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Name : clpB (Bfl182) Accession : NP_878485.1 Strain : Candidatus Blochmannia floridanus Genome accession: NC_005061 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent protease Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG0542 EC number : - Position : 214168 - 216786 bp Length : 2619 bp Strand : + Note : COG caterory=O DNA sequence : ATGAGATTAGATCGTTTTGATCGAAGTTTTCAATTAGCGTTATCTGATGCCCAATCTATTGCTATTGGTAAGGATAATCA ATTTATAGAACCTGTTCATGTAATGTATACTTTTTTAAAGGAAAAAAAATATAAATCGATACGTAATTTGTTAATACATG CAGGATCAAATGTAGATCAATTATATAAATCTGTGGAACAAGTGTGTAATGATTTGCCACGGGTAGAAAGTGTTGATGGA GATAGAGAGGTGCAATGCTCTCATGCTTTAGTAAAAATTTTAAATTTATGTGATAAATTAGCGCAAAAATATCACAGTAA TATTATTTTTTCAGAAGTATTTATTATAGCTGCTCTTCAATCACAAGATGTTTTAAGTATTTTGTTAAAAAAATCTGGTA TTGTTAAAGAATTATTAGAAAAATTAGTACAATATGAACAGAGTAATTATTCTATTCATGATGATAGTTTTAAAAATAGA ACACAAATATTAGAACAATTTACTGTAGATATAACTTCTCTTGCTGAACAAAATAATCTTGATCCTGTAATTGGTAGGGA TGAAGAAATTAGAAGAACAATTCAAGTTTTGCAAAGGCGTACTAAAAATAATCCTGTTCTTATAGGAAATCCAGGAGTGG GTAAAACTGCTATTGTGGAGGGGTTGGCTCAACGTATTATCAATAAAGAGGTTCCAGAGGGATTAAAAAATAGTCGAATA TTATCTTTAGATATAGCCGCGTTGTTAGCTGGTACTAAATATCGGGGAGAATTTGAAGAGCGTTTTAAAAAAGTATTGTA TGCTGTATCTAAAGATAATAATACTATTTTATTTATTGATGAGTTGCATGTTATGGTTGGAGCTGGAAAAACAGATGGAT CTATGGATGCTAGTAATATGATTAAACCAAAATTAGCAAGAGGTGAATTACATTGTGTTGGTGCGACTACTCTTGATGAA TATAGTAGATATATTGAAAAAGATGCTGCTTTAGAAAGACGTTTTCAAAAAATATTTATTATTGAACCTAATATTGAAAA TACTATAGCTATTTTAAGAGGGCTGAAGGAACGTTATGAGTTGCATCATAATGTACATATCACTGATCCTGCGATAGTAG CCGCAGCTACTTTATCGAATAGATATATTTCAGATCGTCAATTACCAGATAAGGCTATTGATTTAATTGATGAAGCAGCA TCTAGTATTCGTATTCAAATTGATTCTAAACCAGAAGATTTGGATAGGCTTGATCGTCGTATTATACAATTGAAATTAGA GTGTCAGGCGTTGAAAAAAGAGTCAGATGAGTTAAGCAAAAAACGTTTAGAGATTTTAAGTATGGAATTGTCACAGAAAG AACAGGAGTATAGTGTACTTGAATCAGAATGGAAACGTGAAAGGAGTTCTTTATTTGATATTCAAAATATAAAATCAGAT TTAGAGAAAGCAAAGACTATTTTAGATCAGTCTCGTCGTATTGGCGATTTGGCTCAAATGTCAGAATTACAATATGGACG TATACCAGAATTGGAAAAGAAGTTGTTTAATGCAATTCAATCTAGTAATAAAAAAATGCGTCTATTGCGTAATTATGTGT CTGAGGTAGAAATTGCTGAGGTGTTGTCCAAATGGACAGGTATACCTATATCTAGGATATTAGCAAATGAAAAGAATAAA