|
Name : deoA (MSC_0830) Accession : NP_975803.1 Strain : Mycoplasma mycoides PG1 Genome accession: NC_005364 Putative virulence/resistance : Unknown Product : thymidine phosphorylase Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0213 EC number : 2.4.2.4 Position : 943686 - 944999 bp Length : 1314 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTTACATTTGCAGATATAATAGAAAAAAAGAAACATAATATAGAATTAACTGAACAAGAAATCTCTTGATTAATTAA TAGTTATACAAAGGGAGAAATCACTGATTATCAAATGGCTAGTTTTTGTATGGCTACTTATTTTACAGATATGACAGCTA GAGAAACTGCTTATTTAACTAAAGCTTATATTGAATCTGGAGATAGATATGATTTATCTAAAGTTAGTGGTTTTAAAGCA GATAAGCACTCAACTGGAGGAGTTGGAGATAAAACTAGTTTAGTTTATGCACCACTAGTTGCAAGTTATGGAATTAAAGT ATGTAAATTGTCTGGAAGAGGTTTAGGAAAAACTGGTGGAACTATTGATAAATTAGAATCATTTCCAGGATGAAAATGTG AAGTTACAAATGATGAATTTGTAGATGTAATTAATAAAACAAATATGAGTATTATTGCTCAATCAGATAATATTGTTCCA GCTGATAAAAAAATTTATGCTTTAAGAGATGTAACAGGAACTATTGGTTCAATGCCATTAATTGTTGCTTCAATTATGAG TAAAAAAATGATTGTTGAAAATGATGGTTTAATATTAGATGTTAAAACTGGTAATGGTGCATTTATGACAACAATTGAAG ATGCTAAAGATTTAGCTAATCGTATGATTGAAGTTGGAAAGCAATATAATAGAAAAGTAGCTGTAGTTTTAACTAATATG GAAAAACCATTAGGTAGAGCTATGGGAAACGCTTTAGAAGTTAAAGAAGCTTGAGAAACTTTAAATGGTAATGGACCTAG TGATTTTAATGAACTAATTGCAACTCTAGTTGGAATTACTTTATTACAAGCTAAAGTATTTACTGATTTAAATGAAGCTA AACAAGATGTTTTAAAGAAATTAAAATCAAAGGAAGCTGCACATTATCTAAAAGACTTTGTAATTGCTCAAGGTGGAGAT TGAAGTGTTTTAGAAAATTATGATAAACACTTTAGTTGTAAAAACAAACTAGAAATTAAAGCAACAAATAGTGGATATAT CAGATATAAAAGAGCTGAAGAAATCGGAATGATTTTAATAGAAATTGGTGCTGGAAGATTTAAAAAAACAGATAAAATTG ATCATGGTGCTGGAATTTATTTTGATAAACAATATGGTGATTATGTTAATGCTGGTGATACAATTATGACTCTTTATACA AATAGAGAAATTAATCCAAAATGAGAAAAAGAAATACATGAGTCATACGAATTACTAGAACAACAGCCCGTCAAAAAGGT GATCTGAGAAATCATATCTGAAGATGTGGAATAA Protein sequence : MFTFADIIEKKKHNIELTEQEISWLINSYTKGEITDYQMASFCMATYFTDMTARETAYLTKAYIESGDRYDLSKVSGFKA DKHSTGGVGDKTSLVYAPLVASYGIKVCKLSGRGLGKTGGTIDKLESFPGWKCEVTNDEFVDVINKTNMSIIAQSDNIVP ADKKIYALRDVTGTIGSMPLIVASIMSKKMIVENDGLILDVKTGNGAFMTTIEDAKDLANRMIEVGKQYNRKVAVVLTNM EKPLGRAMGNALEVKEAWETLNGNGPSDFNELIATLVGITLLQAKVFTDLNEAKQDVLKKLKSKEAAHYLKDFVIAQGGD WSVLENYDKHFSCKNKLEIKATNSGYIRYKRAEEIGMILIEIGAGRFKKTDKIDHGAGIYFDKQYGDYVNAGDTIMTLYT NREINPKWEKEIHESYELLEQQPVKKVIWEIISEDVE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| deoA | YP_005163381.1 | Thymidine phosphorylase | Not tested | Not named | Protein | 1e-64 | 42 |
