGSFVGILACLIVRLSHDDPHEVITV AEIKKIEASYSKR |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 8e-66 | 41 |