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Name : LJ1651 (LJ1651) Accession : NP_965458.1 Strain : Lactobacillus johnsonii NCC 533 Genome accession: NC_005362 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 1525310 - 1527970 bp Length : 2661 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGCACAAAAGAAATTACTTTTAATTGACGGCAACTCTGTGGCCTTTCGTGCCTTTTATGCTTTATACCGTCAGCTTGA TCGTTTTACTAGTCCAGATGGATTGCATACAAATGCAATTTTTACTTTTAAAAATATGCTTGACGCAATCATGAAGCAGA CTAATCCAACTAATGTATTAGTTGCTTTTGATGCAGGAAAAGTTACTTTTAGAACTGAGATGTATCAAGATTATAAAGGT GGTCGCCAAAAAACGCCAAGTGAATTGTCAGAGCAACTTCCTGTAATTCGTGAAATGCTTAAAGATCTTGGAATAAAGAG TTATGAGCTAAAGAATTATGAAGCTGATGATATTATTGGGACACTTTCTAAGATGGGAGAAGACGCTGGATATACAGTTG ATATTGTAACTGGAGATAGGGATCTAACTCAGCTTGCATCTGATAAAACCACAGTCTTAATTACTAAAAACGGAGTTGGC GATACAGAAGCTTATACTCCAGCCCATATGAAAGAAGTTAACGGTGTTACTCCAACTGAATTCATTGACATGAAAGCTTT GATGGGGGATAGTTCAGATAATTATCCTGGTGTAACTAAGGTCGGCCCAAAAACTGCTTCTCGTCTAATTCAAAAATATG GTTCTATTGAAGAACTTTATGAACATGTAGACGAAATGAAAAAGTCTAAGCTAAAAGAGAACTTAATTAATGATAAAGAT AAGGCCTTTTTAGCAAAAAAATTAGCTACTATTGATCGTGATTCGCCAGTGGAAGTAACTCTAGCTGATACTAAATTACA AGAACCAAATATTGAAGACTTGCGTAATTTATATGAGCGTTTAGGATTTAAGAAATTCTTAGCTGAGTTAGATGTTAATG GTACAACTAGTAACACACCAGAAACGGAAAAGTATGAATATCTTGAGTTAACTAAAGAAAATATCATTGAGCTAGATAAA ATCAGTGAAAAAGAAGTAACTTTTTATTTAGCAATGTTAGGTGATAATTATCATCTAGCTCCAATTGAAGGCTTTTCTTT AAAAGTTGGTAATAAGATTTATGTATCTAAAGATCCAGTTTTGTTGCAAGAAAATTCACTTCGTCAAATGCTAGAAGATA AGACTATCAAGAAGAATGTTTTTGACATTAAAAGAACGTATGTAGGTTTACATCGACTAGATATCAAGGCAGAAGGTCTA GACTATGATATGCTTCTTGCTTCATATTTAGTTAATAATGAAAATAATTCGAATGATCTTGGAGAAATAGCTCATTTATA TGACGATTATTCTGTAAAGACTGATTTAGAAGTTTACGGAAAAGGTAAAAAACAAGCTGTACCTGACGATAATGATTTCT TTGAACATTTAGCAGCTAAAGTCGCCGTAATTGAGAAATTAAAGACTCCACTTCTTGAAAAACTAAAAGATCATGAACAA GATGATTTATATGAAACAATTGAAATTCCAGTGGCTTTCGTCTTAGCAAAGATGGAAATTACTGGAATCAAGGTTGAAGC ATCCGTTTTGAATCAATTAGGTAATGATTTTGCAGTTAAGTTACAAGAACTAGAACATAAGATTTATCAACAGGCTGGCG AAGAATTCAACTTGAACTCACCTAAGCAGTTGGGGCATATCCTATTTGAAAAATTAGGTTTACCACCAATTAAGAAGACT