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Name : SE0137 (SE0137) Accession : NP_763692.1 Strain : Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 Genome accession: NC_004461 Putative virulence/resistance : Resistance Product : capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5B Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0003 EC number : - Position : 130481 - 132226 bp Length : 1746 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGAGGATGCTGTGGTGGAGATGGATGCTGTTAAGTACTTAAATAAATTGAATTTAGATAACGTTGAGTTAACAAAATA TTTGTTTTTTACTGGTAAAGGTGGCGTAGGCAAAACAACGATATCAAGTTTTATTGCTTTAAACTTAGCAGAGAATGGAA AGAAAGTAGCTTTAGTAAGTACTGATCCAGCTAGTAATTTACAAGATGTATTTCAAATGGAATTATCTAATAAATTAACT AAATATCAACCTATACCTAATCTCTCTATAGCCAATTTTGACCCGATTGCTGCTGCAGACGATTATAAAGCACAATCTAT AGAACCTTATGAGGGTATTCTACCAGAAGATGTGCTTGCTGAGATGAAAGAACAGTTAAGTGGTTCATGTACAGTTGAAG TAGCAGCATTTAATGAATTTACAAATTTTTTATCCGATAAAACTTTAGAACAAGAATTTGATTTCATTATATTTGATACA GCTCCAACAGGTCACACCTTGAGAATGCTTGAATTACCTTCTGCATGGACAGATTATTTAAATACAACGAGTAATGACGC TTCTTGCTTAGGTCAATTATCAGGTTTAAATGAAAATAGAGTTAAATATAATTCAGCACTTGAAAAACTACGTAACCAAG ATGATACGACCATGATGTTAGTTGCGAGACCTAGTCACTCTTCTATATATGAAATTCAAAGAGCGCAACAAGAATTACAA CAACTGTCAATTTCTAAATTCAAAGTAATCATTAACAACTATATAGAAGAAAGTCACGGTTTAATTTCGAGTCAGATGAA ATCAGAACAAGATAAAAACATTAATCATTTTACTGAATGGTTAAATAACAATCATGCTTATTACGTTCCATATAAAAAGC AGAAAGAAGAAGGTATAGAAAGTTTAACTAATCTATTAAATGATGATAACTTAATTGAAAATGATGACTTTATTGTTGAA GATCATCCGCAATTCAATAAATTAATAGATGAAATTGAAAATAGTAAAGTTCAATATTTATTTACAATGGGAAAAGGTGG CGTTGGTAAAACGACAGTAGCAACGCAATTAGCTACAGTATTATCTAATAAAGGATATCGTGTTCTTTTAGCAACTACTG ACCCTACTAAAGAAATTAATGTTGAAACCACAAGTAATTTAAATACTGCTTATATTGATGAAGAACAAGCATTAGAAAAA TATAAAAAAGAAGTACTAGCAACAGTGAATGATGATACACCACAAGACGATATTGATTATATTATGGAAGATTTAAAATC ACCTTGTACAGAAGAAATAGCATTTTTCAAAGCCTTTAGTGACATTATGGAGAATCAAGAAGACATGGATTACGTAATTG TAGATACAGCTCCTACAGGCCATACCTTGCTATTACTTGATTCTAGTGAAAATCATCATAGAGAATTAAAGAAAAAATCC ACTCAAACTACCAGTAATGTTGAAACATTATTACCCAAAATTCAAAATAAAAATTTAACACAGATGATAATCGTAACATT AGCAGAAAAAACACCTTATTTAGAATCTAAACGTTTAGTAGAAGATTTAAATAGAGCTAATATAGGCCATAATTGGTGGG TTGTTAATCAATCGTTAGTTACGCTAAATCAACGTGATGACCTTTTTAGTAACAAAAAAGAAGATGAATCATTTTGGATA AACAAGATTAAAAATGAAAGTCTTGATAATTACTTTGTCATACCTTATCGAGTATTAGAATATTGA Protein sequence : MEDAVVEMDAVKYLNKLNLDNVELTKYLFFTGKGGVGKTTISSFIALNLAENGKKVALVSTDPASNLQDVFQMELSNKLT KYQPIPNLSIANFDPIAAADDYKAQSIEPYEGILPEDVLAEMKEQLSGSCTVEVAAFNEFTNFLSDKTLEQEFDFIIFDT APTGHTLRMLELPSAWTDYLNTTSNDASCLGQLSGLNENRVKYNSALEKLRNQDDTTMMLVARPSHSSIYEIQRAQQELQ QLSISKFKVIINNYIEESHGLISSQMKSEQDKNINHFTEWLNNNHAYYVPYKKQKEEGIESLTNLLNDDNLIENDDFIVE DHPQFNKLIDEIENSKVQYLFTMGKGGVGKTTVATQLATVLSNKGYRVLLATTDPTKEINVETTSNLNTAYIDEEQALEK YKKEVLATVNDDTPQDDIDYIMEDLKSPCTEEIAFFKAFSDIMENQEDMDYVIVDTAPTGHTLLLLDSSENHHRELKKKS TQTTSNVETLLPKIQNKNLTQMIIVTLAEKTPYLESKRLVEDLNRANIGHNWWVVNQSLVTLNQRDDLFSNKKEDESFWI NKIKNESLDNYFVIPYRVLEY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SH0111 | YP_252026.1 | arsenical pump-driving ATPase | Not tested | SCCmec | Protein | 0.0 | 99 |
