Gene Information

Name : hemC (Erum3690)
Accession : YP_180233.1
Strain : Ehrlichia ruminantium Welgevonden
Genome accession: NC_005295
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : porphobilinogen deaminase
Function : -
COG functional category : H : Coenzyme transport and metabolism
COG ID : COG0181
EC number : 2.5.1.61
Position : 645592 - 646491 bp
Length : 900 bp
Strand : +
Note : transformation of porphobilinogen to hydroxymethylbilane in porphyrin biosynthesis

DNA sequence :
ATGAATAGTATGAATGTATATGTTGGAACACGAGGAAGTATTTTAGCTATTGCACAAGCAATGGAAGTTAAGAAGTTATT
GTATAATTATTTTCCTGATATTAATGTTCAGATTGTTCATATTGTAACTTCTGGAGATATTAATGATAAAATTTCTCTGA
GTGAGATAGGTGGAAAGGGATTATTTTTAAAAGAGTTAGAAGAAGCATTATTAACTGGTACTATAGATTTAGCTGTGCAT
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GCAGGGCAATATGATGGAATAATATTGGCTAAAGCTGGTTTAATGCGAATAAATAAAACTCATGTGATAAAAGAAGTATT
GGATCCTCAAGTGATGCTAAGTGCAGTAGGACAAGGAGCTATTGGTATTCAATGTCGAGCTAATGATTACAAGATGATAG
ATATGATAAAAATTTTAAATTGTAAAAAATCCTATATTAGTGTTGCAGCTGAAAGAAGTTTTATGAAGACTGTTAATGGT
TCATGTGATACACCATTAGCTGCACTTGCTAAATATGTTAATTCTGATACTTTGTACATGTCATGTATGCTTTCAAATGA
AGAAAAGACAGTATTTTCAGATTGTTACTTTAATGAATGTGATGCGGAAATATCAGGTATTAATATGGGAAATGACTTAA
TGGATCAGTTAAATAACTAA

Protein sequence :
MNSMNVYVGTRGSILAIAQAMEVKKLLYNYFPDINVQIVHIVTSGDINDKISLSEIGGKGLFLKELEEALLTGTIDLAVH
SMKDVPAFYCDSLVIPCILKRSSPYDVFISSKYQSLRSLPDNAVIGTSSIRRKVQLMRLLSSVQVVPIRGNVDTRILKLE
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SCDTPLAALAKYVNSDTLYMSCMLSNEEKTVFSDCYFNECDAEISGINMGNDLMDQLNN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB0868_00331 YP_008211657.1 Porphobilinogen deaminase Not tested AbaR26 Protein 2e-47 41
BJAB07104_00327 YP_008207792.1 Porphobilinogen deaminase Not tested AbaR25 Protein 2e-47 41