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Name : leuS (PAM_738) Accession : NP_950990.1 Strain : Onion yellows phytoplasma onion yellows Genome accession: NC_005303 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : - Position : 832861 - 835326 bp Length : 2466 bp Strand : - Note : identified by sequence similarity; putative DNA sequence : ATGACAAAATTAATTTATGATTTTAAACAAATAGAACATAAATGGCAACTTTATTGGCAACAAAATAAGGTGTTCAAAAC TCAAGATAACTTTTCACAAAAGAAATTTTATTGTCTTGATATGTTTCCTTATCCTTCTTCTGAAGGGCTTCATGTAGGCC ATATTGAAGGTTATACTGCAAGCGATATTATGAGTAGGTTCAAACGCATGCAAGGTTTTAATGTTTTGCATCCTTTTGGT TGGGATTCATTTGGGCTGCCTGCCGAACAATATGCTTTGCAAACAGGCAAACCCCCCCGCACTTTTACTTATGAAAACAT CAATAATTTTAAAAAACAAATTCAAAGTATTGGTAAAAGTGTTGATTGGGATAGAGAACTTGCCACCTCAGATCCTTATT TTTATTCCTGGACTCAATGGATTTTTAAAAAACTTTACGAAAAAGGACTAGCAGTTCTCAAAAATACAGAAGTAAATTTT TGCCCTAATTTAGGAACAGTGCTTGCTAATGAAGAAGTAATTTCTAATGAAAAAGGGATGTTTTCTGAAAGAGGCAATCA TCCAGTTGTTAAAAAAAAGATGAAACAATGGGTTTTAAAAATAACTCAATATGCAGACAGACTTTTAGACGACCTTAATT TAGTTAATTGGCCTTTAAATGTGAAAGAAATGCAAGCTAATTGGATTGGCAAAAATCAAGGTGCAATCGTCTCTTTTCCA GTTTCGGACCAAAAAATAACTTTAAAAACTTTCACCACTCGCCCTGATACTCTTTTTGGTGTAACTTTTTTAGTAATAGC GCCCGAACACGAATTAGCCTTACAACTCACCAAACCCGAATACCAACAAGCAGTTAACAATTATTTGGAATTAACCAAAC AAAAAAAAGACTTAGAAAGAGACATCAATAAAGACAAAACAGGTGTTTTTACGGGTAGTTTTGCAATTAATCCTTGCAAT AACACCAAAATTCCTATCTGGATTGCTGATTATGTCCTTCCTCATTATGGCACAGGTGCTTTAATGTCTGTTCCTTGTCA TGATCAAAGAGATTTTGAGTTTGCTCAAAAACATGGTCTAAAAATGATTCAAGTTATAACTCCCCCGTCTTCTGATTTGG AAAATCCTACCGCCAACCAAACCAACCCTCCCTTAACTGAAGCTTATACGGGAGAAGGCATCCACATCAATAGTGATTTT TTAAATGGTCTTAATAACGAACAAGCTAAAACTAAAATTTTGCAATTTTTAGAAAAAAATAATCACGGGTACTCTCATTA TACTTATAAATTGCGTGATTGGGTCTTTTCGCGCCAACGATATTGGGCAGAACCCTTCCCCATTTATTATGATGACACCA ACAATAAAATTTATACTGATAGCGACGCAAACTTGCCCATAGAACTTCCTTTTTTGGAACAAATCAAACCATCAGGCACA GGTGAATCACCTCTCTCCAAAGCCCATTTTTGGCTATATTTTGAAAAAGATGGCAAAAAATATCGCAGAGATTCTAACAC TATGCCACAACTTGCAGGTAGTTCTTGGTACTATATTGGCTATATTTTGAAAAATTATTTGGGTATAATCCCATTAAATA CCACCAAAGCAAAAGAACTACTTGACTATTATTTGCCAGTAGACTTATACATTGGAGGAACAGAACACGCTGTTGGTCAT TTACTTTATGCACGTTTTTGGCATAAGTTTTTATACGATCTGGGTTTAGTTTCTACCAAAGAACCTTTTCAAAAATTAGT TAATCAAGGTATTATTTTGGGACATGATCACACTAAAATGTCTAAATCCAAAGGCAACGGCGTAAGTTCTTCTTTAATGC TTGCACGCTACGGCGCTGATGTACTGCGAATTTATATCATGTTTATGGGTCCGTTAGAAGATATTAAAAGTTGGTGTGAA AAAGGTTTCAAAGGAATACAACGTTTTTTAAATAGAGTTTATCAAATGTTTTCTTTTGCAATGCCAAATGATTTTGAAAC TTCTCTAAACGCTATTTATCATCAAACCATTTTTCAAACAACCCAAGATTATGAAAAATTGAAATTCAATAAAGTTATTA GTCAATTAATGATTTTTGTCAATCAAGTTTATAAACATCAAAAAATAGGCAAAAAACAAGCACAGACCTTTTTGCAACTA TTAAATCCGATTGTTCCTCACTTGACAGAAGAAATTAATCAAACTATTTTGAAAAATAACAACCAACTAGTTGCTTTAAC TTGGCCTTTGCATGATAAAACTCATTTAGAACAACTGCAAGTAAAAATTATTGTGCAAGTAAATAGCAAATTAAGAGCTG TTTTGGAACTTCCTTGTGATTTGTCTTCAGAACAAATTAAAACTCTAGCTTTACAAGATGCAAAAGTTAATAAGTTTGTA TGCCATAAAAACATTCAAAATATGATTTATATTCCCAATAAATTATTAAATATTATTGTTAATTAA Protein sequence : MTKLIYDFKQIEHKWQLYWQQNKVFKTQDNFSQKKFYCLDMFPYPSSEGLHVGHIEGYTASDIMSRFKRMQGFNVLHPFG WDSFGLPAEQYALQTGKPPRTFTYENINNFKKQIQSIGKSVDWDRELATSDPYFYSWTQWIFKKLYEKGLAVLKNTEVNF CPNLGTVLANEEVISNEKGMFSERGNHPVVKKKMKQWVLKITQYADRLLDDLNLVNWPLNVKEMQANWIGKNQGAIVSFP VSDQKITLKTFTTRPDTLFGVTFLVIAPEHELALQLTKPEYQQAVNNYLELTKQKKDLERDINKDKTGVFTGSFAINPCN NTKIPIWIADYVLPHYGTGALMSVPCHDQRDFEFAQKHGLKMIQVITPPSSDLENPTANQTNPPLTEAYTGEGIHINSDF LNGLNNEQAKTKILQFLEKNNHGYSHYTYKLRDWVFSRQRYWAEPFPIYYDDTNNKIYTDSDANLPIELPFLEQIKPSGT GESPLSKAHFWLYFEKDGKKYRRDSNTMPQLAGSSWYYIGYILKNYLGIIPLNTTKAKELLDYYLPVDLYIGGTEHAVGH LLYARFWHKFLYDLGLVSTKEPFQKLVNQGIILGHDHTKMSKSKGNGVSSSLMLARYGADVLRIYIMFMGPLEDIKSWCE KGFKGIQRFLNRVYQMFSFAMPNDFETSLNAIYHQTIFQTTQDYEKLKFNKVISQLMIFVNQVYKHQKIGKKQAQTFLQL LNPIVPHLTEEINQTILKNNNQLVALTWPLHDKTHLEQLQVKIIVQVNSKLRAVLELPCDLSSEQIKTLALQDAKVNKFV CHKNIQNMIYIPNKLLNIIVN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 49 |
