|
Name : SE1945 (SE1945) Accession : NP_765500.1 Strain : Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 Genome accession: NC_004461 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease lctP-like protein Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 1978772 - 1980373 bp Length : 1602 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAGTAGAATCTTTTAATCCATTTGGTAATTTACTATTATCATCTTTAATTGCGGCAATCCCTATCATTTTATTTTT ACTGTGTCTTACAGTATTTAAAATGAAAGGAATTTATGCTGCTATCACAACCCTTGTGGTTACATTATTAATTGCAATTC CATTCTTTAAATTACCAGTAGGAATTGCCTCTGGAGCAGTTGTTGAAGGTTTCTTCCAAGGTATCTTCCCAATCGGATAT ATTGTTATTATGGCAGTATTATTATATAAGATTACTTTGAAATCGGGGCAATTCGCAACTATTCAAGACAGTATTACAAG TATTTCACAAGACCAAAGAATTCAGCTTCTTTTAATTGGTTTTTCATTTAATGCATTCTTAGAAGGCGCTGCAGGATTTG GTGTTCCAATTGCAATTTGTGCACTTTTATTAGCGCAACTTGGCTTTAGACCATTACAAGCAGCTATGTTATGTTTAGTA GCTAACGCTGCATCTGGTGCATTCGGTGCAATTGGTATTCCGGTTGGTGTTGTAGATACACTTAACTTACCTGGTCATGT AGAAGCGATGGGAGTTTCACAAACATCAACATTAACTTTAGCAATTATTAACTTCTTTATTCCTTTCTTACTTATCTTTA TCGTAGATGGTTTCAAAGGAATTAAAGAAACTTTACCTTCAATTCTTGTTGTTTCTGTCACTTATACAGTTTTACAAGGA TTACTTACAGTGTTTAATGGTCCAGAATTAGCTGATATCATTCCATCACTTGCTTCTATGTTAGCATTAGCTTTATTCTC TAAGAAATTCCAACCTAAGAATATCTTTAGAGTTCAAAAAGATGTTAAACCAGAAGCACCGAAAAAACTTAAAGGTAAAG AAGTCTTATTTGCTTGGAGTCCATTCATTATCTTAACTGTCATTGTTATGATTTGGAGTGCACCTTCATTTAAAGCATTA TTTGCACCAAAAGGTAAATTATCTGCTTTAGTTGCTAACTTTGACTTACCTGGTACTTTCAGTAATATTTCACACAAACC AATTACTTTATCATTAAACTTAATTGGTCAAACAGGTACAGCAATCCTAATTACAATTATTATTACTGTTTTAATGGCTA AAAAAGTTAACTTTGGTGATGCTGGTCGTTTATTTGTTGAAGCATTTAAAGAATTATGGTTACCAATCATAACAATTTGT TTCATCTTAGCAATTTCAAAAATCACAACATATGGTGGTTTAAGTAATGCTATGGGACAAGGCATCTCAAAAGCAGGAAG CGTATTCCCAATATTATCACCAATCCTTGGTTGGATCGGCGTATTTATGACTGGTTCAGTTGTTAATAACAACTCTTTAT TCGCGCCAATTCAAGCTTCTGTAGCACAACAAATTGGTACAAGTGGTTCACTACTTGTAGCTTCAAATACAGCAGGTGGG GTTGCGGCGAAACTTATTTCTCCACAATCTATTGCCATTGCAACAGCAGCTGTTAAAGAAGTAGGTAAAGAATCTGAACT ACTTAAAATGACATTACGTTATAGTATTGGATTACTTGTATTTATCTGTATCTGGACATTTATCTTGTCATTCATTCTGT AA Protein sequence : MLVESFNPFGNLLLSSLIAAIPIILFLLCLTVFKMKGIYAAITTLVVTLLIAIPFFKLPVGIASGAVVEGFFQGIFPIGY IVIMAVLLYKITLKSGQFATIQDSITSISQDQRIQLLLIGFSFNAFLEGAAGFGVPIAICALLLAQLGFRPLQAAMLCLV ANAASGAFGAIGIPVGVVDTLNLPGHVEAMGVSQTSTLTLAIINFFIPFLLIFIVDGFKGIKETLPSILVVSVTYTVLQG LLTVFNGPELADIIPSLASMLALALFSKKFQPKNIFRVQKDVKPEAPKKLKGKEVLFAWSPFIILTVIVMIWSAPSFKAL FAPKGKLSALVANFDLPGTFSNISHKPITLSLNLIGQTGTAILITIIITVLMAKKVNFGDAGRLFVEAFKELWLPIITIC FILAISKITTYGGLSNAMGQGISKAGSVFPILSPILGWIGVFMTGSVVNNNSLFAPIQASVAQQIGTSGSLLVASNTAGG VAAKLISPQSIAIATAAVKEVGKESELLKMTLRYSIGLLVFICIWTFILSFIL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 5e-70 | 42 |
