|
Name : nrdE (MSC_0853) Accession : NP_975823.1 Strain : Mycoplasma mycoides PG1 Genome accession: NC_005364 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 969187 - 971358 bp Length : 2172 bp Strand : - Note : Catalyzes the rate-limiting step in dNTP synthesis DNA sequence : ATGGTAATAATGAACGAAAATAAAAACACAATCGTTTTAGATGATGTTGATGATGAATATATTAAATTAAATGCTAGATC TAAGATTTTTTTAAAAGATCAAGACAATTTCCAATTAGATGTTAAAGCAGCTGAATTATATTTAAAAAATTATATTGAAC CTAGAATGAAAAAGTTTTCTAGTTTAAAAGAAAGACTAGATTACTTATTAGAAAATCAGTATTATGATTCAGAAATCTTA AATAAATATAGTTTTGATCAAATTAGTCAATTAAATCATTATGCTTATTCATTTAACCATCATTTTCCAAGTTTTATGGG AGCTTTAAAATTCTTTAATGCTTATGGATTAAAAACTTTTGATACTACAATGTATTTAGAAACTTATACAGATAGAGTAT TGATGAATGCTCTATTTTTAGGTAATGGTAATTTTAATAAAGCAAAAGACTTATTAAAAGATATGATGTTAGGTAGATTT CAACCAGCAACTCCTACTTTTTTAAATGCAGCTAAAAAGCATAGAGGAGAGTATGTTTCTTGTTATTTATTAAGAACTGA AGATAACATGGAATCAATTTGTAGAACAATTTCAACTTCACTACAACTTTCAAAAAGAGGTGGAGGAGTTGCAATTTGTT TAACTAATTTACGTGAAACAGGTTCTCCTATTAAAAATATTTCAGGTCTAAGTTCAGGTCCAATTCCAGTTATGAAGATT TTAGAAGATTCATTTACTTATGCTGATCAATTAGGCCAACGTCAAGGAGCTGGAGCTGTTTATATTTCAGCACATCATCC AGATATTATTTCAGTTTTAGATACTAAAAGAGAAAATGCTGATGAAAAGATTAGGATTAAATCTTTATCATTAGGATTAG TAATTCCAGATATTACTTTTGAATTAGCTAGAGATAATAAAGATATGGCTTTATTTAGCCCTTATGATGTTCAAAAGACA TATGGTAAGCCATTATCAGATATTTCAATTACTGAAAAATATTATGAAATGTTAGAAAATCCTAATATTAAAAAAACATA TATTAGTGCTAGAAAATTCTTTTTAACTGTTGCTGAACTACATTTTGAAAGTGGATATCCATATATTTTATTTGAAGACA CTGTTAATAGAAGAAATGCTCATGATAAAAAGGGAAGAATTATTATGAGTAATTTATGTAGTGAAATTGTTCAAGTAAGT ACAGCAAGTGAATATAATTCTGATTTATCATTTATAAAAACTGGAGAAGATATTTGTTGTAATTTAGGTAGTTTAAATAT TGATAAAATGATGAAATCAGGAAAAGAATTTTCAGATTCTATTTATAATGCAATTTCTGCTTTAGATATAGTTTCAAGAA ATTCAGATTTAAGTGCATCTCCTTCAATTCAAAAAGGAAATGCTTTAAATCATGCCGTTGGATTGGGAGCTATGAATCTA CATGGATTTTTAGCAATTAATAAAATTATGTATGATTCACCTGAAGCTGTTGATTTTACTAATATGTTCTTTTATACAGT TGCTTATAATGCTTTTAAAGCTTCAAATAAATTAGCTCAAGAATTTGAAAAATTTGCTTCATTTGATCAATCAAGATTTG CTGATGGTTCTTGATTTGATAAATATACTAAGTGTGAATTTGATAAATGAACACCACAAACAAATAGAGTAAAAGAATTA TTTAAAGATTATGATGTTCAAATTCCAAGTCAAGCTGACTGAATTCAATTAGTTGAAGAAATTAAAAAAACAGGTTTAGC AAATTCACATTTAATGGCAGTTGCTCCATCTGGATCAATTAGTTATTTATCATCATGTACTCCTTCACTACAACCAGTAG TTTCAACTGTTGAAGTTAGAAAAGAAGGAAAATTAGGAAGAGTTTATGTTCCAGCATATCAAATTAATTTTGATAATATG GGATATTATGCAATGGGTGCTTATGAATTAGGACCAGATCCAATTATTAATATTGTTGCAGCAGCTCAGCAACATGTTGA TCAAGCAATTTCACTAACTTTATTTATGACTGATAAAGCAACAACTAGAGATTTAAACAAAGCATATGTTAATGCCTTTA AACAAGGTTGTTCTTCAATTTATTATGTAAGAATTCGTCAAGATGTTTTAGAAGATAGTGAAAACTACGAATGTGATGCA TGTAAAATTTAA Protein sequence : MVIMNENKNTIVLDDVDDEYIKLNARSKIFLKDQDNFQLDVKAAELYLKNYIEPRMKKFSSLKERLDYLLENQYYDSEIL NKYSFDQISQLNHYAYSFNHHFPSFMGALKFFNAYGLKTFDTTMYLETYTDRVLMNALFLGNGNFNKAKDLLKDMMLGRF QPATPTFLNAAKKHRGEYVSCYLLRTEDNMESICRTISTSLQLSKRGGGVAICLTNLRETGSPIKNISGLSSGPIPVMKI LEDSFTYADQLGQRQGAGAVYISAHHPDIISVLDTKRENADEKIRIKSLSLGLVIPDITFELARDNKDMALFSPYDVQKT YGKPLSDISITEKYYEMLENPNIKKTYISARKFFLTVAELHFESGYPYILFEDTVNRRNAHDKKGRIIMSNLCSEIVQVS TASEYNSDLSFIKTGEDICCNLGSLNIDKMMKSGKEFSDSIYNAISALDIVSRNSDLSASPSIQKGNALNHAVGLGAMNL HGFLAINKIMYDSPEAVDFTNMFFYTVAYNAFKASNKLAQEFEKFASFDQSRFADGSWFDKYTKCEFDKWTPQTNRVKEL FKDYDVQIPSQADWIQLVEEIKKTGLANSHLMAVAPSGSISYLSSCTPSLQPVVSTVEVRKEGKLGRVYVPAYQINFDNM GYYAMGAYELGPDPIINIVAAAQQHVDQAISLTLFMTDKATTRDLNKAYVNAFKQGCSSIYYVRIRQDVLEDSENYECDA CKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 4e-177 | 54 |
