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Name : lysS (bbp389) Accession : NP_777996.1 Strain : Buchnera aphidicola Bp (Baizongia pistaciae) Genome accession: NC_004545 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : 6.1.1.6 Position : 448844 - 450346 bp Length : 1503 bp Strand : - Note : COG1190; lysine-tRNA ligase; LYSRS DNA sequence : ATGTTGATAAATGAAGAAAAAGAGCGTAGGGAAAAATTAAATTATATAAAAAAACATGGATATAATTTTCCAAATGATTT TAAGCCAAAAAATAATTTTTCAGATTTGACACAAAGATATAAAGATTATACGAGAGATCAACTGTTTTCATTAAAAATTT GTGTTAGCGTAGCTGGACGGATGACAAATAAGCGTATTATGGGTAAAAGTTCTTTTTTTATATTAAAAGATTTTGAAGGA GAAATTCAATTATATATTCAAGAGAATTTATTTGCTTTGAATTTTTATAAACAGTTTGTTAAAAAATGGGATTTAGGTGA TATTTTGGGAGCAAAAGGAAAATTGTTTAAAACAAGAACTGGAGAGTTGTCTATTCATTGCACAGAAATAAAATTATTAA CTAAAGCATTAAAACCTTTGCCAAGTAAATTTCATGGATTGTCTGATCAAGAAACTAGATATCGACAGAGGTATTTAGAT CTTATTAGTAATAGGACATTATGTTCTATTTTTAAAATTAGGTCTTTAATTTTTATTAATATTAGAAAGTATATGTTGAA AAAAAAATTTTTGGAAGTAGAAACACCTATGATGCAAAATATTCCTGGGGGGGCTTCTGCACGCCCGTTTATTACTCATC ATAATACTTTAGAGATAGATTTATATTTAAGAATTTCACCTGAATTGTATTTAAAAAGATTAATTGTTGGAGGTTTTAAT AAAATTTTTGAAATTAATAAAAGTTTTCGAAACGAAGGTATATCGACACGTCATAATCCAGAGTTTACAATGATGGAAGT GTATATGGCTTATTCTAATTACCATGACATGATGAATTTTACTGAAAAGTTATTGATGTTTTTAGTAAAGGAAATTGTGG GTAATAGTCAGGTTAAACATGGTACTAATATTATTGATTTTAAAAAAAAATTTTTTAGGTGTACTCTTAAAGAGGCAATA TTAAAATATAATCCTAGTATTAGATTATCAGATTTAAATGATGAAGTAAAAATGAATAAAATTGTAAAGAAATTAGGAAT TAATGTCAAAAAAAAATTAAACGCAGGTCAGTTGATTCTTGAAATATTTAATAAAACAGTTGAAAAAAAATTAATTCAAC CTACCTTTATTTTGGATTATCCAGTAGAAGTTTCTCCATTGTCTAGAAGAAGTGATGTTAATAAAAATGTTGTGGATCGT TTTGAATTATTTATTTCTGGTTATGAAATTGGTAATGGATTTTCAGAGTTAAATGATGCAGATGATCAAAAAAAACGGTT TTTAATGCAATGTAAACTATCTCATAATATTAATAATTTAAATAAAATTAGTTCTTTTGATAAACACATTTTATATGATA GTGATTATATAACTGCTTTAGAATATGGATTACCACCAACGTCAGGTTTAGGAATAGGAATAGATCGACTAACAATGTTA TTAACTAATCAAAAAAGTATTCGTGATGTAATTTTTTTTCCGATATTAAAGCCTTCAGTCTGA Protein sequence : MLINEEKERREKLNYIKKHGYNFPNDFKPKNNFSDLTQRYKDYTRDQLFSLKICVSVAGRMTNKRIMGKSSFFILKDFEG EIQLYIQENLFALNFYKQFVKKWDLGDILGAKGKLFKTRTGELSIHCTEIKLLTKALKPLPSKFHGLSDQETRYRQRYLD LISNRTLCSIFKIRSLIFINIRKYMLKKKFLEVETPMMQNIPGGASARPFITHHNTLEIDLYLRISPELYLKRLIVGGFN KIFEINKSFRNEGISTRHNPEFTMMEVYMAYSNYHDMMNFTEKLLMFLVKEIVGNSQVKHGTNIIDFKKKFFRCTLKEAI LKYNPSIRLSDLNDEVKMNKIVKKLGINVKKKLNAGQLILEIFNKTVEKKLIQPTFILDYPVEVSPLSRRSDVNKNVVDR FELFISGYEIGNGFSELNDADDQKKRFLMQCKLSHNINNLNKISSFDKHILYDSDYITALEYGLPPTSGLGIGIDRLTML LTNQKSIRDVIFFPILKPSV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 1e-121 | 55 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | NP_777996.1 | lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 6e-122 | 55 |
