Name : plu1678 (plu1678) Accession : NP_928960.1 Strain : Photorhabdus luminescens TTO1 Genome accession: NC_005126 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2001916 - 2004795 bp Length : 2880 bp Strand : - Note : Highly similar to Unknown protein of Photorhabdus and some similarities with Unknown protein DNA sequence : ATGAGTAATCAAGACGCCCTGTTTTCCATCGTTAAAGACAATATTGCCTTTGATACTTTACTCACTCAAGCTAAGACAGT GATTGAGCAACAATCCGGCCAACTTTGGAGCAATACAGGTGAAAGCGATCCCGGTATAACTTTATTAGAAGCCTGTTGTT ATGGCGCGTCTGATTTGGCCTATCGCCTTTCGCTGCCTCTCATCGATCTCCTTACCCCTGAACAGCAAGAACAGACACCG GGCGACGGCATTTTTCCACAGGAATTCGGCCCACAACAAATGCTGACCTGCGGCCCAATTACTGCGGAAGATTATCGCCG GGCCTTATTGGATTTGCATAGCAGCGATAATATTAACAACAAAAGTGAAGGTTATTTTTTCTTTAACGATGTACAGCTAG TTCGTGAACCTGAGAATCAACGCTATGAATACTGGTATAACAAAGAAAAACGTGAATACAGTTTCACTCAAACTCCAGAC AGTCAACAGTTGACACTAAGAGGAAACTACTGGCTTTATTTACTCCCGAACCGGGAAACTCAGACTGACAATACACTGGC TCAACAAAATCTGGCCGCTTTCTTAAAAAACAACCGTAACCTGGGGGAATCTGTCAGTAAAATTATCTGGCTACAACCGA CGGATTTCTTATTACAGCTTGATATTGAACTGAATGATGATGTTAAAGATACCGCTGACATCTTTGCTAAAGTCTATATG ACAACAGAACAGACGGTATTAGCAAAACCATTACGTTATACCACCCAAGCCATGAAAGAATCAGGTTACAGTAATGAAGA AATATTTGCCGGACCCTATTTACATCACGGCTGGATACCTGAATTGCCCACGGCCAAAGATTACACCACGGCTACAGAAT TAAAACTCAGTCACTTAGTTAATCGCTTATTGGCTATCCCAGGGATACAAAATATTACCCGGTTAGCATTAGATAACCAC GATAAAAACATTTCCCCGCTGTCAAATGACAATTGGTCTTGGACAATCGCTCAGGGCTATTACCCCAGATTATGGGGTAA TGATCCATTAAGCTTAATAACTTCACCAACAAGCCCGCTCATTATTACTGCCAAAGGTGGAATAAAAGTCTCCATTTCTA AGCAAGATATAGAAAATAAGATCATTAAAGCGCCATTAATTGAAACACAGCCAGAGTTATTAAACTGGGGAAAACATCGT AAGATCCTGAACTACTATCCGGTCAGCAATAAATTGCCGGCTTGCTATGGATTACAAACCTACGCTGAGACCCAACAACA AATCCACTTGCATCAATTTATGCTGCCTTTTGAACAAATGCTAGCTAATGGCTGCGCTGAACTTGCCATCTTGCCGAAAC TGTTAGCCTTTAAACAACGGGGAAATGCGGTATATGGCGCACAATGGCCTTTTAAAGACAATACTGTTGGTTATAAAGTC CACCAGCAAATCATGCCTAATTTAATCAAACAGCTAAATAATGATGCCCAAATCAATAATGATGACGGTATGCATTGGCA AAACTATGCAAAAGAATTGTTAATCCTGAATTATTTGCTGGAGTATTTTGGTACCCATCGCGCAGCCAGGCCACTTACCA TAGACTTTCTGGATTTTCTCTCTACTCAACGTGGTTATTTAGCACAGCAACCCGAATTAACCTATCAACGTAATAATATC CGTATTGATCAAGTGTCAGCACTACAAAAACGGATTGCCGCCCGTATTGGTCTGGGAGGAGAATGTTTCAAAGAAAAACC CAACTTGGCTAATCTACCTTTCTATCTAATTGAACATCGTCAGCTATTACCGGTCAAACCTGACAATAAATTCGATAGTG