TTGTTAAATATGGAGACAATATTACATCAGTTAGTAATTGGGCAAGATGAGGCAGTACGAGTTATATCGAATGCGATTCG TAGAAGTCGATCTGGATTATCAGATCCTAAGAGGCCTATAGGTTCTTTTATGTTTTTAGGACCAACTGGTGTTGGTAAGA CTGAGTTATGTAAAGCATTATCACAATTTTTGTTTGATACTGACAATGCTATGGTGCGTATTGATATGTCTGAATTTATG GAAAAACATTCGGTTTCAAAATTACTTGGAGCTCCTCCCGGTTATATTGGTTATGAAAGTGGAGCTTATTTAACTGAATC TATACGTCGTCGCCCTTATTCTATAGTATTATTAGACGAAATTGAAAAAGCTCATTTAGATGTTTTTAATATTTTATTAC AAGTTTTAGATGATGGAAGATTAACAGATAATCAAGGTCGTATGGTGGATTTTAATAATACTGTTATAATTATGACATCT AATTTAGGTTCAGATTTGATTCAAAAAAAATTTGATATATCAGATTATGATACTATGAAGAAAACTGTGTTAAATGTAGT TAATCAATATTTTCGACCGGAATTCATTAATAGAATAGATGAAATAGTAGTATTTCATCCTCTTAGCATCAAACATCTTA TTGATATTGCAAATATTCAATTGAAGTATTTATATTCTAGATTAGAAGAGAGAGGTTATCCTAGAACTGGTATTACCAAC AAAGCATTATTATTTTTATCTAAAATTGGTTTTGATCCTATATATGGTGCACGTCCTTTAAAACGTATTATACAACAATA CATTGAGAATCCGTTATCTCAAAAGATATTATCCGATGATTTATTACCGGGAAGAAGTATTACTATAGATGTTCAAAATG ATAATATTGTATTTATTCAGAATGATGTTATAGATGATAAGGATATCTATATAAATTGA Protein sequence : MRLDRFDRSFQLALSDAQSIAIGKDNQFIEPVHVMYTFLKEKKYKSIRNLLIHAGSNVDQLYKSVEQVCNDLPRVESVDG DREVQCSHALVKILNLCDKLAQKYHSNIIFSEVFIIAALQSQDVLSILLKKSGIVKELLEKLVQYEQSNYSIHDDSFKNR TQILEQFTVDITSLAEQNNLDPVIGRDEEIRRTIQVLQRRTKNNPVLIGNPGVGKTAIVEGLAQRIINKEVPEGLKNSRI LSLDIAALLAGTKYRGEFEERFKKVLYAVSKDNNTILFIDELHVMVGAGKTDGSMDASNMIKPKLARGELHCVGATTLDE YSRYIEKDAALERRFQKIFIIEPNIENTIAILRGLKERYELHHNVHITDPAIVAAATLSNRYISDRQLPDKAIDLIDEAA SSIRIQIDSKPEDLDRLDRRIIQLKLECQALKKESDELSKKRLEILSMELSQKEQEYSVLESEWKRERSSLFDIQNIKSD LEKAKTILDQSRRIGDLAQMSELQYGRIPELEKKLFNAIQSSNKKMRLLRNYVSEVEIAEVLSKWTGIPISRILANEKNK LLNMETILHQLVIGQDEAVRVISNAIRRSRSGLSDPKRPIGSFMFLGPTGVGKTELCKALSQFLFDTDNAMVRIDMSEFM EKHSVSKLLGAPPGYIGYESGAYLTESIRRRPYSIVLLDEIEKAHLDVFNILLQVLDDGRLTDNQGRMVDFNNTVIIMTS NLGSDLIQKKFDISDYDTMKKTVLNVVNQYFRPEFINRIDEIVVFHPLSIKHLIDIANIQLKYLYSRLEERGYPRTGITN KALLFLSKIGFDPIYGARPLKRIIQQYIENPLSQKILSDDLLPGRSITIDVQNDNIVFIQNDVIDDKDIYIN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| clpC | YP_005163377.1 | ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit | Not tested | Not named | Protein | 2e-158 | 47 |
