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Name : lp_3136 (lp_3136) Accession : YP_004890690.1 Strain : Lactobacillus plantarum WCFS1 Genome accession: NC_004567 Putative virulence/resistance : Virulence Product : SgaT/UlaA family sugar-specific permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2805956 - 2807332 bp Length : 1377 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGCAAGCTACATTAAATGCCATTATTAGTATTGTTCGTACACCAGCTATTTTGGTTGGATTAATTGCTATTCTAGGACA GGCATTACAAAAGAAGTCCTTTTCTGACACAGTCAGCAGTGGAATTAAGACCTTCATTGGTTTCTTAGTTTTGAGCGGTG GTGCTGGTATTGTCAGCACTTCATTAGCGCCGATGAGCAAGATGTTTATGCATGCTTTTGGTGTTCAGGGAGTTGTTCCT AATAATGAAGCCGTCGTGGCAACCGTTTTAGTCGAATATGGGACAGCAACGGCTTTAATTATGTTGGTAAGTATGATTGT TAATGTAATCTTGGCACGATTTAGTCATTTTAAATACATCTACCTTTCAGGCCACGTAATGTTGTATATGGCTGCAATGC TTGCAGTTATTATGCAAGTAGCAGGTTTTGGATTCGCTACAGAAGTGTTATTCGGAGGTCTTATTTTAGGAATTTGGGAT ACAGTTAGCCCTGCTTTGGTACAACCGTTTCTACGTGAAGTAACAGGTGGCAATACAGTGGCGTTAGCACATACCGGTGA TTTTGGTTATGCGTTTGCTGGATTAATCGCTAAGTTTACTGGTGACAAGCGTAAGTCAACTGAAGACTTAAATATTCCAA AGAGTGTATCGTTTCTACGTGATTCAACGGTTGCAATTACCATTACAATGGCCGTTATTTACATTATTTTGGCTTTGTTT GCCGGGCCAGAATTTGTTGGAAAAATGAGTTCAGGGATGAATTATATTGTATTTGCCTTAATTCAGGCCGGAACTTTTGC AGGTGGTGTTTACGTTATTCTTGCAGGTGTGCGGTTAATTTTAAATGAAATTATTCCTGCATTTAAGGGGATTTCGGAAA ATCTGGTGCCTAACTCTGTACCAGCACTAGATTGCCCAATTATTTTCCCATATGCGCCAAACGCAACGATTGTTGGCTTT TTTGCTAGCTTTATTGGCGGAGTTGTTAGTATGTTCATTATGATTGGCTTACACACAGTTATTGTCATTCCGGGTGTTGT TGCACACTTTATGTGCGGTGCTACTTCTGGTGTCATTGGCAATGCTGTTGGGGGACGGCGTGGCGCAATTATTGGCGCAT TTTCTCAAGGTATTTTAATCAGCTTTCTTCCATTAGCCTTACTACCGGTTCTTGGAAAAATTGGTTTAGGTGGTGCAACC TTCTCAGATGCTGACTTTGGTGTGATTGGTTCTTTGATTGGCTGGTCGGGTGTTAACGGTGGCGTTGTAATGATTATTGC CGCGATTGTTATTTCGCTCATCTTATTTATTGTTGCTTCGATTATTGCAAGTAAACATAGCGCTGATAAGACCGGGCAAA ATAAGGCTAATGCCTAG Protein sequence : MQATLNAIISIVRTPAILVGLIAILGQALQKKSFSDTVSSGIKTFIGFLVLSGGAGIVSTSLAPMSKMFMHAFGVQGVVP NNEAVVATVLVEYGTATALIMLVSMIVNVILARFSHFKYIYLSGHVMLYMAAMLAVIMQVAGFGFATEVLFGGLILGIWD TVSPALVQPFLREVTGGNTVALAHTGDFGYAFAGLIAKFTGDKRKSTEDLNIPKSVSFLRDSTVAITITMAVIYIILALF AGPEFVGKMSSGMNYIVFALIQAGTFAGGVYVILAGVRLILNEIIPAFKGISENLVPNSVPALDCPIIFPYAPNATIVGF FASFIGGVVSMFIMIGLHTVIVIPGVVAHFMCGATSGVIGNAVGGRRGAIIGAFSQGILISFLPLALLPVLGKIGLGGAT FSDADFGVIGSLIGWSGVNGGVVMIIAAIVISLILFIVASIIASKHSADKTGQNKANA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 1e-91 | 51 |
| unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 1e-91 | 51 |
| vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 1e-91 | 51 |
