|
Name : ctaD (PMM0445) Accession : NP_892563.1 Strain : Prochlorococcus marinus CCMP1986 Genome accession: NC_005072 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 423492 - 425117 bp Length : 1626 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGACGATATCAATTGATCCACAGGATTCTAATCTCAAAAGTCTTCAACCTAAAGGATGGCTTAGATATTTTAGTTTTAG TCTCGATCATAAAGTAATTGGTATTCAATATCTTGTATGCGGGTTTCTTTTTTATTTAATTGGAGGAACTTTGGCGAGTG CAATAAGAATTGAATTAGCAAGTCCAATGTCGGACTTTATGCCTAGAGATGTATATAACCAAGTTTTAACATTACATGGA ACAATAATGATTTTCTTGTGGATTGTTCCTGTAGTAAATGGTGCATTTGGGAACTATTTAATTCCTTTTTACGTTGGAGC TAGAGATATGGCATTCCCAAGATTGAATGCTGTAGCTTTTTGGCTGATACCTCCTTCCGGTTTAATGTTAGTAGCGAGTT ATTTTGTTGAAGGGGCTGCACAGGCAGGATGGACGGCTTATCCACCTTTGAGTATAACCACCCCTCAATCAGGACAAATC ATTTGGATAATGAGTGTTTTATTACTGGGAGGCAGCTCTATCTTTGGAGGGATAAATTTCATTGCAACAATTATCAAATT AAGGCGACCGGGATTAAAGCTGATGCAATTACCTATGTATTGTTGGGCGATGTTAGGCACAAGTTTATTAGTAGTTTTGT CAACTCCAGTTTTAGCTGGAACATTAATATTACTTAGCTTTGATATTGTTGCTCATACCGGTTTCTTTAACCCTGTTTTA GGCGGAAACGTAGTTGTTTACCAACATTTATTTTGGTTCTATTCTCATCCAGCTGTTTACATAATGGTTCTTCCTGCTTT CGGCCTAGTAAGTGAAATTCTTCCAGTGCATTCAAGAAAGCCACTTTTTGGATATACCACAATGGTTTTTTCAATAATGG GAATAGTTGTGCTTGGTCTAGTTGTGTGGGCTCATCATATGTTTACAAGTGGTACTCCTCCTTGGATGAGATTATTCTTT ACTATTGCGACAGCATTTATAGCAGTTCCGACTGGAATTAAATTTTTTAATTGGGTTGCAACCTTATGGGGTGGGAAAAT ATCTATCAATAGTGCAATGTTATTCTCATGTGGATTTATTATAAATTTTGTATTTGGCGGTATTACAGGAGTTGCTCTTG CTCAAGTACCTTTTGATATTCACGTGCATGATACATATTTCGTTGTTGCTCACTTCCATTACATAGTTTATGGAGGGACT GTTTTTATTATCTTCTCATCTATTTATCATTGGTTCCCAAAGGTAACCGGCAAGTTAATGAGCGAAAAACTGGGGATACT ACATTTTGCCATAACTTTTATTGGCTTTAATTTATGCTTCGCTCCTCAACATTGGCTTGGTCTTAATGGAATGCCTAGAA GAGTTGCGGAATACGATCCACAATTTCAATTTGTTAATCAGATTAGTAGCCTAGGAGCTCTCTTAATGGCTATAAGTACT ATCCCATTCTTAGTAAATATATTCTTAAGTATTAAAAATGGGAAGGATTCTGGGGATAATCCTTGGAATGCTTTAACTCC TGAATGGTTAACATCCTCTCCCCCACCTGTTGAAAATTGGGAAGGCGAAGCACCTTTAGTTGAAGAACCTTATGGTTATG GCAAACCAATTTCTCAAGAAAATTAA Protein sequence : MTISIDPQDSNLKSLQPKGWLRYFSFSLDHKVIGIQYLVCGFLFYLIGGTLASAIRIELASPMSDFMPRDVYNQVLTLHG TIMIFLWIVPVVNGAFGNYLIPFYVGARDMAFPRLNAVAFWLIPPSGLMLVASYFVEGAAQAGWTAYPPLSITTPQSGQI IWIMSVLLLGGSSIFGGINFIATIIKLRRPGLKLMQLPMYCWAMLGTSLLVVLSTPVLAGTLILLSFDIVAHTGFFNPVL GGNVVVYQHLFWFYSHPAVYIMVLPAFGLVSEILPVHSRKPLFGYTTMVFSIMGIVVLGLVVWAHHMFTSGTPPWMRLFF TIATAFIAVPTGIKFFNWVATLWGGKISINSAMLFSCGFIINFVFGGITGVALAQVPFDIHVHDTYFVVAHFHYIVYGGT VFIIFSSIYHWFPKVTGKLMSEKLGILHFAITFIGFNLCFAPQHWLGLNGMPRRVAEYDPQFQFVNQISSLGALLMAIST IPFLVNIFLSIKNGKDSGDNPWNALTPEWLTSSPPPVENWEGEAPLVEEPYGYGKPISQEN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 6e-99 | 46 |
