|
Name : leuS (PMM0889) Accession : NP_893007.1 Strain : Prochlorococcus marinus CCMP1986 Genome accession: NC_005072 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : 6.1.1.4 Position : 849238 - 851814 bp Length : 2577 bp Strand : + Note : leucine--tRNA ligase; LeuRS; class-I aminoacyl-tRNA synthetase; charges leucine by linking carboxyl group to alpha-phosphate of ATP and then transfers aminoacyl-adenylate to its tRNA; due to the large number of codons that tRNA(Leu) recognizes, the leucyl DNA sequence : GTGATTACTTCTGAAAATACAGATAACAGAGCAACTAATTTATATAAACCATCTGATATAGAGGGTAAATGGCAGAAAAT CTGGGAAGACGACAACTTATATAATACAGATGAGCAAGCAAGTAATAAAGAAAAATTTTATGCCTTATCCATGTTTCCCT ACCCTTCAGGAAACCTTCATATGGGTCATGTGCGAAATTATGTAATAACAGACTTAATTGCACGATTTCAAAGATTTCAG GGCAAAGTAGTGTTACATCCGATGGGTTGGGACGCATTTGGTTTACCTGCTGAGAACGCGGCGATAGAAAGAGGAATAAA TCCTGATAAGTGGACTAAACAAAATATCGCTCATATGAAATCACAATTAAAATTATTAGGTCTTTCTGTTGATTGGGATA GAGAATTTGCCACTTGTGATGAAAATTATTATGTATGGACTCAATTTTTATTTTTGGAATTACATAAAGCTGGTCTTGTT TATCAAAAGGAGTCTGAAGTAAATTGGGATCCGATTGATAATACTGTTTTAGCCAATGAGCAGGTTGATTCAGAAGGCAA ATCATGGAGATCTGGAGCGATAGTTGAAAAGAAACTTTTAACTCAATGGTTTTTAAAAATTACTGATTATGCAGAAGAGT TATTGCAAGATTTAGAAAAATTAAATGAGTGGCCTGAAAGAGTTAAGATAATGCAGGAAAATTGGATTGGTAAATCAATA GGTACAAATATAAATTTTAAAATAAAAGAATTTAAAAAGGAAAAAATACAAGTATTCACAACAAGACCTGATACTTTATT TGGGGTAACTTATTTAGCAATATCAGTTAATCATCCATTAATTAAAAAAATATCTGATAATAAAATTTTAAGTAAACTAG AAAATTTAAAAATCTATTTACAAGAAAGTAAAGATAAAGATCAAAAAAAAATTGGTATTCCAACAAATTTAATAGCTATA AATCCAATAAATTCAAAGGAAATTCCTATCTTGATAGCAAGTTATGTTCTTGATGAATATGGAACTGGAGCTGTTATGGG AGTCCCAGCACATGATGAAAGGGATTTTGAATTTGCCAAAATCAATTCTATTGATATTAAACAAGTAATTATTAAGGAAA AAGATAAAATTACCAGCCAATTAACTAATGCTTTTACGGATAATGGTTTTTTAATCAACTCAAATAATTTTGATGGCTTA AATAATAGTGATGCCAAAAAACATATTTCAGAACATGGTGAACGAAATGGATGGGCTGAAAATAAAATTCAATTTCGTTT GAGAGATTGGTTAATTTCTAGGCAAAGATATTGGGGATGTCCAATTCCAATTATTAAGTGTACTAATTGTGGTTCTGTTC CAGTAAATAAAAAGGATATTCCAGTTAGATTACCAAATGAGATTAAAATATCCTCTAATAAAATTAATTCTCTAGGTAGT AATCAAAGTTGGATTAATACTACATGTCCAAAATGCGGTAATTTGGCGAGTAGAGAAACGGATACTATGGACACCTTCAT