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Name : tkt (Erum5600) Accession : YP_180423.1 Strain : Ehrlichia ruminantium Welgevonden Genome accession: NC_005295 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : 2.2.1.1 Position : 963646 - 965661 bp Length : 2016 bp Strand : - Note : tkt | transketolase | len: 671 aa | Highly similar to many e.g. TKT2_ECOLI P33570 Transketolase 2 (667 aa) from Escherichia coli, fasta scores: E(): 7e-114, 47.554% identity in 654 aa overlap | Contains Pfam match to entry PF00456 transketolase, Transketo DNA sequence : ATGAGTCAAAAATATAGTAATATGATTGCCATGGCTAATGCTGTAAGAGTACTTTCAATAGATGCTATACAAAAAGCCGC TTCTGGACATCCAGGTATGCCTCTTGGTATGGCAGATGTAGGAACTATGTTATTTGCTAAGTTTTTAAAATTTAATCCTA AGGATCCTAATTGGTTTGATAGGGATAGGTTTGTTTTATCAAATGGACATGGGTCAATGTTATTGTATTCTATATTATAT TTCTTAGGATGTTTGGATATAGAAGAGATAAAAAAGTTTAGGCAAATACATTCTCTGACACCTGGCCATCCAGAATATGG TTGTACTCCTGGAGTTGATGCTACAACTGGTCCGCTAGGTCAGGGATTGGCTTCTGCTGTGGGTATGGCAATAGCAGAAA AAATACTATCTGAAAAATTTGGAGCTGATATTGTATCTCATAATACTTATGTTATGGTTGGGGATGGATGTCTTATGGAG GGAATTAGCCATGAAGCTGCGTCTTTAGCTGGACATTTGCAGTTAGATAAATTAATAGTATTATTTGATGATAATAATGT TTCTATCGATGGTCCTATATCATTGTCTGTTTCTGATAATGTTAAAGGTAGATTTTTATCTTATGGATGGGATGTTGATG AAATAGATGGGCATGATTTTTCTCAGATTGAATCATCAATTAAAAATGCAAAAAATTCTAAAAAGCCATCTCTAATTTGT TGTAAGACTATTATTGGCAAAACTATTCCTTCAAAAGAAAATACTTGTGATATACATAGTTGGCCAGTGACTGAAGAAGA TATCATTGTAATGAAGAAGAGATTAGGGTGGGCTTATAAGCCATTTGAGTTCCCAGAGGAAATTCTGCAATTATGGCAAG ATATTGCGTGTAATTCAGAGGAAGAGTATAAATTATGGGTAGAACGAGTTAGTGAGTATGGCAAGACATCACAAGATTTT ATGGATGTGATGGCTGATGGTGTATCTAATGAGGTTTTTTTGAATTTGAAGAGTTTAAAAGAGGAATTATGTAGCTTGAA TTTGAATGAAGCAACACGTAAATCTTCAGGTAGAGTATTAGATGTTATAATGGGTAGTACTGGTAAGTTGATAGGTGGTT CTGCAGATCTTAGTAATTCTAATAATACTAAACCAAAATTTACATCGGTAATTAATAAAGATAATTTCTCTGGTTCTTAT TTACATTATGGAGTTAGAGAACATGCTATGGCAGCATGTATGAATGGTATGGCATTGCATAAGGGAGTAATCCCTTATGG TGGTACATTTTTAATTTTCTCTGATTATTGTAGACCAGCTATAAGGTTGTCTGCCTTGATGAAAAGGCAAGTTATTTATA TTATGACCCATGATTCAATAGGGGTTGGGGAAGATGGTCCTACTCATCAACCTGTTGAGCATCTACCATCTTTGAGGTTA ATTCCTAATTTGTATGTTTTTAGACCAGCTGATGCTATAGAAGTATTAGAGTGTTGGGAGATTGCATTAAAGTTAATAGA TGCTCCATCGGTTCTGATATTATCTAGACAGAATGTTAAATGTGTACGTAGTACTTATGTTGCAGAGAATATGTCAAACA AAGGTGCATATATTATTCGTGAATATAAGAATGATCTCGATGTAACAATTTTTGCTACTGGGTCTGAGGTTGAGATTGCA TTAAAAGCAAGTGATATTTTAATAGGTAAAGGATTAGGTGTCCGGGTAGTTTCTGTACCTTGTTGGGAATTGTTTTATAA ACAAGATAAAAAATATATTATAAGTCTGTTAAATAATAAAAGTATAAAGGCAGCAGTAGAAGCTGCTAATTCATTTGGTT GGTGTAAGTATATAGGAGAAGATGGAATTTTTGTAGGTTTGGAAGATTTTGGAATATCTGCTCCATTCAAAGATTTGTAT AAGTATTTTGGAATTACTCCAGAAAACTTAGTGGATAAAATACTCAGTAAATTAAGAATTAATAGTAATTACGAAAGTAA TGTTACTGCGGATTGA Protein sequence : MSQKYSNMIAMANAVRVLSIDAIQKAASGHPGMPLGMADVGTMLFAKFLKFNPKDPNWFDRDRFVLSNGHGSMLLYSILY FLGCLDIEEIKKFRQIHSLTPGHPEYGCTPGVDATTGPLGQGLASAVGMAIAEKILSEKFGADIVSHNTYVMVGDGCLME GISHEAASLAGHLQLDKLIVLFDDNNVSIDGPISLSVSDNVKGRFLSYGWDVDEIDGHDFSQIESSIKNAKNSKKPSLIC CKTIIGKTIPSKENTCDIHSWPVTEEDIIVMKKRLGWAYKPFEFPEEILQLWQDIACNSEEEYKLWVERVSEYGKTSQDF MDVMADGVSNEVFLNLKSLKEELCSLNLNEATRKSSGRVLDVIMGSTGKLIGGSADLSNSNNTKPKFTSVINKDNFSGSY LHYGVREHAMAACMNGMALHKGVIPYGGTFLIFSDYCRPAIRLSALMKRQVIYIMTHDSIGVGEDGPTHQPVEHLPSLRL IPNLYVFRPADAIEVLECWEIALKLIDAPSVLILSRQNVKCVRSTYVAENMSNKGAYIIREYKNDLDVTIFATGSEVEIA LKASDILIGKGLGVRVVSVPCWELFYKQDKKYIISLLNNKSIKAAVEAANSFGWCKYIGEDGIFVGLEDFGISAPFKDLY KYFGITPENLVDKILSKLRINSNYESNVTAD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 1e-134 | 47 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 6e-136 | 45 |
