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Name : SE0126 (SE0126) Accession : NP_763681.1 Strain : Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 Genome accession: NC_004461 Putative virulence/resistance : Resistance Product : copper-transporting ATPase copA Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG2217 EC number : - Position : 120232 - 122256 bp Length : 2025 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATCATTCTAATCAAATGCATCATGATAACCATGAATCACATAATCATCATAGTGGCCATGCACATCATCATGGAAA TTTTAAAGTTAAGTTTTTTGTTTCATTAATTTTTGCAATACCTATCATTCTTTTATCGCCACTGATGGGTATTAACTTAC CTTTTCAATTCACATTTCCAGGTTCTGAATGGGTAGTGTTAATATTAAGTACAATTTTATTCTTTTATGGTGGTAAACCG TTCTTGTCTGGTGGTAAAGATGAAATTGCTACAAAAAAACCAGGTATGATGACCTTAGTTGCCCTAGGTATTTCAGTAGC TTATATTTATAGCTTGTATGCTTTTTATATGAATAACTTTAGTAGTGCAACTGGTCATACAATGGACTTTTTTTGGGAAT TAGCAACCTTAATTTTAATTATGCTATTAGGACATTGGATAGAAATGAATGCTGTCGGAAATGCTGGAGATGCTTTAAAG AAAATGGCAGAACTGTTACCTAATAGTGCTATTAAAGTTATGGATAATGGCCAACGCGAAGAAGTTAAAATATCAGACAT CATGACTGATGATATCGTCGAAGTAAAAGCCGGAGAAAGCATTCCAACAGATGGTATTATCGTTCAAGGACAAACATCTA TAGATGAATCCCTAGTCACTGGAGAATCTAAAAAAGTACAAAAAAATCAAAATGACAACGTCATCGGGGGTTCTATTAAT GGGTCTGGAACAATACAAGTCAAGGTTACAGCTGTGGGAGAAGATGGATATCTTTCTCAAGTTATGGGACTTGTTAATCA AGCACAAAATGATAAATCTAGTGCTGAATTGTTATCTGATAAAGTAGCGGGTTATTTATTCTACTTTGCTGTAATTGTTG GCGTGATTTCGTTTATTGTCTGGATGCTCATTCAAAATGATGTTGATTTTGCATTAGAACGTCTTGTAACTGTGTTAGTC ATTGCTTGTCCACATGCTTTAGGCTTGGCAATACCTTTAGTCACTGCACGTTCTACTTCAATTGGTGCACATAATGGTTT AATTATTAAAAATAGAGAGTCTGTAGAAATAGCTCAACATATCGATTATGTAATGATGGATAAAACTGGTACTTTAACTG AGGGTAACTTTTCTGTGAATCATTATGAGAGCTTTAAAAATGATTTGAGTAATGATACAATATTAAGCCTTTTCGCCTCA TTAGAAAGTCAATCTAATCACCCATTAGCTATAAGTATTGTTGATTTTGCGAAAAGTAAAAATGTTTCATTTACTAATCC ACAAGACGTTAATAATATTCCAGGTGTCGGATTAGAAGGTCTAATTGATAATAAAACATATAAAATAACAAATGTCTCTT ATCTTGATAAACATAAACTTAATTATGACGATGACTTGTTTACTAAATTAGCTCAACAAGGTAATTCAATCAGTTATTTA ATTGAGGATCAACAAGTCATTGGCATGATTGCTCAAGGAGATCAAATTAAAGAAAGCTCAAAACAAATGGTAGCTGATTT ACTATCAAGAAATATTACACCAGTCATGCTTACAGGTGACAATAATGAAGTGGCACACGCTGTCGCAAAAGAATTAGGTA TTAGTGATGTCCATGCACAACTCATGCCAGAAGATAAGGAAAGCATTATAAAAGATTATCAAAGCAACGGTAATAAAGTC ATGATGGTCGGAGACGGTATCAACGATGCGCCGAGCCTTATAAGAGCCGATATTGGTATAGCAATTGGTGCAGGCACAGA TGTTGCAGTGGATTCAGGTGATATCATACTTGTTAAAAGTAATCCATCAGATATCGTTCATTTCTTGACCCTTTCAAATA ATACTATGAGAAAAATGGTTCAAAACTTATGGTGGGGTGCAGGTTATAATATTGTTGCTGTACCTTTAGCAGCTGGCGCA TTAGCTTTTGTCGGGTTAATATTATCACCAGCTGTAGGAGCAATATTAATGTCTTTAAGTACAGTTATAGTAGCGATTAA TGCTTTTACATTAAAATTAAAATAA Protein sequence : MNHSNQMHHDNHESHNHHSGHAHHHGNFKVKFFVSLIFAIPIILLSPLMGINLPFQFTFPGSEWVVLILSTILFFYGGKP FLSGGKDEIATKKPGMMTLVALGISVAYIYSLYAFYMNNFSSATGHTMDFFWELATLILIMLLGHWIEMNAVGNAGDALK KMAELLPNSAIKVMDNGQREEVKISDIMTDDIVEVKAGESIPTDGIIVQGQTSIDESLVTGESKKVQKNQNDNVIGGSIN GSGTIQVKVTAVGEDGYLSQVMGLVNQAQNDKSSAELLSDKVAGYLFYFAVIVGVISFIVWMLIQNDVDFALERLVTVLV IACPHALGLAIPLVTARSTSIGAHNGLIIKNRESVEIAQHIDYVMMDKTGTLTEGNFSVNHYESFKNDLSNDTILSLFAS LESQSNHPLAISIVDFAKSKNVSFTNPQDVNNIPGVGLEGLIDNKTYKITNVSYLDKHKLNYDDDLFTKLAQQGNSISYL IEDQQVIGMIAQGDQIKESSKQMVADLLSRNITPVMLTGDNNEVAHAVAKELGISDVHAQLMPEDKESIIKDYQSNGNKV MMVGDGINDAPSLIRADIGIAIGAGTDVAVDSGDIILVKSNPSDIVHFLTLSNNTMRKMVQNLWWGAGYNIVAVPLAAGA LAFVGLILSPAVGAILMSLSTVIVAINAFTLKLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SH0105 | YP_252020.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 0.0 | 98 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| SE0126 | NP_763681.1 | copper-transporting ATPase copA | BAC0079 | Protein | 2e-179 | 57 |
| SE0126 | NP_763681.1 | copper-transporting ATPase copA | BAC0383 | Protein | 3e-145 | 50 |
| SE0126 | NP_763681.1 | copper-transporting ATPase copA | BAC0629 | Protein | 2e-126 | 46 |
