|
Name : mutS (bbp380) Accession : NP_777987.1 Strain : Buchnera aphidicola Bp (Baizongia pistaciae) Genome accession: NC_004545 Putative virulence/resistance : Virulence Product : DNA mismatch repair protein MutS Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0249 EC number : - Position : 437485 - 439887 bp Length : 2403 bp Strand : - Note : This protein performs the mismatch recognition step during the DNA repair process DNA sequence : ATGAGTAAAATAATAATGAATAAAAAAAACAATGATACTCCGATGATAAAACAGTATTTATCATTAAAATTGCATTATCC TAATATGTTTTTATTTTATAGATTAGGTGATTTTTATGAATTATTTTTTGATGATGCTAAACGAATTTCTTTAATGTTAG ATATTACGTTGACTAAACGGGGCTATTCTTCACAAAAAGAGATTCCGATGGCTGGTATTCCATATACTTCATTAAATCGT TATTTGTCTAAATTATTAAAAATAGGTGAATCAGCTGTAATATGTGAACAAACTCATATAATCGATAAACGTACTGGTTT AATTGAACGAAAAATTTCGAGGGTAGTGACCCCTGGAACAGTAATTGATGAAGAATTTTTAAGTGAAACTAAAAATAATT TATTAGGATCTGTATATTATTCTAAAAAAAGATTTGGATATGCTACATTAGATTTATGTTCTGGGAATTTTTATATTTCT GAATATGATACGTTTGAAAGTTTTATATCAGAGTTGCAACGTACAGATCCAGAAGAGTTATTAATACAAGAAGATTTTCT TTATATGAATTTTTTTGAAAAAAGAAAAGGTATTCGACTATGCAAGTTAAATGATTTTAACATTGATAGTGCATATCAGC AATTAAAATGTCATTTTAAGACTAAAAATTTAAAAAGTTTTGGAGTATATCAGAATAATTTAGCTATATCTGCAGCGGGT TGTCTATTAAAATATTTAAAATTTATTCAATATTCGTTATTACCTCACGTAAAATCAATAAAAGTAAGGTATGATTGTAA TCATATTTTTATGAATTCAGCTACTCGCAAAAATTTAGAAATTATTAATAATATTTCTGGAAAAAAAGAACATACATTGT TGTCTATTCTTGATAATACGGCTACACCAATGGGTGGTAGATTATTACGAAAATGGTTAAGTGCTCCTATAAAAGATATT AAAATTATTAATAAGCGGCATAATATAATTAAATCTTTAAAAACTGTTTATATGTCTTTATCACTTCTACTAAAAGGAAT AGGAGATTTAGAAAGAATTATATCTAGAATAGCATGCAGGTCTGCTTCACCTAAAGATTTTGTTTCTATGAGATCAGCTT TACTTCAATTTTCTAAGATTATTTTTGTATTAAACAGTACTAAGAGTAAAACATTAGAGCTAATAAGTTGTAAGATAAAA GAATATAATTCAATATTAATTTTATTACGACGTTCTTTAAAAGTTTGTCCTTCTAAAACAATTAAAGAAGGTAATGTTAT TTCTGAAAACTATAATAAAGATTTAGATAAATGGAGAAAAATAGCTAATAATGCTTCGGAGTATTTACAGTATTTTGAAG TTAGTGAGAGAAAACGGTTGCATATAACGTCATTAAAAGTTAACAATAATAGAGTATTGGGTTATTATGTTCAAATTAGT AAAAAAGATATTAAGTTAGCACCTAATAATTATAAAAAAATTCAAACTTTGAAGCATTGTGTTAGATATTCTACGTTAGA ATTATTAGATTATGAAAACAACGTGAATAATGCTAAAGATAAAGTATTAGAAATAGAAAATTATTTGTATAATGAATTAT TTGATTTTATTATTCCATATATAGATTCATTAAAAATAAGTGTAAATACTATATCTGAATTAGATGTTTTAAACAATTTA ACCGAAAGAGCTTGCGTATTGAATTATGTTTGCCCGGTAATTTCTGATGAATATGGTATATTGTTAACTGATAGTCGTCA TCCAGTTGTAGAAAATCTATTAAAAACTCCATTTGTTAAAAATTCGATTAATTTATCTAAAAGTTCTAATATGTTAATTA TTACAGGTCCTAACATGGGTGGTAAAAGTACCTATATGCGTCAAATAGCATTAATTGTTATTATGGCTTATATAGGAAGT TTTGTTCCTGCTAAGTATGCACGTATTGGATTATGTGACAAAATTTTTACTAGGATTGGTTCTGCAGATAATTTAGCTTA TGGAGAATCAACCTTTATGATGGAGATGATAGAAATGTCAAGTATCTTGCGTAATTCAACATCAAATAGTTTAGTGTTAA TAGATGAGTTAGGAAGAGGTACATCGATGCATGACGGTTTATCATTAGCTTGGGCATGTATAGAATACTTAGCAGGAAAG ATAAATGCTATGACTTTGTTTTCTACGCATTATTTTGAATTAACTAAATTAAAAAATTATTATTCTAATATTAGGAATAT GTATTTTGATGTTTTAGAACACAATAACGAAATTGTTTTTACTTATGTTATAAAAAATGGTTTTATTAATAAAAGTTACG GATTAGTTGTTGCTGCATTAGCTAAGTTACCTAAGTGTATATTATTATCTGCTAAAAAAAAATTAAAAGAATTCTATCCC TAA Protein sequence : MSKIIMNKKNNDTPMIKQYLSLKLHYPNMFLFYRLGDFYELFFDDAKRISLMLDITLTKRGYSSQKEIPMAGIPYTSLNR YLSKLLKIGESAVICEQTHIIDKRTGLIERKISRVVTPGTVIDEEFLSETKNNLLGSVYYSKKRFGYATLDLCSGNFYIS EYDTFESFISELQRTDPEELLIQEDFLYMNFFEKRKGIRLCKLNDFNIDSAYQQLKCHFKTKNLKSFGVYQNNLAISAAG CLLKYLKFIQYSLLPHVKSIKVRYDCNHIFMNSATRKNLEIINNISGKKEHTLLSILDNTATPMGGRLLRKWLSAPIKDI KIINKRHNIIKSLKTVYMSLSLLLKGIGDLERIISRIACRSASPKDFVSMRSALLQFSKIIFVLNSTKSKTLELISCKIK EYNSILILLRRSLKVCPSKTIKEGNVISENYNKDLDKWRKIANNASEYLQYFEVSERKRLHITSLKVNNNRVLGYYVQIS KKDIKLAPNNYKKIQTLKHCVRYSTLELLDYENNVNNAKDKVLEIENYLYNELFDFIIPYIDSLKISVNTISELDVLNNL TERACVLNYVCPVISDEYGILLTDSRHPVVENLLKTPFVKNSINLSKSSNMLIITGPNMGGKSTYMRQIALIVIMAYIGS FVPAKYARIGLCDKIFTRIGSADNLAYGESTFMMEMIEMSSILRNSTSNSLVLIDELGRGTSMHDGLSLAWACIEYLAGK INAMTLFSTHYFELTKLKNYYSNIRNMYFDVLEHNNEIVFTYVIKNGFINKSYGLVVAALAKLPKCILLSAKKKLKEFYP |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | AAA80578.1 | DNA mismatch repair protein | Virulence | SPI-1 | Protein | 4e-178 | 48 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | NP_777987.1 | DNA mismatch repair protein MutS | VFG0562 | Protein | 0.0 | 50 |
