Name : SE1482 (SE1482) Accession : NP_765037.1 Strain : Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 Genome accession: NC_004461 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA topoisomerase III topB Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0550 EC number : - Position : 1528014 - 1530170 bp Length : 2157 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGACAATTTTAATCATTGCTGAAAAACCAAATCAAGTCAAAAAATATGTGGAAGCTTTAGGAAATAGTTTTAACAATAA AGATGGATATATTGAATTAGAAAGTGAATTGTTTGATAAGAAAGTAATCGTAACTTGGTGTGTTGGACATTTAATTCAAT TAGCCCATATGGAAGATTATGATTCAAATTTAAAGCAGTGGAGTAAAGATACATTACCATTTATTCCAGAAGACTTCATT TTTAAAGTATCTGACTATGGTAGTAAACAATTTAAAATCATCAAAGAACTATGCGAAAATTTAAATTCAGATTCAGAAAT TATAATTGCAACTGACCCAGATAGAGAGGGAGAGGCAATAGCAAGATATGTTCTAAATAAAATACCATGTACTAAAAATC TTAAATTAAAAAGGTTATGGGCAAATACACAAGAACCAGAAGGTTTAAAATTAGCATTTAAAAATCTTAAAGATGCAGAT GATACTTATAGATTTTATTTAGAGGCTGAGGCAAGAAGTATTGCTGATTGGCTTGTTGGTATGAATTTTACAAGATATGT GACTTTAGAAATGAAACAACTAGGAATAGATGAGGGAGTATTTTCAGTCGGACGAGTGCAAACCCCTACATTGTATATGG TATATAAGAGAAATAATGAAATTAAAAATTTTGAATCTAAAACTTATTATGAAATGGTAGCTAAAGATAAAGAAAATGAA AATGCAGTATTTAAAAGTGAACATAAGTTTGATTCTATAGATGAATTTGAGCAATTTCTTAATGAAAATAACTTAAATTG TGAATGTGAGGGAGAAATTAAAGAAATAAGTATATCTGAAAAGAGAAAAGTAGCACCTAATCTTTTTAAATTAGGAGGCA TACAAAAGGTTGCTAACCAAAAATGGGGATATACATTAGATAAAACGTTATCTATTGTACAAAGTTTATATGATAAAGGC TATCTCAGTTATCCAAGAACAGACTGTTCATTAATTACACATAGTGAATTTGAATATTTAAAAGATAATTTTTCGTCTTA CTGTAAATTATTAAATATTGAGATTGAACAAAAAAATATAGAACCTAGAACTCAATACGTAAATGACAGTAAGGTATTAG AACATTACGCTATAATACCAACTAAACAAATACCCGAAAATGATGTTTATAACAATTTTAGCGATGATGAAAAGAAAATA TATGACGAGGTTGTTAAAAGAACGATGTTAATGTTTATGGAAGATTATATTTATAGTGAAACTAAAATAGTTCTTTGTAT TGAGAATGTAGAATTTAAATTAACTGGTAATGTAGCTAAAGAACAAGGTTGGAAACTACTTGATTCAGAAAATAAAAATT CAAAAGAAAAGTTATTACCTAATTATAAAGAAAATGAAAAACTATCATTGAATTTAGTTCCGAAAGAGCTGAATACTAAA CCACCAAAGTATTTAACTGAGGCAACTCTAGGTGGAGAGGGTGGATTAATGGAAAATTGTTCAAAATTCATTGAAAATGA GGAATTAAAAGGTAACTTAAAAGAAGTACATGGTATAGGGACACCAGCCACACGTTCAAGTATCGTTAAAAGTCTGATAG ATAGGGGATATTTAGAAACTAAAAAGAAACATTTAATGATTACACCTAAAGGTACATTGCTTTGTAGCGCGTTAGAAAAT ACAAATTTAGTTTCAGTTGAAATGACCGCTAACTGGGAGTCAACTTTAAAAGATATTTCAGAAAAGGGTCATCGAATTCG ACAAAACGAATTTATTGATTCGATTAAACAGTATATTAAACAAATGATTAATAGCGATAATAAATTATTGAAATTGGAGA GCAATGACAAAAATATAGAGAAAGCGATTGAACAATCTACAATTTGTAATTGTCCTAAATGTTCTAACGGAAGAATTAAG AAGTTATTAAGTAAGAACAAAAAACTCTTTTATGCATGTAGTAATAAAGATTGTGATTTTATCATATTTGGAATGATTTC AAATAAAAATATTACTCCACAAATTGTTAAAGAAATAATTGAAAAAGGTAAAACGAAAACTATTAAAGGTTTTACAAGTA AAGCAGGTAAGAAATTTAATGCAAAATTAAAATTAACAGAAAAAGGTGTTGAGTTTGATTTTAATAAGAAAAAATGA Protein sequence : MTILIIAEKPNQVKKYVEALGNSFNNKDGYIELESELFDKKVIVTWCVGHLIQLAHMEDYDSNLKQWSKDTLPFIPEDFI FKVSDYGSKQFKIIKELCENLNSDSEIIIATDPDREGEAIARYVLNKIPCTKNLKLKRLWANTQEPEGLKLAFKNLKDAD DTYRFYLEAEARSIADWLVGMNFTRYVTLEMKQLGIDEGVFSVGRVQTPTLYMVYKRNNEIKNFESKTYYEMVAKDKENE NAVFKSEHKFDSIDEFEQFLNENNLNCECEGEIKEISISEKRKVAPNLFKLGGIQKVANQKWGYTLDKTLSIVQSLYDKG YLSYPRTDCSLITHSEFEYLKDNFSSYCKLLNIEIEQKNIEPRTQYVNDSKVLEHYAIIPTKQIPENDVYNNFSDDEKKI YDEVVKRTMLMFMEDYIYSETKIVLCIENVEFKLTGNVAKEQGWKLLDSENKNSKEKLLPNYKENEKLSLNLVPKELNTK PPKYLTEATLGGEGGLMENCSKFIENEELKGNLKEVHGIGTPATRSSIVKSLIDRGYLETKKKHLMITPKGTLLCSALEN TNLVSVEMTANWESTLKDISEKGHRIRQNEFIDSIKQYIKQMINSDNKLLKLESNDKNIEKAIEQSTICNCPKCSNGRIK KLLSKNKKLFYACSNKDCDFIIFGMISNKNITPQIVKEIIEKGKTKTIKGFTSKAGKKFNAKLKLTEKGVEFDFNKKK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SE1482 | NP_765037.1 | DNA topoisomerase III topB | Not tested | vSe2 | Protein | 0.0 | 100 |