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Name : SE1367 (SE1367) Accession : NP_764922.1 Strain : Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 Genome accession: NC_004461 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 1395910 - 1398621 bp Length : 2712 bp Strand : - Note : - DNA sequence : GTGAATACTAAACACGCTTACTCGTTATGTATTTGTATATATGCTAAAATATATGTAAATCTGTTCTGGAGGTTACGTAT TTTGAATAAATTAGTATTAATAGATGGTAATAGTCTAAGCTTTAGAGCGTTTTATGCTCTCCCTTTACTTTCAAACCATG CAGGTATTCATACAAATGCAGTTTACGGCTTTGCTATGCTCTTAGAAAAAATAATTAAAGAAGAAAAACCGAATCATTTT TTAGTTGCATTTGATGCAGGTAAAACGACTTTCAGACATTCTAAGTACAGTGAATATAAAGGTGGTCGTCAAAAGACTCC ACCTGAATTAAGTGAGCAATTTCCATATATTCGTCAACTTTTAGATGCGTATCATATTAAAAGATATGAACTTGATAATT ATGAAGCTGATGACATTATAGGAACATTAAGTAGACAAGCTGATGAAGAAGATTTTGAAACCATTATCATTACAGGTGAT AGAGACTTAACTCAATTAGCCACTGATAATGTTACAATATATTATACAAAAAAAGGTGTTACCGACGTTGATCATTATAC ACCTAAATTTATAGCAGAGAAATATAATGGTTTAGTGCCGAAACAAATTATCGATATGAAAGGTCTAATGGGGGATACCT CTGACAATATTCCTGGCGTTGCTGGTGTCGGCGAAAAGACGGCTATTAAATTACTTAATCAATTTGAGTCAGTAGAAGGG GTCTATGAACATATTGAGGAGGTCACTGCAAAAAAATTAAAAGAAAAACTCATCAATAGTAAAGATGATGCCTTAATGAG TAAAGATTTAGCAACAATCAATGTTCACAGTCCGATTGAAGTATCATTAGAAGATACAAAATTAACTCTACAAGACGACA CTACAAAAAAAATTGAACTATTTAAAAAGCTAGAATTTAAACAACTATTAGCAGATATAGACACATCCTCTACGAATGAA GAAGTCATAGATAAAACTTTTGAAATTGAGCAAGACTTTCAAAATGTAGATTTGAATGATTTAAACGAAGCGGTAATACA TTTTGAACTCGAAGGCACTAATTATCTTAAAGACACTATTCTCAAGTTTGGTTTTTATACAAATCATCAACATGTAGTGA TAAATGCTGAGGATGTAAAGGATTATAAACATTTAGTTCAATGGCTTGAAGATAAAAATACAACTAAAATTGTCTATGAT GCAAAAAAAACTTATGTATCTGCTCATCGATTAGGGATTAATATAGAAAATATTGAATTTGATGTTATGTTAGCAAGCTA TATTATTGACCCATCACGTTCTATTGATGACGTTAAATCTGTGGTAAGTTTATATGGACAAAATTATGTAAAAGATAATA TTACAATATTTGGGAAAGGTAAGAAACATCATATACCTGAAGAACCAATTCTAAACGAACACATTGCCTCTGTGACAGAA GCTATAGCAGCTGTAACTCCAACCATGAAATCACAGTTAGAAGATTATAATCAAATTGAACTGTTGAAAGATTTAGAATT ACCATTAGCAAGAATTTTAAGTGAAATGGAAGAAATTGGTATATATACCGATATCAATGATTTGAAAGAAATGGAATTCG AAATTCAAAAAAAATTGGATGTATTAATATCCAATATTCATGAGTCGGCTGGTGAAGCGTTTAATATCAATTCTCCTAAG