Name : CTC02306 (CTC02306) Accession : NP_782847.1 Strain : Clostridium tetani E88 Genome accession: NC_004557 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sodium/glutamate symport carrier protein Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG0786 EC number : - Position : 2433428 - 2434711 bp Length : 1284 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGAGTTTATTATTATTATATAAATCTAAGTAAGGTGCTAAGGAGGGTTTTTATGAAAAGGGAAATTATAGAAGGTAT ATTAACTTTAAAAATTGACATGGTAACTACTTTAACACTAGCTATTCTTATGTTCTTTTTAGGAGATTTATTAAAAAAGA GAGTAAATTTCTTTGAAAGATTTTGTATTCCTTCTCCTGTTATAGGAGGACTTTTATTTTCTATATTTACTTTAATATTA AAACAAGCTAATGTAATTACTATAACTATGGATGCTACATTCCAATCGCCCTTTATGTTAGTGTTTTTTACTACTATAGG ACTTGGAGGAAGCTTTTCTTTACTTAAAAAAGGTGGAAAACCTTTAATTATTTATTGGGCATTATGTGGTATATTAGCAG TATCACAAAATTTAATAGGGGTATATATGGCGAAAGTTGTTAATTTACATCCTCTATTAGGAGTACTTATGGGAGCAGCA TCTATGGAAGGGGGACATGGTGCAGCAGCAGCCTTTGGTAATGATGTGGAAAAATTAGGAATAACAGGAGCTACCACTGT AGCATTAGCAGCGGCAACTTTTGGTTTAATAGCAGGAGGGTTAATTGGAGGACCAATAACTAAAACACTTATAGATAAGT ACAATTTAAAACCTTCTGAAGAAGAACAAAAAGAAGATGTTTCTTATAAAGAAGTTGCAGGAATAACAGATAAGGGAAAC ATAACAGCATATGGATTTTTAATGCATTTAGGAATAATAACTGTATGTATGACATTAGGATCTATTGCAGGCGGATGGGT AAGAGCAGGTGGAACAGTTTTACCTGGATATGTAGGAGCTATGTTTATAGCAGTTATATTTAGAAATTTAAATGATAAAT TTAACTTTATAAAATTGGATTTTTATACAATAGATTTAATGGGAGATATAGCTTTAAGTATTTTCTTATCTATGGCCCTT ATGACATTAAAGTTATGGGAGTTAGCTAATTTAGCAGGTCCTATGTTTGTAGTTTTAATTACACAAGTTGTATTCATAGC TTTATATACAGTATTTGTAACCTTTAGATTATTAGGTAAAGATTTTGATGCAGCTATAATGTGTGCTGGGATGTTGGGAC ATGGTCTTGGAGCTACACCAAATGCTATAGCAAATATGAGTACTGTTTCTGAAAAGTATGGACCATCCACAAAAGCATTT TTAATAGTACCTTTAGTGGGTGCCTTTTTAATAGACTTAATAGGAATACCAAATATTATTTACTTTATCAATGTTTTTAA ATAA Protein sequence : MRVYYYYINLSKVLRRVFMKREIIEGILTLKIDMVTTLTLAILMFFLGDLLKKRVNFFERFCIPSPVIGGLLFSIFTLIL KQANVITITMDATFQSPFMLVFFTTIGLGGSFSLLKKGGKPLIIYWALCGILAVSQNLIGVYMAKVVNLHPLLGVLMGAA SMEGGHGAAAAFGNDVEKLGITGATTVALAAATFGLIAGGLIGGPITKTLIDKYNLKPSEEEQKEDVSYKEVAGITDKGN ITAYGFLMHLGIITVCMTLGSIAGGWVRAGGTVLPGYVGAMFIAVIFRNLNDKFNFIKLDFYTIDLMGDIALSIFLSMAL MTLKLWELANLAGPMFVVLITQVVFIALYTVFVTFRLLGKDFDAAIMCAGMLGHGLGATPNAIANMSTVSEKYGPSTKAF LIVPLVGAFLIDLIGIPNIIYFINVFK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
gltS | NP_273147.1 | sodium/glutamate symport carrier protein | Not tested | IHT-A | Protein | 2e-48 | 43 |