GTGTTCATCATGGTATTTTTTAAGATATCCTTCATCAAAATCTTTAACAAAGCCTTTCGAAAAAGAAAAAATTAATAAAT GGTTACCTGTTGATCAATATGTTGGAGGTGTAGAGCATGCAATTTTACATTTGCTTTATGCAAGATTTCTTACCAAAGCC TTAAGGGACAATAATCTTTTTGATATTGATGAACCATTTAAAAGGCTCTTGACACAAGGTATGGTTCAATCTGCAGCTTA TAAAAATTCAATAACTGGAAAATATATCTCTCCAACTGATATTAAAGATATAACTAATCCAAAAGATCCAAAAGACAATT CAAAACTTGAAGTTCTTTTTGAAAAAATGTCAAAGTCAAAATATAACGGTATAGATCCTGAATCTGTAATAAAAAAATAT GGAGCAGATACAGCAAGAATGTTTATTTTATTTAAAGCCCCTCCTGAAAAAGACCTCGAATGGGGAGATTCTGATGTAGA AGGTCAATATAGATTTCTATGTAGAATATGGAAACTTTTCTTAGATTACAGTAATAATGATATTACCCATGAAGCAGATA AACTTAAAAAAGAAAATGAAAGTTCATTATTAAAGTCTATAAATATTGCTATAAAAGAAATTTCTAATGATATAAAAAAC AATCAATTTAATACAGCAATATCAGAATTAATGAAGTTTTATAATTCAATATCCTCGAACTTAAATTATGTAAATAAAGA CTTAAGAAGAGAATCTCTTATGAAATTTTGTATATTATTAGCACCATTTGCTCCTCATATTTCCGATGAAATCTGGCATT TAATTGGTAATTCAAAATCTGTACACCTAGAAAAATGGCCAGTATTCGATGAAGATGCTCTAAAGGAAAATAGCTTTGAA TTAGTAATTCAAATAAATGGAAAAGTAAGAGATAAAATTAATGTAGAAATTAATATTTCTGATGATGAAATTAAGGAAAA AACATTAATTAGACCTAATGTAAAAAAATGGATTGATAATAAAACAATCAGAAAAATAATAATTGTAAAAGGCAGAATTA TAAATATTGTCGTTTAG Protein sequence : MITSENTDNRATNLYKPSDIEGKWQKIWEDDNLYNTDEQASNKEKFYALSMFPYPSGNLHMGHVRNYVITDLIARFQRFQ GKVVLHPMGWDAFGLPAENAAIERGINPDKWTKQNIAHMKSQLKLLGLSVDWDREFATCDENYYVWTQFLFLELHKAGLV YQKESEVNWDPIDNTVLANEQVDSEGKSWRSGAIVEKKLLTQWFLKITDYAEELLQDLEKLNEWPERVKIMQENWIGKSI GTNINFKIKEFKKEKIQVFTTRPDTLFGVTYLAISVNHPLIKKISDNKILSKLENLKIYLQESKDKDQKKIGIPTNLIAI NPINSKEIPILIASYVLDEYGTGAVMGVPAHDERDFEFAKINSIDIKQVIIKEKDKITSQLTNAFTDNGFLINSNNFDGL NNSDAKKHISEHGERNGWAENKIQFRLRDWLISRQRYWGCPIPIIKCTNCGSVPVNKKDIPVRLPNEIKISSNKINSLGS NQSWINTTCPKCGNLASRETDTMDTFMCSSWYFLRYPSSKSLTKPFEKEKINKWLPVDQYVGGVEHAILHLLYARFLTKA LRDNNLFDIDEPFKRLLTQGMVQSAAYKNSITGKYISPTDIKDITNPKDPKDNSKLEVLFEKMSKSKYNGIDPESVIKKY GADTARMFILFKAPPEKDLEWGDSDVEGQYRFLCRIWKLFLDYSNNDITHEADKLKKENESSLLKSINIAIKEISNDIKN NQFNTAISELMKFYNSISSNLNYVNKDLRRESLMKFCILLAPFAPHISDEIWHLIGNSKSVHLEKWPVFDEDALKENSFE LVIQINGKVRDKINVEINISDDEIKEKTLIRPNVKKWIDNKTIRKIIIVKGRIINIVV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 2e-144 | 43 |
