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Name : lldP (HH0649) Accession : NP_860180.1 Strain : Helicobacter hepaticus ATCC 51449 Genome accession: NC_004917 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : 2.7.1.69 Position : 626953 - 628728 bp Length : 1776 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGGTGCTTGGGAACAGATTTATGATCCACTTAACAATATGTGGTTAAGTGCAGCAGTAGCTTTTATACCTATTGCGTG TTTTTTATTATGTTTGCTTGTTTTAAAGCTTAAGGGATATATAGCGGGCTTTATCACAGTGATTGTAGCGACTTTGGTGG CATTTTATGCTTACAAAATGCCTTTTTCACTCATAGGTGCTTCTTTTGTGCAAGGATTTGCACAAGGAATGTGGCCTATT GCTTGGATTATTATTGCAGCAATCTTTCTCTATAAGCTTTCGGTGAAATCTGGCTCTTTTGAAGTAATTAAACAAAGTGT AATGACTATCACGCCTGATCATAGAATCCAAGTGATTTTGATTGGATTTTGTTTTGGTTCATTTTTGGAGGGAGCCATTG GCTTTGGCGGACCTGTTGCAATTACAGCAGCACTCCTTGTGGGCTTGGGGCTTCGTCCATTATATGCAGCAGGACTTTGT TTGATTGCAAATACTGCTCCTGTGGCTTTTGGAGCAGTTGGGATTCCAATTATTGCAATGAGTAATCTTGTAGGTGTAGA GCAATATTCTGTTGCGGCAATGGTTGGGCGTATGCTTGTGCCTTTGAGTTTAACAATCCCTTTCTTTATTGTATTTTTAA TGGACGGAATCAAAGGTGTGAGAGAAACTTTCCCGGCAATTTTGGTAGCAGCAGTGAGCTTTACAGCTACTCAATTTATT AGCTCAAACTATCTTGGTGCAGAGCTTCCTGATATAGTTTCTGCTGTAGTATCTTTAGTTTGTACCACAGCTTTTTTGAA GTTTTGGTCTCCCACAAATATATTTAGGCTTGATGATTTAAAAGATTTTTCAAACCACGAAAAACTTGAATTTGTTAAAG TCTTTAAAGCGTGGCTTCCGTTTATTTTGCTCATTATTTGTGTAATTATTTGGACTCAGCCTTGGTTTAAAGCAATATTT GAAGCAAAGAAAATTTTATTTGAGAATCCAGATTTATTGATAAATGGAGCTATTGCTTTACCTAAAGAGAGTTTCTTTTT TAGCATAAAGCCTATAATTGATGATGCGGGAGCAACGATAGGTTATTATCAAATTGGAGCCTTAAACTATACCCAAGTGA GTATGGCTTTCAATCCTCTTACAAGTGTCATAACTGACCCTAGCGGCAATCCTATAAAAATTGATTTGCCCATTAATCTT ATTGCGCTTCAAGCAGGCACAGCGATTTTAGTAGCCGCTTTTTTAACCATCGCTTTTTTGAGAATAAAATCAAGTGTTGC TGAAGAAGCACTTGGAGATACCTTAAAAGAAATGGCAATTCCTTGTATCACAATTGGGCTTGTTGTTGCCTTTGCTTTTA TCTCAAAAAATAGTGGTATGAGCGCAACTTTGGGTATTGCTTTTGCAAAAACAGGCGATTTATTTGCTTTCTTTAGTCCA GTTATTGGGTGGCTTGGTGTGTTTATCACAGGAAGTGATACAAGCTCAAATCTACTCTTTGGTCCGCTTCAACAAGTTAC TGCACAAGAGCTTGGTATTAAAGAAACATTATTTCTTGCAGCAAATTCTGTAGGTGGTGTTGTAGGTAAAATGATTTCTC CACAAAGTATCGCGATTGCTTGTGCAGCGGTTGGGTTAGTTGGTAAAGAATCAGATTTATTTAAATTTACTTTAAAATAT TCTCTTGCATTTATCATTCTTATTGGTATTTGGACAGCTATTATTGCTATGTTTATTCCTTATATCATTCCCGAAGCGGT AGCCCTGGTTAAATAG Protein sequence : MGAWEQIYDPLNNMWLSAAVAFIPIACFLLCLLVLKLKGYIAGFITVIVATLVAFYAYKMPFSLIGASFVQGFAQGMWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGSFEVIKQSVMTITPDHRIQVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAALLVGLGLRPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPIIAMSNLVGVEQYSVAAMVGRMLVPLSLTIPFFIVFLMDGIKGVRETFPAILVAAVSFTATQFI SSNYLGAELPDIVSAVVSLVCTTAFLKFWSPTNIFRLDDLKDFSNHEKLEFVKVFKAWLPFILLIICVIIWTQPWFKAIF EAKKILFENPDLLINGAIALPKESFFFSIKPIIDDAGATIGYYQIGALNYTQVSMAFNPLTSVITDPSGNPIKIDLPINL IALQAGTAILVAAFLTIAFLRIKSSVAEEALGDTLKEMAIPCITIGLVVAFAFISKNSGMSATLGIAFAKTGDLFAFFSP VIGWLGVFITGSDTSSNLLFGPLQQVTAQELGIKETLFLAANSVGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESDLFKFTLKY SLAFIILIGIWTAIIAMFIPYIIPEAVALVK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 9e-99 | 47 |
