|
Name : hemC (Erum3690) Accession : YP_180233.1 Strain : Ehrlichia ruminantium Welgevonden Genome accession: NC_005295 Putative virulence/resistance : Unknown Product : porphobilinogen deaminase Function : - COG functional category : H : Coenzyme transport and metabolism COG ID : COG0181 EC number : 2.5.1.61 Position : 645592 - 646491 bp Length : 900 bp Strand : + Note : transformation of porphobilinogen to hydroxymethylbilane in porphyrin biosynthesis DNA sequence : ATGAATAGTATGAATGTATATGTTGGAACACGAGGAAGTATTTTAGCTATTGCACAAGCAATGGAAGTTAAGAAGTTATT GTATAATTATTTTCCTGATATTAATGTTCAGATTGTTCATATTGTAACTTCTGGAGATATTAATGATAAAATTTCTCTGA GTGAGATAGGTGGAAAGGGATTATTTTTAAAAGAGTTAGAAGAAGCATTATTAACTGGTACTATAGATTTAGCTGTGCAT TCAATGAAAGATGTACCAGCTTTTTATTGTGATAGTTTAGTTATCCCGTGTATACTGAAACGTAGTAGTCCTTATGATGT ATTTATTTCCTCTAAATATCAAAGTTTAAGGTCATTACCTGATAATGCAGTTATAGGTACATCGTCTATTAGAAGAAAAG TACAATTAATGAGATTGCTTTCCAGTGTACAAGTTGTTCCTATTAGAGGTAATGTAGATACTAGGATATTGAAATTGGAA GCAGGGCAATATGATGGAATAATATTGGCTAAAGCTGGTTTAATGCGAATAAATAAAACTCATGTGATAAAAGAAGTATT GGATCCTCAAGTGATGCTAAGTGCAGTAGGACAAGGAGCTATTGGTATTCAATGTCGAGCTAATGATTACAAGATGATAG ATATGATAAAAATTTTAAATTGTAAAAAATCCTATATTAGTGTTGCAGCTGAAAGAAGTTTTATGAAGACTGTTAATGGT TCATGTGATACACCATTAGCTGCACTTGCTAAATATGTTAATTCTGATACTTTGTACATGTCATGTATGCTTTCAAATGA AGAAAAGACAGTATTTTCAGATTGTTACTTTAATGAATGTGATGCGGAAATATCAGGTATTAATATGGGAAATGACTTAA TGGATCAGTTAAATAACTAA Protein sequence : MNSMNVYVGTRGSILAIAQAMEVKKLLYNYFPDINVQIVHIVTSGDINDKISLSEIGGKGLFLKELEEALLTGTIDLAVH SMKDVPAFYCDSLVIPCILKRSSPYDVFISSKYQSLRSLPDNAVIGTSSIRRKVQLMRLLSSVQVVPIRGNVDTRILKLE AGQYDGIILAKAGLMRINKTHVIKEVLDPQVMLSAVGQGAIGIQCRANDYKMIDMIKILNCKKSYISVAAERSFMKTVNG SCDTPLAALAKYVNSDTLYMSCMLSNEEKTVFSDCYFNECDAEISGINMGNDLMDQLNN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00327 | YP_008207792.1 | Porphobilinogen deaminase | Not tested | AbaR25 | Protein | 2e-47 | 41 |
| BJAB0868_00331 | YP_008211657.1 | Porphobilinogen deaminase | Not tested | AbaR26 | Protein | 2e-47 | 41 |
