Name : recG (Erum0420) Accession : YP_179908.1 Strain : Ehrlichia ruminantium Welgevonden Genome accession: NC_005295 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 55495 - 57528 bp Length : 2034 bp Strand : + Note : recG | ATP-dependent DNA helicase RecG | len: 677 aa | Highly similar to many e.g. RECG_ECOLI P24230 ATP-dependent DNA helicase recG (693 aa) from Escherichia coli, fasta scores: E(): 6.5e-63, 38.066% identity in 662 aa overlap | Contains Pfam match to en DNA sequence : ATGCAAAATTTGCACCTATTTTCTAGCATATATATGTTGCCAGGAATTAGTAGTGTAATAGGTGGTTTGTTAAAAAAATT GTGTGGTGGTGATAGGATTATAGATTTACTATTACATATTCCACAGAGTTATATAGATAGAAGAACTCAGTTATCTGAAG ATTCAGTAGGTAAAATTGTTACGTTTGTTGGTATTGTGAAATGTCATGGTTTTGTTGGTGGACGAAATAAATCGCAATAC AAAGTGATATTAGAGACGAATATAGGTGAAATATCTTTAATTTTTTTTAATTATTCACTTAAATATTTGAAGAGCATTTT AAATGTTGGATCAGCTTATGTTATAAGTGGAACTTTGATTAGGTTTTGTGGATGTTTACAAATTATGCATCCAGATTACA TTGTAAGGGATATAAAGAAATTTCAAGATATTAGCATAATAGAGCCTGTATACCCATTAGTAAAAGGTTTAACTTCTCGG AAAATTTCAAAATTTGTAAAATTAGGAATAAACCTATTACCTGATTTTCCAGAGTGGATAGATGATGAACTATTGGTAAG TAATCAGTGGTACAGTTTTAAAGAAAGTTTAATAAAAATACATTATCCAGATACACTTGAAACATTATCATTATATAGAA CTAGATTAGTATATGATGAATTATTTAGTCATCAAATTGCTATGAAGGTTATAAGACAATCTAGTTGTAAGGAAGGTATC TCTATTGTGAGTAAGCAGATATATTACAATCATGTTTTAAATAAGCTACCTTTTAAATTAACTGCTGGACAGGAAATGGT TATATCTGAAATTACACATAGTCAAAAATCAAAACAACGAATGGTGAAACTATTAATAGGAGATGTTGGTAGTGGGAAAA CAGTGGTAGCATTGTTTGCTATTTTAAATGTGGTAGAAAACGGTGGACAAGCTGCTCTTATGGTACCTACTGAGATATTA GCTGAACAACATTATCGTTGGATACAGAGTATATTGTCTGATCTTAAAATTAGTGTTGAATTGTTGACTAGTAAAGTTAA GGGTAAAAAATCTATAAAGAAGAAATTACAACTTGGTGAGTGTCAAGTAGTTATTGGTACTCATGCGTTATTTCAAGATA GTGTTAATTTCTATAATCTTAATTTAATTGTAATTGATGAACAACATAGGTTTGGTGTATTGCAAAGAATGAAATTAATA AAGAAAGGAAATATTGCTGATGTTCTTTTTATGACAGCAACACCTATTCCTAGAACATTGGAACAGGTAGTATATGGTGA TATGGATTGTTTGAGGCTTAAAGATAAGCCACATAACAGGTTGTCTATACAAACAAGTCTTGTAAATATTGAAAGGTTAT CAGAAGTAGTATCAAAGCTACATATTGCTCTAGAAGAAGGTAATAAAGCGTATTGGATTTGTCCTTATATTGAGGAATCT GAATTGTTAAATATTGCAGCAGCTGAAAAACGGTTTTTTGCTCTAAAAGATATATTTAATGAAAAAGTTGGTTTGATACA TAGTCGTTTATCCAAAATTGAAAAAGATGAAATAATGAATTCTTTTTATAATGGAGATATCAAGTTATTGATAGCTACGA CTGTAATAGAGGTGGGAGTGGATGTTCCTGATGCTACTATTATAATTATAGAAAATGCTGAACAGTTTGGTTTATCACAA CTTCATCAATTGCGTGGTAGAGTAGGTCGTAGCAATAAACCTTCATTTTGTATTTTATTGCATAGTAAAGTTTTAAGTAA GATTGCTTATAAGAAGTTATGTATATTACGCCAGTTTCAAGATGGATTTTATATAGCAGAACAAGATTTACTATTACGTG GTAGTGGAGATATATTAGGGATAAGGCAATCAGGTTTGTCTAACTTTAAATTTGCAGATATTTATAGGGATTATGAACTT ATTTCTGTTGCAAATAAGTATGCAGATAAAATTTATTGTGAAGGGGAATTAAGTGAGCACTTAAGACAATTACTTACTAT ATTTGGTCATAATTCCTCTATGATAAATTACTAA Protein sequence : MQNLHLFSSIYMLPGISSVIGGLLKKLCGGDRIIDLLLHIPQSYIDRRTQLSEDSVGKIVTFVGIVKCHGFVGGRNKSQY KVILETNIGEISLIFFNYSLKYLKSILNVGSAYVISGTLIRFCGCLQIMHPDYIVRDIKKFQDISIIEPVYPLVKGLTSR KISKFVKLGINLLPDFPEWIDDELLVSNQWYSFKESLIKIHYPDTLETLSLYRTRLVYDELFSHQIAMKVIRQSSCKEGI SIVSKQIYYNHVLNKLPFKLTAGQEMVISEITHSQKSKQRMVKLLIGDVGSGKTVVALFAILNVVENGGQAALMVPTEIL AEQHYRWIQSILSDLKISVELLTSKVKGKKSIKKKLQLGECQVVIGTHALFQDSVNFYNLNLIVIDEQHRFGVLQRMKLI KKGNIADVLFMTATPIPRTLEQVVYGDMDCLRLKDKPHNRLSIQTSLVNIERLSEVVSKLHIALEEGNKAYWICPYIEES ELLNIAAAEKRFFALKDIFNEKVGLIHSRLSKIEKDEIMNSFYNGDIKLLIATTVIEVGVDVPDATIIIIENAEQFGLSQ LHQLRGRVGRSNKPSFCILLHSKVLSKIAYKKLCILRQFQDGFYIAEQDLLLRGSGDILGIRQSGLSNFKFADIYRDYEL ISVANKYADKIYCEGELSEHLRQLLTIFGHNSSMINY |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 1e-122 | 46 |