|
Name : tkt (MSC_0372) Accession : NP_975365.1 Strain : Mycoplasma mycoides PG1 Genome accession: NC_005364 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : 2.2.1.1 Position : 423540 - 425540 bp Length : 2001 bp Strand : - Note : - DNA sequence : TTGATATATCTATTAAATATAAGGAGAAAAATGAAAACTAGTAAAAATGATAATTTAAATGCATTACGTATATTAGGTGT AAGTGCAATTAATAAAGCAAAATCTGGTCATCCTGGAATTGTTTTAGGAGCAGCTGGAATAGTTTATGTTTTATTTAATA AAATTATGAATTTTAATCCTAAAAATCCAGAATGATTTAATAGAGATAGATTTATTTTATCTGCTGGGCATGGTAGTGCA TTACTATATTCAGCTTTACATTTATCTGGATATGATTTATCTATTGATGATTTAAAACAATTTAGACAATGAGATAGTAA AACTCCAGGACATCCTGAAAAAACTTTAACGTGTGGAGTTGAAGTGACAACAGGTCCACTTGGTCAAGGTGTTGGAATGG GAGTTGGAATGGCTGTTGCTGAAGCTCATCTAGCAAGTGTTTATAATAAACATGATTTTAATTTGATTCATCATTATACT TATGTTTTATGTGGTGATGGTGATTTACAAGAAGGAATTAGTCAAGAAGCTATTTCTTTTGCTGGTAAACATAGGTTAAA TAAATTAATTTTAATTCATGATTCAAATGATGTGCAATTAGATTCAAATGTAGTTGATGTACAAATTGAAGATATGCACA AACGTTTTAAAGCATGTAATTGAAATACAATAAAAGTTAGTGATGGAGAAGATTTAAATTCAATTTATAAAGCTATTAGA AAAGCTCAACTTTCAGATAAACCAACATATATTGAAGTTAAAACTGTTATTGGATTAGGTTCAACAAAACAAGGAACTAA AGATATTCACGGTGCTCCTTTAAATGATGATATAACTAAAGTAAAAAAATATTTTGATTGAGATTATGATGATTTTATTA TTCCAGATTCAGTTTATAAACACTGATCAATTAATGCTAAAAAAGGTGAAATTAAAGAAGAATATTGAAATCAATTAAAA GCTAAATATAGTTTAAAATATCCTGAATTAAGTTCTTATTTAGATAATGCTATTAATAAAAATATTACTTTTGATTTTTC TAGTTTATTAAAAGATATACCAAATAATGATGAAGCAACAAGATTAAGTTCAGGAAAAATCTTTGAAAAAATTGCAAATC ATGAAAAAATGCTAATTGGAGGAAGTGCTGATTTATCTAGTTCAACTAGAATTAAAGGTGCTGATAATCAATTTACTAAT TTAAATAAAACTGGTAGAAATATAATGTATGGAGTAAGAGAATTTGGAATGGGTGCAATTAATAATGGAATTGCAGCTCA TAAAGGATTAATTCCAGTAGCTAGTGGGTTTTTTGTATTTGCAGATTATTTAAAACCAGCAATGAGATTAGCTTCAATTA TGCAATTACAACAATTATATGTCTTTACTCATGATTCAATTGCAGTTGGTGAAGATGGGCCAACTCACCAACCAATTGAA CAACTAGCAATGTTAAGAACTATTCCAAATCATGTTGTTTTAAGACCAGCTGATTTTAGTGAAACTATTGCTTGTTATAA AGTTGCTTTAACAAAACTAACTAAAACTCCTGCTTCAATTATTTTAACTAGACAAAATGTAAAACAACTACAACACAATG ATGTTTTAAATCAAGTTGAACGTGGTGCTTATATAATTAGTGATCAAACTGATGCAACTATTAGTTTAATTGCTAGTGGT AGTGAAGTTGGATTAGCAATTGATGTGCAAAAAGAATTATTAAATCACAATATTAAATCAAAAGTGATTTCAATGGTATC AACTAATTTATTTGATAAACAAGATAAAGAATATCAAGATCTAATTATTAATAAAAATACTAAAAGAATTGCTATTGAAA TGGGATCAAACGCAATTTGATATAAATATGTTGGTGATGATGGTTTAGTATTTGGAATTGATCGTTTTGGTGAATCAGCT CCTGCTAATAGTGTCATTAAAGAATTTGGATTTACAAAAGAAAATCTAACAAAAAAAATATTAGAATATTTAAATAAATA G Protein sequence : MIYLLNIRRKMKTSKNDNLNALRILGVSAINKAKSGHPGIVLGAAGIVYVLFNKIMNFNPKNPEWFNRDRFILSAGHGSA LLYSALHLSGYDLSIDDLKQFRQWDSKTPGHPEKTLTCGVEVTTGPLGQGVGMGVGMAVAEAHLASVYNKHDFNLIHHYT YVLCGDGDLQEGISQEAISFAGKHRLNKLILIHDSNDVQLDSNVVDVQIEDMHKRFKACNWNTIKVSDGEDLNSIYKAIR KAQLSDKPTYIEVKTVIGLGSTKQGTKDIHGAPLNDDITKVKKYFDWDYDDFIIPDSVYKHWSINAKKGEIKEEYWNQLK AKYSLKYPELSSYLDNAINKNITFDFSSLLKDIPNNDEATRLSSGKIFEKIANHEKMLIGGSADLSSSTRIKGADNQFTN LNKTGRNIMYGVREFGMGAINNGIAAHKGLIPVASGFFVFADYLKPAMRLASIMQLQQLYVFTHDSIAVGEDGPTHQPIE QLAMLRTIPNHVVLRPADFSETIACYKVALTKLTKTPASIILTRQNVKQLQHNDVLNQVERGAYIISDQTDATISLIASG SEVGLAIDVQKELLNHNIKSKVISMVSTNLFDKQDKEYQDLIINKNTKRIAIEMGSNAIWYKYVGDDGLVFGIDRFGESA PANSVIKEFGFTKENLTKKILEYLNK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 3e-116 | 44 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 4e-117 | 43 |
