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Name : LJ0758 (LJ0758) Accession : NP_964610.1 Strain : Lactobacillus johnsonii NCC 533 Genome accession: NC_005362 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 654614 - 656272 bp Length : 1659 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATAATTTAGGCAATAAAGTAATTTACCAAATTTATCCAAAATCTTTTTATGACTCAAATAATGACGGTATCGGTGA TTTACGCGGAATTATCCAAAAAATTGACTATATTAAGAAGCTAAATGTAGACTTTATTTGGTTTAATCCATTTTTTGTTT CCCCGCAAAATGATAACGGCTATGATATCGCTGATTATAAAAAAATTGATCCTCGCTTTGGAACTATGGCCGACTTTGAA GAATTAGTGGCTAAACTAAAAGATATAAATGTTAATGTCATGCTTGATATGGTCTTAAACCACTGTTCTACTGAACATGA ATGGTTCAAAAAGGCTCTTGCTGGTGATAAAAAATATCAAAAATTCTTCTATCTCAGAAAAGGTAAAGATGGAAAGTTGC CTAACAATTGGCAATCTAAATTTGGTGGCCCTGCCTGGTCAAAATTTGGTGACACAGATTATTACTACCTCCATCTTTAT GATCCAACTCAAGCAGATCTTGACTGGCACAATCCAGAGGTTCGCGCTGCCTTAATTGATGTAATAAACTTTTGGCGCAG TAAGGGTGTTCACGGTTTCCGCTTTGACGTAATTAATGTAACGGGAAAAGATACTGTCCTAGTTGATTCAACTGATCCAG TCCAAGAAAAATCACTCTATACTGATACTCCAGTAGTGCAGCAATATCTAAAAGAATTAAACGCTAAGTCCTTTGGTCAA GATCCAGAGTCTGTCACTGTTGGAGAAATGTCCTCTACTACAATTGAAAATTCAATTGCTTATACTCGCCCACAAGATCA TGAACTCTCAATGGTATTTACTTTCCACCATCTCAAAGTTGACTACAAAAATGGAGAAAAGTGGTCAAAGATGTCTTTTG ACTTCAAAAAATTAAAAGACATTATGCTTACTTGGAACAGCAAAATTGACCAAGGTGGCGGTTGGCAAGCTCTATTTTGG AACAATCATGACCAGCCTTGGGCTTTAAATCGGTTTGGCGATACCGGTAAATATCATGACAAATCTGCTGAAATGTTAGC TCTCGCTCTTCACCTACTGCGTGGAACACCCTATATCTACATGGGTGAAGAAATCGGTATGATGGATCCACACTATACTT CGATGAAAGATTATGTTGATATTGAAGCACTAAATGCATATGATGCCCTCATTGCTAAAGGGATGAATAAAAAAGAAGCT TTTGAAATCGTTCAATCAAAAGCTCGTGATAATTCAAGAGTCCCAATGCATTGGGATAATTCTAAATATGCTGGTTTTAG TGAAAGTAAGCCTTGGCTGATGCCAACTGACCAAGACAAGGTGAATGGTGAAAAGGAATTACGTGAAGGAGAAATATTTA ATTTCTACCAAAAATTAATTAAACTTAGAAAAAGCGAAGAATTAATTTCAGCTGGTCACATTAAGCCTCTTTTGATGGAT CATCCCCAGGTTATGGCATATGAACGCTACTTAGATAACTCTGACGAAAAATTATTAGTCTTTGCTAACTTCTATGGCAA AGAAACAAAGGTTGAAATTCCTACGGAATATATAGATCGTGACGGTGAAATTTTAATTCAAAATTATGATGAAGAGATTG TTACTCTTCCTTCAACACTTGAGTTAAAGCCATATGAAGCTTTAGCAATTAAAATATAG Protein sequence : MNNLGNKVIYQIYPKSFYDSNNDGIGDLRGIIQKIDYIKKLNVDFIWFNPFFVSPQNDNGYDIADYKKIDPRFGTMADFE ELVAKLKDINVNVMLDMVLNHCSTEHEWFKKALAGDKKYQKFFYLRKGKDGKLPNNWQSKFGGPAWSKFGDTDYYYLHLY DPTQADLDWHNPEVRAALIDVINFWRSKGVHGFRFDVINVTGKDTVLVDSTDPVQEKSLYTDTPVVQQYLKELNAKSFGQ DPESVTVGEMSSTTIENSIAYTRPQDHELSMVFTFHHLKVDYKNGEKWSKMSFDFKKLKDIMLTWNSKIDQGGGWQALFW NNHDQPWALNRFGDTGKYHDKSAEMLALALHLLRGTPYIYMGEEIGMMDPHYTSMKDYVDIEALNAYDALIAKGMNKKEA FEIVQSKARDNSRVPMHWDNSKYAGFSESKPWLMPTDQDKVNGEKELREGEIFNFYQKLIKLRKSEELISAGHIKPLLMD HPQVMAYERYLDNSDEKLLVFANFYGKETKVEIPTEYIDRDGEILIQNYDEEIVTLPSTLELKPYEALAIKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-105 | 42 |
