|
Name : SE2333 (SE2333) Accession : NP_765888.1 Strain : Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 Genome accession: NC_004461 Putative virulence/resistance : Unknown Product : NADH dehydrogenase subunit 5 Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1009 EC number : - Position : 2416221 - 2417717 bp Length : 1497 bp Strand : - Note : Catalyzes the transfer of electrons from NADH to ubiquinone DNA sequence : ATGTTAAGTTCAGAGTTAATTTTGTTTATGTTTTTTATTACACTTGTCATTGCTATACTGAGTGGATTAATATTTTTGAA TCATCGAGTTCCCATTCAATATATTAAATTTCATATATATTTACTTGTTTTACCTATCATTACGGGATTAAGTGGATTAA TATTTTTCGGTGAAAGGGCGAATGTTGGACCTTTTGTAGTTGATCATCTTACTTGGTTAATGATGACATTTATTTTGACT TTAGGCTTTATCATTCAAAAGTTTTCTATGCGTTATTTAATTGGCGACATGCATTACCGTAAATATTTTCCGTTTTTTAC ATTAATTACTGCATTTGCTTCATTGGCATGGTTAAGTGGAGACTTAAGGTTAATGACCATGTTTTGGGGTGCAACATTAT TTGTGTTAACACGGCTCATTAAAGTTAACAAATTATGGAAGGTGCCTAGGGAAGCAGCAAGAATTTCAGCTTGGTCATTT ATATTGGCATGGTTGTCGTTATTGATTGCTGTCATTTTATTGTATATCGCTACAGGAGATTGGTATATTTATTCGAATAT GTCAGATGATAATGCAATCAATTATGGAATGCGTCTCTGTATCAATTTACTTATTGTTTTAGCTGTGATTATTCCGGCGG CACAATTTCCATTTCAAGGCTGGCTTATTGAATCTGTAGCTGCGCATACGCCAGTTTCAGCTATTATGCACGCTGGTATT GTTAATGCTGGTGGCGTTATTCTTACACGCTTTTCTCCGGTATTTAATGACGAAATAGCCATTTCACTGTTATTAATTAT TGCAAGTATTTCAGTATTGTTGGGTTCTGGAATCAGTCTTGTGCATGTTGATTACAAGAGACAACTTGTAGGTTCTACGA TAAGTCAAATGGGTTTTATGTTAGTACAATGTGCGCTTGGGGCATATTCTGCGGCGATAGTACATTTAATATTGCATGGT GTGTTTAAAGCGACATTATTTCTACAATCGGGTTCTGTTGTTAAAAGATTTAACATTCCTACGCCTCCATCTGTTAAAAA ATCATATGGCTGGCTTGTATTTGGTCGTCTACTAGCTATTCTTATAGCGATAATATTTTGGTTGAATAGTGATAGACATG CATATGATGTATTAAGCGCTCTTATATTAGCTTGGTCGTTAATGGTGTCATGGAATCAATTAGTTGCTTTTAGTCATGGA CTCATCGGAAGAGTCATCGGAGTATGTATGATTATTGTTGTAGTAATTGTTTATATTATTACGCATCATTATTTCTTCAC GACATTAAGTAACGTTGATATTCATATTGTTTCACCACCACTCATAAGTATTATTCTATCGATTGCTATTATAGTTTTCG GCAGTATGTTAAGCATATGGGTATCACGGCGAAGAGAATCAAAGGCATTTGCGAAGTTATACTTGTGGCTTATTAAAGTA GGAGAGGCTAAAACCCAATCTATAGAAAGTCATCCATCATATTTAAAACGATTTTAG Protein sequence : MLSSELILFMFFITLVIAILSGLIFLNHRVPIQYIKFHIYLLVLPIITGLSGLIFFGERANVGPFVVDHLTWLMMTFILT LGFIIQKFSMRYLIGDMHYRKYFPFFTLITAFASLAWLSGDLRLMTMFWGATLFVLTRLIKVNKLWKVPREAARISAWSF ILAWLSLLIAVILLYIATGDWYIYSNMSDDNAINYGMRLCINLLIVLAVIIPAAQFPFQGWLIESVAAHTPVSAIMHAGI VNAGGVILTRFSPVFNDEIAISLLLIIASISVLLGSGISLVHVDYKRQLVGSTISQMGFMLVQCALGAYSAAIVHLILHG VFKATLFLQSGSVVKRFNIPTPPSVKKSYGWLVFGRLLAILIAIIFWLNSDRHAYDVLSALILAWSLMVSWNQLVAFSHG LIGRVIGVCMIIVVVIVYIITHHYFFTTLSNVDIHIVSPPLISIILSIAIIVFGSMLSIWVSRRRESKAFAKLYLWLIKV GEAKTQSIESHPSYLKRF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SAR0452 | YP_039900.1 | NADH dehydrogenase subunit 5 | Not tested | vSa¥á | Protein | 3e-124 | 62 |
| SAS0410 | YP_042536.1 | NADH dehydrogenase subunit 5 | Not tested | vSa¥á | Protein | 4e-125 | 62 |
