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Name : LJ0212 (LJ0212) Accession : NP_964228.1 Strain : Lactobacillus johnsonii NCC 533 Genome accession: NC_005362 Putative virulence/resistance : Unknown Product : maltogenic amylase or neopullulanase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 244112 - 245836 bp Length : 1725 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCAACTTGCAGCTTTAAAACACAGAACTGAAAGTGAAAATTGTTTTGTTATTGATCATTCACACGTTAAAATTAGACT TCATACGGCAAAAGATGATGTGGAAAAAGTAATTGTTCATTACACGGATAACTATCTCCCACCAAAACAAGCTAAAGAAC TTGAAATGGAGAAAATAGGTAGTGGTCAAGTTAATGATTACTGGGGAGCAACCTTAACTGCTCCATATCACCGAATTAAA TATACTTTTGAAGTGATAGGCAAAGACGGAAGTCATGTGATCTTCGGTGATCGTAGTATTGAAAAATTTAGCGATAAAAA GTTAAGAGAAGATGGAATGTATTTTAAAGTTCCGTACTTCCATGATATTGATCGCATCAAGACTCCAAAATGGCTTAAAG ATATTGTTTGGTATCAAATTTTTCCAGAGCGTTTTGCTAATGGCGATAAAAGTAATGACCCAGCAAATGTTAAAGAATGG AATCCAGAAGATCATCCAGGCAGAGAAGATTTTTATGGTGGAGACTTACAGGGAGTTTTAGATCATCTAGATGATCTACA GAAATTAGGAGTTACGGGATTATATTTCTGCCCAATTTTTAAGGCAAGTTCTAATCATAAATATGACACAATTGATTATT TACAAGTAGATCCAGCTTTTGGAGACAAGGATTTGTTTGCAAAAGTAGTTAATGAAGCACATAAGCGTGGGATGAAAGTG ATGCTTGATGCTGTATTTAATCACTTAGGTGATCAATCAATGCAGTGGCAAGATGTCGTTAAAAATGGCGAAAAATCACG TTTTAAAGATTGGTTCCACATTAATTCATATCCTGTTGAACCATATCGGGACCCAAGTAAAGGTGAAAATAATCCACCAT ATGAAACTTTTGCCTTCGAAAAACATATGCCTAAGTTAAATACGGCTAACCCAGAAGTACAGGACTTTTTATTAGAAATT GCGACCTACTGGGTAAAATATTTTGATATTGATGCTTGGCGGCTAGATGTTGCAAATGAAGTTGACCACCATTTCTGGAA GAGATTCCATGATGAATTAGTTAAAATAAAGCCTGATTTTTATATTGCTGGGGAAATATGGCATTCAGCTCGTCCATGGC TTCAGGGGGATCAATTTACAGGTGTAATGAATTATCCATATACTTTACAAATTGAAGACCACTTCTTTAAACATAAAATG GATGCTAAAGACCTTAGTGAACACCTAACTGATCAGTTAATGATGTATCCAGATATGGTTGACCAGGCTATGATGAATAT GCTTGATTCCCACGATACGGCTAGAATTTTAACTTTAGCAAAAGACAATCAAGATTTAGCTTTGCAAGCAGTTGCGTATG AATTTGTTCAACCTGGAGTGCCATGTATTTACTATGGAACAGAGATGGGGATGAGCGGTGATAATGATCCGGATTGTCGT AAACCAATGGATTGGAGTAAGATAAATGGTCCGGTATGGCAAAGAGTTCATGAATTAGTGAAATTCAGACTAGATCATAG TGATACCTTAAATAAAGGTACTGTTAAGTTAACGGTAACAGAAAAAGGACTTCTAAAAGTTGAACGAACAGGCAAAGAAA CAATAAAGGCCTACTATAATACCGGTAAACATAATGTAAAAATTGATAAAACAGCAGCTCTTAGTCAGAATTATAAAGCG GGAGTGTTAGCGCCAAATGGCTTTTTGATTGAGGTTAAAGCTTAA Protein sequence : MQLAALKHRTESENCFVIDHSHVKIRLHTAKDDVEKVIVHYTDNYLPPKQAKELEMEKIGSGQVNDYWGATLTAPYHRIK YTFEVIGKDGSHVIFGDRSIEKFSDKKLREDGMYFKVPYFHDIDRIKTPKWLKDIVWYQIFPERFANGDKSNDPANVKEW NPEDHPGREDFYGGDLQGVLDHLDDLQKLGVTGLYFCPIFKASSNHKYDTIDYLQVDPAFGDKDLFAKVVNEAHKRGMKV MLDAVFNHLGDQSMQWQDVVKNGEKSRFKDWFHINSYPVEPYRDPSKGENNPPYETFAFEKHMPKLNTANPEVQDFLLEI ATYWVKYFDIDAWRLDVANEVDHHFWKRFHDELVKIKPDFYIAGEIWHSARPWLQGDQFTGVMNYPYTLQIEDHFFKHKM DAKDLSEHLTDQLMMYPDMVDQAMMNMLDSHDTARILTLAKDNQDLALQAVAYEFVQPGVPCIYYGTEMGMSGDNDPDCR KPMDWSKINGPVWQRVHELVKFRLDHSDTLNKGTVKLTVTEKGLLKVERTGKETIKAYYNTGKHNVKIDKTAALSQNYKA GVLAPNGFLIEVKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SPN23F_09660 | YP_002510949.1 | alpha-amylase | Not tested | PPI-1 | Protein | 5e-128 | 44 |