AAGACTGGTTACTCAACATCTGTTGAAGTATTAGAGCAATTAAAAATGAAAAGTCCAATTGTTTCAGAAATTTTGGACTA TCGTCAAATTGCTAAAATTCAAAACACTTATGTTAAGGGCTTGCTTGACTGCATTCAGCCAGATGGAAGAATTCACACTC GCTATTTGCAGACTTTGACTACAACAGGTCGTCTTTCTTCAGTTGATCCTAATTTACAAAATATTCCAACTAAAACTGAG GAAGGAAAGCAGATTAGAAAAGCTTTTGTTCCTTCAACAAAAGATGGGTATATTTTCTCTTGTGATTATTCTCAGGTTGA ACTAAGAGTGCTAGCTCATGTTTCTGGGGATGAACATATGCAAGAAGCATTTAAGTCAGGCTATGATATTCACGCCCACA CCGCAATGAAAATATTCCACTTGGACTCACCTGATGAAGTAACGCCATTAATGCGTAGACATGCTAAAGCTGTTAATTTT GGTATCGTTTATGGTATTTCAGACTATGGCTTGTCTAAAAACTTAGGCATTAGCCGTAAGCAGGCTAAAACTTTTATTGA AAATTACTTTGAACAATATCCTCAAATTAAAAATTATATGGATGAAGCAATTAAAAAAGCTCGTGAGAATGGCTATGCAG AAACAATTATGCATAGAAGACGGTATTTACCAGATATTCATTCAAAGAACTTCAATGTCAGAAGTTTTGCGGAAAGAACT GCAATTAATTCTCCAATTCAAGGATCAGCAGCTGATATTATTAAGATTGCCATGATTAATATGCAGAAAAAACTTGATGA ACTACATTTAAAGACTAAAATGGTCTTACAAGTACACGATGAATTGATTTTTGATGTGCCAAAAGATGAATTAGATACAA TTAAGAAAATTGTTCCAGAGGTTATGCAGTCAGCTGTCAAATTAGATGTTCCACTAATTGCAGATTCAAATTGGGGACAT AATTGGTACGATGCAAAATAA Protein sequence : MAQKKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLDRFTSPDGLHTNAIFTFKNMLDAIMKQTNPTNVLVAFDAGKVTFRTEMYQDYKG GRQKTPSELSEQLPVIREMLKDLGIKSYELKNYEADDIIGTLSKMGEDAGYTVDIVTGDRDLTQLASDKTTVLITKNGVG DTEAYTPAHMKEVNGVTPTEFIDMKALMGDSSDNYPGVTKVGPKTASRLIQKYGSIEELYEHVDEMKKSKLKENLINDKD KAFLAKKLATIDRDSPVEVTLADTKLQEPNIEDLRNLYERLGFKKFLAELDVNGTTSNTPETEKYEYLELTKENIIELDK ISEKEVTFYLAMLGDNYHLAPIEGFSLKVGNKIYVSKDPVLLQENSLRQMLEDKTIKKNVFDIKRTYVGLHRLDIKAEGL DYDMLLASYLVNNENNSNDLGEIAHLYDDYSVKTDLEVYGKGKKQAVPDDNDFFEHLAAKVAVIEKLKTPLLEKLKDHEQ DDLYETIEIPVAFVLAKMEITGIKVEASVLNQLGNDFAVKLQELEHKIYQQAGEEFNLNSPKQLGHILFEKLGLPPIKKT KTGYSTSVEVLEQLKMKSPIVSEILDYRQIAKIQNTYVKGLLDCIQPDGRIHTRYLQTLTTTGRLSSVDPNLQNIPTKTE EGKQIRKAFVPSTKDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDEHMQEAFKSGYDIHAHTAMKIFHLDSPDEVTPLMRRHAKAVNF GIVYGISDYGLSKNLGISRKQAKTFIENYFEQYPQIKNYMDEAIKKARENGYAETIMHRRRYLPDIHSKNFNVRSFAERT AINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVLQVHDELIFDVPKDELDTIKKIVPEVMQSAVKLDVPLIADSNWGH NWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 56 |