AACAGAAGCCCGATAAGCTGGAAATAAAAAGCGTACCCAATTCTAAAAACCAACAATTAATCATTACCCAAAATGGGACA ACGGGCCAGCTATTGCATGGTCAGGTCATTAACTTGATTATTATTGAGGGTGACAGAGAATTTACACTACGAGGCCAAAT GATTACCGATATTACGGGAGATACCTTCTCGCTTGACACTCTCAATAGCACTGATTTAGAGCGCAATCTAAATCGAGTAG AACAAGCATTTGAGCAAGGTAATTTACGCTGGCGCAATAGCCCAGTATGGATGGAAGATATGGATTATCAACTGGTTTAT GCCAGTGACACATATCAAACTGGCGCAAGAGATGAACGCTGGATCACCTCTAGCACCCAAAGCCCCTTTCCCGCCATGAT CGATGTGAATGACGAAATTACGCTGAAATATATTATTTCACCCGATGAGTCATCCACAAAAATATTGGCTAATAGTAATT CTCCCACCGATTATCAGCTTAAAGCACGCGTAGTCCAATTCGACCGAATTAAGGGCTGGATATTAATTAAAAAAATATCA GGGCAACAATATGATTTCCCAAAATCAGAAGACGCATGGCGTTATCGTTGGTACTTTTCCAATGAAAAATACGCATTGGC TGACCGCTTTTCATTTATAGTCAGTGTAGTGATTAATCGTCAGCTTATTGAGAATGATAAGATCGACCCTTATAAACTGG AGGCGTGGGTAAAAGTGGAGATCTTAGCTGAATTCCCGGCACATCTTTCCATGATTTTCCATTGGCTATCACCGGAACAA TTCAATAATTTTGCTGATACTTATAAGCGTTGGCAAAACAATGGCGCGCCTCTGGGTGATGAAGCCTATAATATTTTAGA AACCTTAACGTTAGGGCGTTTACCTTCAGCGGCAACCGGTACGGGTAATATGCGAATTGCCACCGAACAGCAAAGAATAG AGGTAATTGGTGAGTCAGGTACCGAATGGAATGAAAAGGTAATAAAAGACAATCAGTTATTATATGTTCCAAAAATCTAA Protein sequence : MSNQDALFSIVKDNIAFDTLLTQAKTVIEQQSGQLWSNTGESDPGITLLEACCYGASDLAYRLSLPLIDLLTPEQQEQTP GDGIFPQEFGPQQMLTCGPITAEDYRRALLDLHSSDNINNKSEGYFFFNDVQLVREPENQRYEYWYNKEKREYSFTQTPD SQQLTLRGNYWLYLLPNRETQTDNTLAQQNLAAFLKNNRNLGESVSKIIWLQPTDFLLQLDIELNDDVKDTADIFAKVYM TTEQTVLAKPLRYTTQAMKESGYSNEEIFAGPYLHHGWIPELPTAKDYTTATELKLSHLVNRLLAIPGIQNITRLALDNH DKNISPLSNDNWSWTIAQGYYPRLWGNDPLSLITSPTSPLIITAKGGIKVSISKQDIENKIIKAPLIETQPELLNWGKHR KILNYYPVSNKLPACYGLQTYAETQQQIHLHQFMLPFEQMLANGCAELAILPKLLAFKQRGNAVYGAQWPFKDNTVGYKV HQQIMPNLIKQLNNDAQINNDDGMHWQNYAKELLILNYLLEYFGTHRAARPLTIDFLDFLSTQRGYLAQQPELTYQRNNI RIDQVSALQKRIAARIGLGGECFKEKPNLANLPFYLIEHRQLLPVKPDNKFDSEQKPDKLEIKSVPNSKNQQLIITQNGT TGQLLHGQVINLIIIEGDREFTLRGQMITDITGDTFSLDTLNSTDLERNLNRVEQAFEQGNLRWRNSPVWMEDMDYQLVY ASDTYQTGARDERWITSSTQSPFPAMIDVNDEITLKYIISPDESSTKILANSNSPTDYQLKARVVQFDRIKGWILIKKIS GQQYDFPKSEDAWRYRWYFSNEKYALADRFSFIVSVVINRQLIENDKIDPYKLEAWVKVEILAEFPAHLSMIFHWLSPEQ FNNFADTYKRWQNNGAPLGDEAYNILETLTLGRLPSAATGTGNMRIATEQQRIEVIGESGTEWNEKVIKDNQLLYVPKI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
orf23 | AAN64227.1 | Orf23 | Not tested | necrotizing factor locus | Protein | 0.0 | 88 |