|
Name : ulaA (MSC_0395) Accession : NP_975386.1 Strain : Mycoplasma mycoides PG1 Genome accession: NC_005364 Putative virulence/resistance : Virulence Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG3037 EC number : - Position : 447259 - 449067 bp Length : 1809 bp Strand : + Note : membrane component; functions with enzymes IIB (sgaB; ulaB) and IIA (sgaA; ulaC) enzyme I and HPr for anaerobic utilization and uptake of L-ascorbate; sgaTBA are regulated by yifQ as well as Crp and Fnr DNA sequence : ATGGAGTTTGGAAAATATGTTTTAAATTTTTTTACAGAATTTATTGGAACCCCAGCAATATTAGTAGCACTATTTGCTTT TATTGGTTCTTTATTACAAAAAAAGAAATTTACAGAAAGTTTGACTTCAACAATTAAAACAGCTATTGGGTTTTTAATTA TTGGTGGTGGAGCTGGTATTATTGCTGGGTCTATTCAAAAACTAGGTTTTGCTTTTAATTTGTTATTTCAAAGATCTGGA GCTATTGCAAATAATGATGTTTTACCAGGTCTATTTTTAAATACTTCAAAAATAGTTCTAACTGGATCACTAATTATGAT TTGTGCTATGTTTTTAAATATAGTTTTAGCCAGAATTAGTAAATTTAAATATATTTATTTAACAGGTCATGTTTTATTTT ATTTTTCAACAATGTTTGCAAGTGTAATGCATGTTGCTGGTCTAAATTTAGATGAAGTAAAAAATTTAACAACCGTAGTA ATTTCTGGAGCTTTATTAGTTTCTATTTATATGGTGTTAACCCCAGCCTTATTAAATAATCATGTTATTAGAATTACTAA AAATGATAATTTAGCACTAGGACATACTGGTTCACTTGGTTATTGATTATCAGCAATTATTGGATTAGGAATAACAAAAA TTAGTAAAAAACCATCACGTTCTACTGAAGATGTTAATTTTCCAAAAGGACTAGCATTTTTAAGAAATACTAACGTAGCT ATTGGTATAACTATGTTATTGCTTTATTTGATAATTTACTTTACTACTTTTATAGTTCATGGATATGAGCAAATGGTAGC TCATAAAATTATTGATAATGGAAAAGATGTTTTTGTACAAGGGTTATTACAATCTTTAACATTTGCAGCAGGAGTTGAAA TTGTTTTAATTGGAGTAAGAATGTTTATTGCTGAAATTATTCCATCATTTCAAGGGATTTCACAAAAAGTAGTTCCAGAT GCAAAACCAGCTTTAGATTGTCCAATTGTATTTCCTTATGCACCAAATGCAGTTCTAATTGGGTTTATTTCATCATTTAT TGGTGGAATTATAGCAATGGGGATAACAATTTTAATTGTTAATTTAAAAGGAATTAATGTAGATATTTGAATTATTATTA TTCCAAGTATTGTTCCACACTTTTTTGTTGGTGCTACTTGTGGGGTTTTTGGAAATTCAACAGGTGGTATTAAAGGAGCT GTTATTGGTTCTTTTGTTAATGGATTAATTATTTCATTTGTTCCGTTCTTATTTATTGGTTTACAATTAATTCCAAACAT TTCTAATAACAATCAACATATTGCTTGAGGAGATGGAGACTTTTTATTAGGGTTACCAATTGGAGCTTTATTAAGATTAA TTGGAGTTAAAAGTGCTATTTGAGTTTTACTAATAATTAGTATAATAAGTTGATTAATCTTACCAATTTATAGTTTTTTA ACTAAAAAAATTAATTTAGTTAAAAAACTAGATAATAACAATAAAGATGAAATTATTAATAAAGATCAAAAGCTTATATC AAAATATGATCTTAAAAAACAATATAAAATAGTTGCTGTTTGTGGTCAAGGTTTAGGTTCATCATTGCTAATTGAAATGA ATTTAAAAAATGTTATTAAAGAATTAGATTTACCAATACAAATAACACATACTAATTTAAATTCATTTGATCCAACTGAT GAAACTATATTAGCTGTAGTTTGTGGAATAGATTTGCAAAATAGTATTAACTTTGAACGTAAAATTGTTTTAGAAAATCT TTTAGATCAAGATCAAGCTAAACAAAAGATTAAGGAATTTTTAAGTTAA Protein sequence : MEFGKYVLNFFTEFIGTPAILVALFAFIGSLLQKKKFTESLTSTIKTAIGFLIIGGGAGIIAGSIQKLGFAFNLLFQRSG AIANNDVLPGLFLNTSKIVLTGSLIMICAMFLNIVLARISKFKYIYLTGHVLFYFSTMFASVMHVAGLNLDEVKNLTTVV ISGALLVSIYMVLTPALLNNHVIRITKNDNLALGHTGSLGYWLSAIIGLGITKISKKPSRSTEDVNFPKGLAFLRNTNVA IGITMLLLYLIIYFTTFIVHGYEQMVAHKIIDNGKDVFVQGLLQSLTFAAGVEIVLIGVRMFIAEIIPSFQGISQKVVPD AKPALDCPIVFPYAPNAVLIGFISSFIGGIIAMGITILIVNLKGINVDIWIIIIPSIVPHFFVGATCGVFGNSTGGIKGA VIGSFVNGLIISFVPFLFIGLQLIPNISNNNQHIAWGDGDFLLGLPIGALLRLIGVKSAIWVLLIISIISWLILPIYSFL TKKINLVKKLDNNNKDEIINKDQKLISKYDLKKQYKIVAVCGQGLGSSLLIEMNLKNVIKELDLPIQITHTNLNSFDPTD ETILAVVCGIDLQNSINFERKIVLENLLDQDQAKQKIKEFLS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 2e-51 | 42 |
| unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 2e-51 | 42 |
| vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 2e-51 | 42 |
