|
Name : SE1478 (SE1478) Accession : NP_765033.1 Strain : Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 Genome accession: NC_004461 Putative virulence/resistance : Unknown Product : LtrC-like protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1524104 - 1526440 bp Length : 2337 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGCTTTTAATAAGAAGAATTTTGCATTAGAAAAGAAAAAAGAATTACAAGAAATGACGAACAGTGCTGTACGAAGAGT ATTAGATTTTAAGAAAGACCCTAATAAAGTAATAGAATTATTAAATTTTATGGCAAGAAGCCCACAATATTCTTTTAAAA ATCAAATGATGGTTAGTTCTCAATATGAAAACTCTAACTTTACTATGGGTTCTAGACAATTTAAAGAAACAATGGGATTA AAAGTAAATGAAAATGCTACACCTATTAAAATAGTTGCCCCAGTAATGAATACTTTTTTTAAAAGAAATGATAAATTAGT ACAACTACGCTTTGCTAATAAAGAAGAAAAAGAAAAGATAAAAAATAAAGAAATTAAAACTATTCAAAACGTTTGGTACT ATAAATTAGTCGATGTATACGATATTACACAAACGAATGCAAAACCAGAGGATTTTCCAGAATATTATCCTGACAGACGT TATAATTTTTATGTGAAAAATACAGAAGTAATAGATGATATTATTTCAGCTAATAAAAAACTACTTAAAGATAATAATAT CCATTTAATAGAGAACCATACCTATAATCAGTTAGGAACAAGTGTCGGATTTGCTGGTAAAAATTTAACTGGAGATAAAA TAGTGGGCTATCGTGATGGTTTGAATAAAACAGAAATCTTGCACACACTTTTACATGAAACAACACATGCTTTTTATCAT CAAAAAGAAAATCCAGAAAAAACAACGGAACTAAAAGAATTTGAGGCTGAGATGACAGCTTATATAGTAGCAAAACGATT TGGTGTTGATACATCAGAACATACAATTAAATATGTATCAGATTGGACAGAATCAATGTCAAAAATTGAAGATATTGAAC AATCTATTAAAACAGTATCAATGTATTCTTCTAGAATTATTAATGATATTGAAAAGCAAATAGACCCAGTAAAAATTAAA GAATTCTACAAACAAAATCCAGAATATAATGTTGATATTAAAGAATCATCTATAAAACAAATGGATAAAATTGATATTAA TAAAGAAAACAAGGATATGTTTCAAAATGTATCAAAAGATGAAATTAAAAAGGCTAGTCAAATTGATATAGTCAAATTAG CGATACATGAGGGATATAATCCAAAAAAAGTAGGTAAAAACTTCTATATTGATAAAGATAATCATCATTTAACATTTAAT AGTGAAAAGAACACTTATTATGACAAAGAAAATAAACTAGGTGGAAATCCTATTGTATTTTTTAGAAATCAAAAAAATAC ATCTTTTGTCAGTACTGTTAAATACTTAAATGAATTATCTGAAGATGCAACATTTAATAATATAGAAGTAGAACAAAATA AATTACCAATTTCAGAAGAGCAATTGGAAAATGCTAAAAACAAGTCGATTCTAGATGTTGCTAGTGAATGTGGATATTCT TTTAGAAAATCGGGCAAATATTACATAGGTAATGAGCATGATTCACTTGTGTTAAATGCTAATAAAAATACCTATAATTG GTATTCTAAGCAAGAATACGGAAATACAATCAATTTCATTCAAAATGAAAAAGGTCTAGATTTTATAGATGCAGTAAAAT ATCTAAATAATGAAGAGTTTCAAGTGGCTAATTTTAAAGAAGAAAAAGTTGTTTATGATTCATCAAAGTATAAATACAAA GAGAAAGAAGATATGGCTGTTTCACGTGATTATTTGATTAATAAAAGAATGTTAAATGAAGATTTAGTTAATCAATTAAT TGAACAAGATTATATTAAAGAAGATAAAATGAAAAATGTATGTTTCCAATGGAAAAATCAAGATGGGGAAATTGTTGGCT CAGATAAACGTGGTACTGGTAAGACACCTTTTAGAGGTATAGATAAAGGCAGTGATATTAAACATGCTTTTAATTTCAGT ACTACAGAGAAGCCAAAAGATATATATATATTTGAAGCTCCAATTGATGCGTTATCTTATAGAACCCTAAATCAAGATAA AGACGGAATATATATGTCAATGAACGGATTAAAACAAGATGCTGTGAGATATCAAATAGCATTTTATATGAAAAGATATG AAACTGACCCCGAATCAGTTCATTTATGTGTTGATAATGATGAAGCAGGAAATAAATTTATAAATAATTTCCAAGGGCTT ATTTCTAATCAATCAGGTAAAGAAATAAATATTGTTCCTGAACAACCAAAAGAAGATGGTTGTAAAGATTGGAATGATGT TTTAGTTAACCATGTTTATAAAGAAAAAGACAGAAACTTTAATGCTAAAAAAACAAATGTTTTAAACAAAAGTAAAAGTG TGGCAATGGAAATTTAA Protein sequence : MAFNKKNFALEKKKELQEMTNSAVRRVLDFKKDPNKVIELLNFMARSPQYSFKNQMMVSSQYENSNFTMGSRQFKETMGL KVNENATPIKIVAPVMNTFFKRNDKLVQLRFANKEEKEKIKNKEIKTIQNVWYYKLVDVYDITQTNAKPEDFPEYYPDRR YNFYVKNTEVIDDIISANKKLLKDNNIHLIENHTYNQLGTSVGFAGKNLTGDKIVGYRDGLNKTEILHTLLHETTHAFYH QKENPEKTTELKEFEAEMTAYIVAKRFGVDTSEHTIKYVSDWTESMSKIEDIEQSIKTVSMYSSRIINDIEKQIDPVKIK EFYKQNPEYNVDIKESSIKQMDKIDINKENKDMFQNVSKDEIKKASQIDIVKLAIHEGYNPKKVGKNFYIDKDNHHLTFN SEKNTYYDKENKLGGNPIVFFRNQKNTSFVSTVKYLNELSEDATFNNIEVEQNKLPISEEQLENAKNKSILDVASECGYS FRKSGKYYIGNEHDSLVLNANKNTYNWYSKQEYGNTINFIQNEKGLDFIDAVKYLNNEEFQVANFKEEKVVYDSSKYKYK EKEDMAVSRDYLINKRMLNEDLVNQLIEQDYIKEDKMKNVCFQWKNQDGEIVGSDKRGTGKTPFRGIDKGSDIKHAFNFS TTEKPKDIYIFEAPIDALSYRTLNQDKDGIYMSMNGLKQDAVRYQIAFYMKRYETDPESVHLCVDNDEAGNKFINNFQGL ISNQSGKEINIVPEQPKEDGCKDWNDVLVNHVYKEKDRNFNAKKTNVLNKSKSVAMEI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SE1478 | NP_765033.1 | LtrC-like protein | Not tested | vSe2 | Protein | 0.0 | 100 |
