|
Name : SE0247 (SE0247) Accession : NP_763802.1 Strain : Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 Genome accession: NC_004461 Putative virulence/resistance : Unknown Product : bicyclomycin resistance protein TcaB Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG2814 EC number : - Position : 244210 - 245613 bp Length : 1404 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTGAAACGCTTTCATAAAGGCATTATAATTAGTCTAGCTATAGAAAAAGGAATGATACGAATGAAAGCAAATAAGTA TTTAATCTTTATTTTGGGAGCACTTGGTGGCTTATTATATGGTTATGATAATGGTGTGATTTCCGGTGCTTTATTATTTA TACATAAAGACATACCTCTCAATAGTACAACTGAGGGTATCGTTGTGTCTTCAATGTTAATTGGCGCAATAGTCGGTGCG GGAAGCAGTGGGCCACTTGCTGATAAATTAGGTCGTCGACGTCTAGTAATGCTCATCGCTATTGTATTTATTATTGGGGC ACTGATTCTTGCTGCATCAACCAATTTAGCATTATTAATTATTGGACGTTTAATTATTGGTTTAGCAGTGGGTGGTTCGA TGTCTACGGTACCTGTTTATTTAAGTGAAATGGCACCGACAGAATATCGTGGCTCACTAGGTTCACTTAATCAACTAATG ATTACAATTGGTATTTTAGCAGCATATTTAGTCAACTATGCATTTGCGGATATTGAGGGTTGGCGTTGGATGCTAGGATT AGCAGTTGTTCCATCGGTTATTTTACTTGTGGGTATTTATTTTATGCCTGAGAGTCCAAGATGGTTACTTGAAAATAGAA ACGAAGAAGCCGCTCGTCAAGTGATGAAGATTACTTATGACGATAGCGAAATTGATAAAGAACTTAAAGAGATGAAAGAA ATTAACGCTATCTCTGAATCTACATGGACAGTCATTAAATCACCATGGTTAGGTAGAATATTAATTGTAGGTTGTATATT TGCTATTTTCCAGCAATTTATTGGTATCAATGCAGTCATTTTCTATTCATCTTCAATCTTTGCTAAGGCTGGACTGGGTG AAGCGGCGTCTATATTAGGTTCAGTTGGTATAGGAACTATTAATGTTCTTGTAACAATAGTTGCCATTTTTGTAGTAGAT AAGATTGATCGTAAAAAACTACTTGTTGGTGGTAATATTGGTATGATTGCCTCATTATTAATTATGGCAATCTTAATTTG GACAATTGGAATTGCTTCATCAGCGTGGATTATTATTGTTTGTTTATCATTATTTATTGTATTCTTTGGGATTTCTTGGG GACCTGTTCTATGGGTTATGCTACCTGAATTATTCCCGATGCGCGCACGTGGCGCTGCTACGGGCATTTCAGCGCTTGTG CTAAATATCGGAACGCTTATCGTGTCATTGTTCTTCCCAATATTAAGTGATGCATTAAGTACAGAATGGGTATTTTTAAT CTTTGCATTCATAGGTGTTTTAGCGATGATTTTCGTAATTAAATTCTTACCAGAAACACGCGGACGTAGTTTAGAAGAAA TAGAATATGAATTACGTGAACGTACAGGAGCAAGAACTGAATAA Protein sequence : MLKRFHKGIIISLAIEKGMIRMKANKYLIFILGALGGLLYGYDNGVISGALLFIHKDIPLNSTTEGIVVSSMLIGAIVGA GSSGPLADKLGRRRLVMLIAIVFIIGALILAASTNLALLIIGRLIIGLAVGGSMSTVPVYLSEMAPTEYRGSLGSLNQLM ITIGILAAYLVNYAFADIEGWRWMLGLAVVPSVILLVGIYFMPESPRWLLENRNEEAARQVMKITYDDSEIDKELKEMKE INAISESTWTVIKSPWLGRILIVGCIFAIFQQFIGINAVIFYSSSIFAKAGLGEAASILGSVGIGTINVLVTIVAIFVVD KIDRKKLLVGGNIGMIASLLIMAILIWTIGIASSAWIIIVCLSLFIVFFGISWGPVLWVMLPELFPMRARGAATGISALV LNIGTLIVSLFFPILSDALSTEWVFLIFAFIGVLAMIFVIKFLPETRGRSLEEIEYELRERTGARTE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SH0071 | YP_251986.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 3e-123 | 67 |
