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Name : gbs1838 (gbs1838) Accession : NP_736272.1 Strain : Streptococcus agalactiae NEM316 Genome accession: NC_004368 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG4176 EC number : - Position : 1897408 - 1899135 bp Length : 1728 bp Strand : - Note : similar to betaine ABC transporter permease and substrate binding protein DNA sequence : TTGGAAAATTTATTACAACATAAGTTACCGGTCGCACCATTTGTAGAGTCAACGACCAATTGGATTACGAAAACTTTTTC TGGTTTATTTGACTTTATCCAGACAATCGGTAATGCATTGATGGATTGGATGACAAAAACATTACTATTCATTAATCCTT TACTTTTTATTGTACTAATTACAGTTGCTGTATTTTTCTTAGCTAAGAAAAAATGGCAATTACCGACATTTACTTTCATT GGTTTGCTATTTATCTATAACCAAGGGCTGTGGGAGCAGTTGATTAATACTTTTAACTTGGTTTTAGTAGCAAGTTTAAT TTCTATTATTATTGGTGTACCACTAGGTATTTGGATGGCAAAAAGTGATAAAGTTAAACAAGTTGTTAATCCAATTCTTG ACTTTATGCAAACTATGCCAGCATTCGTTTACCTTATTCCTGCAGTAGCCTTCTTTGGTATCGGTATGGTACCAGGTGTC TTTGCCTCTGTTGTATTTGCTTTGCCTCCAACAGTGCGCTTTACTAACTTGGCTATTCGTGAAATCCCACTTGAATTAAT AGAAGCATCTGATTCATTTGGTTCAACAGCTAAGCAAAAATTATTCAAAGTTGAACTACCACTTGCTAAGAACACTATTA TGGCAGGAATCAATCAAACTATGATGTTGGCTCTTTCTATGGTGGTTACAGGATCTATGATCGGTGCACCTGGACTTGGT CGTGAGGTGTTATCGGCGCTTCAACATGCTGATATTGGTACAGGATTTGTTAGTGGTCTATCGCTAGTTATTTTAGCAAT CGTGTTAGACCGTGTTAGTCAATTCTTTAATTCCAAACCGGGTGAGAAGCAAGCTAAAACATCAAAAGTTAAAAAATGGG TAGGTTTAGGGGCCTTGGTTCTCTTCATTCTAGCAGCTCTTGGTCGCATTGTTGTCAATATGACTTCAGGAAATGAAGCC AAAGGTCAAAAAGTGAAAATAGCTTATGTCCAATGGGATTCAGAAGTTGCTTCAACCAACGTTATTGCTGAAGTTTTAAA ATCTAAAGGATATGATGTTGAATTGACACCACTTGATAATGCGGTCATGTGGCAAACAGTCGCCAATGGGAATGCTGATT TTACAACAAGTGCTTGGTTGCCAAAGACCCACGGGCAATATTTTAATAAATACAAAAATAGTTTAGATGACTTAGGTCCT CACGTTGAGAACGTCAAAATAGGTTTAGTTGTTCCTAAATACATGAACGTAAATAGTATTGAAGAATTATCAAATCAAGC AGATAAACAAATTACAGGTATCGAACCAGGTGCAGGTATTATGAAGTCTGCTAAACAATCCCTTAAAGATTATCCAAACC TTTCAAGTTGGAAGTTGTTATCAGCATCAACAGGAGCTATGACAACAACCTTAGGGAAGGCTATCAAAAACAAAGATCAA GTAGTCATTACAGGTTGGTCACCTCACTGGATGTTTGCTAAGTATGATTTAAAATACCTTAAAGATCCTAAGAAATCATT TGGTGGTGAAGAACATATCAATACAATAGCACGCAAGAATTTGAAAAAAGATATGCCAAAAGTATATAAAATTATCGATA AGTTCAAGTGGACTAAAGAAGATATGGAATCTATCATGTTAGATATGGATAAAGGTATGGAGCCTGCTAAAGCAGCTCAA AAATGGATTAAAAACCACAAAAAAGAAGTTTCAGAGTGGACTAAATAG Protein sequence : MENLLQHKLPVAPFVESTTNWITKTFSGLFDFIQTIGNALMDWMTKTLLFINPLLFIVLITVAVFFLAKKKWQLPTFTFI GLLFIYNQGLWEQLINTFNLVLVASLISIIIGVPLGIWMAKSDKVKQVVNPILDFMQTMPAFVYLIPAVAFFGIGMVPGV FASVVFALPPTVRFTNLAIREIPLELIEASDSFGSTAKQKLFKVELPLAKNTIMAGINQTMMLALSMVVTGSMIGAPGLG REVLSALQHADIGTGFVSGLSLVILAIVLDRVSQFFNSKPGEKQAKTSKVKKWVGLGALVLFILAALGRIVVNMTSGNEA KGQKVKIAYVQWDSEVASTNVIAEVLKSKGYDVELTPLDNAVMWQTVANGNADFTTSAWLPKTHGQYFNKYKNSLDDLGP HVENVKIGLVVPKYMNVNSIEELSNQADKQITGIEPGAGIMKSAKQSLKDYPNLSSWKLLSASTGAMTTTLGKAIKNKDQ VVITGWSPHWMFAKYDLKYLKDPKKSFGGEEHINTIARKNLKKDMPKVYKIIDKFKWTKEDMESIMLDMDKGMEPAKAAQ KWIKNHKKEVSEWTK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 77 |