CAATTAGGTGTTGTTTTATTTGAAACATTACAATTGCCTGTCATTAAGAAGACCAAAACGGGCTATTCAACAGCTGTAGA CGTATTAGAAAAACTACAAGGTGAGCATCCTATTATAGATGATATTTTAGAATATAGACAACTTGCTAAGTTGCAATCTA CGTATGTAGAGGGATTACAAAAAGTAATAAGCAAAGATCATAGAATTCACACACGTTTTAATCAAACGCTTGCTCAAACT GGTAGATTATCAAGTATAGATCCTAATTTACAAAATATACCTATACGATTAGAAGAAGGAAGAAAGATTAGAAAGGCCTT TAAACCAACTTCTAAAGATAGTGTGATTTTATCTGCTGATTATTCACAAATTGAGTTACGTGTACTTGCTCATATTACGC AAGATGAAAGTTTAAAACATGCATTTATAAACGGACATGATATTCACACTGCAACAGCAATGAAAGTATTTAATGTTGAA TCTGACCAGGTTGATAGTTTAATGAGACGTCAAGCAAAAGCTGTTAACTTTGGTATTGTATATGGTATCAGCGATTATGG ATTGAGTCAGAGCTTGGGTATTACTAGAAAACAAGCAAAAGCATTTATTGATGATTATTTAGCTAGTTTTCCAGGTGTAA AACAATATATGTCAGACATTGTTAAAGATGCAAAAGCACAAGGTTATGTGGAAACACTACTTCATCGTCGTCGATACATT CCTGATATAACAAGTAGAAACTTTAATTTAAGAAGTTTTGCAGAAAGAACAGCAATGAATACACCCATACAAGGTAGTGC AGCTGACATAATAAAATTAGCAATGGTTAAATTCAGTGAAAAGATTAAAGAAACTAAATATCATGCTAAGTTATTATTAC AAGTTCATGATGAACTCATATTTGAAATACCAAAATCAGAAGTAGAAGATTTTAGTAAATTTGTAGAAGAAATTATGGAA CAAGCATTAGTGCTCGATGTACCTTTAAAAGTAGATTCGAATTATGGTGCAACATGGTACGATGCTAAATAA Protein sequence : MNTKHAYSLCICIYAKIYVNLFWRLRILNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNHAGIHTNAVYGFAMLLEKIIKEEKPNHF LVAFDAGKTTFRHSKYSEYKGGRQKTPPELSEQFPYIRQLLDAYHIKRYELDNYEADDIIGTLSRQADEEDFETIIITGD RDLTQLATDNVTIYYTKKGVTDVDHYTPKFIAEKYNGLVPKQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFESVEG VYEHIEEVTAKKLKEKLINSKDDALMSKDLATINVHSPIEVSLEDTKLTLQDDTTKKIELFKKLEFKQLLADIDTSSTNE EVIDKTFEIEQDFQNVDLNDLNEAVIHFELEGTNYLKDTILKFGFYTNHQHVVINAEDVKDYKHLVQWLEDKNTTKIVYD AKKTYVSAHRLGINIENIEFDVMLASYIIDPSRSIDDVKSVVSLYGQNYVKDNITIFGKGKKHHIPEEPILNEHIASVTE AIAAVTPTMKSQLEDYNQIELLKDLELPLARILSEMEEIGIYTDINDLKEMEFEIQKKLDVLISNIHESAGEAFNINSPK QLGVVLFETLQLPVIKKTKTGYSTAVDVLEKLQGEHPIIDDILEYRQLAKLQSTYVEGLQKVISKDHRIHTRFNQTLAQT GRLSSIDPNLQNIPIRLEEGRKIRKAFKPTSKDSVILSADYSQIELRVLAHITQDESLKHAFINGHDIHTATAMKVFNVE SDQVDSLMRRQAKAVNFGIVYGISDYGLSQSLGITRKQAKAFIDDYLASFPGVKQYMSDIVKDAKAQGYVETLLHRRRYI PDITSRNFNLRSFAERTAMNTPIQGSAADIIKLAMVKFSEKIKETKYHAKLLLQVHDELIFEIPKSEVEDFSKFVEEIME QALVLDVPLKVDSNYGATWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 48 |
