|
Name : polI (SMU_297) Accession : NP_720755.1 Strain : Streptococcus mutans UA159 Genome accession: NC_004350 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 284102 - 286738 bp Length : 2637 bp Strand : + Note : Best Blastp Hit: sp|P13252|DPO1_STRPN DNA POLYMERASE I (POL I) >gi|98023|pir||A32949 DNA-directed DNA polymerase (EC 2.7.7.7) - Streptococcus pneumoniae >gi|153765|gb|AAA26954.1| (J04479) DNA polymerase I [Streptococcus pneumoniae] DNA sequence : ATGACAAACAAGAAAAAATTATTATTGATTGACGGCTCTTCCGTTGCTTATCGTGCTTTCTTTGCACTTTATAATCAAAT TGACCGCTTTAAAAATCCTGCTGGTTTACACACCAATGCCATTTATGGCTTTCATTTAATGTTGGATCATATGATGAAAA GGGTGGAACCGACGCATGTTTTAGTGGCTTTTGATGCTGGGAAAACAACCTTTCGAACAGAAATGTTTGCAGACTATAAG GCGGGCCGTGCTAAAACGCCGGAAGAATTTCGTGAGCAGCTACCTTATATTAGAGAGATGCTGACCGCTTTAGGTGTTTC CTATTATGATTTGGAAAATTATGAAGCTGATGACATTATTGGAACCCTTGATAAATTAGCCGAAAATGAGGATGAATATG ATGTTACTATTGTCAGCGGTGATAAGGACCTCATTCAGCTGACTGATAGTAATACGACTGTTGAGATTTCCAAAAAAGGT GTTGCTGAATTTGAAGAATTTACACCAGACTATCTCATGGAAAAAATGGGACTGACGCCTAAGCAATTTATTGATCTCAA GGCTCTCATGGGGGACAAATCTGATAATATTCCGGGGGTAACAAAAATTGGTGAGAAGACAGGTTTGAAACTGTTGCATG AACATGGCAGTCTAGAAGCTATCTATGAACATATTGATAGCTTTAAAACGACTAAGATGAAGGAAAATCTCATCAACGAT AAAGAAAAGGCTTTTCTTTCTAAAACACTGGCAACCATTGATACGCAAGCACCGATCACCATCACTTTAGATGATATTGA TTACTCTGGTCCTCAGCTTGATGCACTGGCTAAGTTTTATGACGAAATGGACTTCAGACAATTTCGATCACAACTTGACA GTTCACCTAAAACCGAAAATTTTGAAGTGAGTTATACAGAAGTGACTGAACTCAAGCCTGATATGTTTGCGCCTGATCAA TTCTTTTATTTTGAAATTTTGAATGATAATTATCATACCCAAGAGATGATCGGTCTGGCTTGGGGAGATGACCAAGCGAT TTATGCGACAACTGATACCAGTTTGCTGACGCATGATTTGTTTAAAGAAGCCTTGTCAAAACCTATTAAAACTTATGATT TTAAGCGCGGTAAGGTCTTGCTGAGTCATTTGGGCATTGATCTGCCGACAGCTAGTTTCGATAGTCGTTTGGCCAAATAT TTGCTGTCAACTGTTGAAAATAATAACATTTCGACCATTGCAAGACTTTACACAGATTTACCTTTAGAAACAGACGATGA TGTGTATGGTAAAGGAGCTAAACGTGCTATCCCAGAAAAAAATGTTCTGCTCAGCCATTTAGCTAAAAAAATCAGTGTCT TGCTTGCTAGCGAAGAGCCGATGCGTCAGAAACTGTCTGCCAATGACCAACTGGACTTGCTTTTTGAGATGGAATTACCG CTGGCAAATGTGTTGGCTAAAATGGAAATTGCAGGTATTTCGGTTAGAAAAGAAACGCTGCAGGACATGGAACGGGCTAA TGAGATTGAATTGCAGGCTCTGACTCAGGAGATTTATGATTTAGCTGGTGAGGCGTTCAATATTAATTCTCCAAAACAAT TGGGAGTTATCCTCTTTGAAAAATTGGGTCTGCCCTTGTCAGCCACTAAAAAGACGAAAACAGGTTATTCAACAGCTGTT GATGTCTTGGAACGTCTGGCTCATCGTTCACCAATCGTTGCTAAAATTTTAGAATATCGTCAAATTGCGAAATTGCAATC CACCTATATCATTGGCTTGCAAGATTCGATTTCCTTTGATGGCAAGATTCATACCCGTTATTTGCAAGATTTAACGCAAA CTGGCCGCTTATCCAGCGTTGATCCTAATTTACAAAATATTCCTGTGCGTTTGGAACAGGGACGTCTTATTCGCAAGGCT TTTGTTCCTGAATGGAAAGAGAGTGTTCTGCTCAGTTCAGATTATTCACAAATTGAATTGCGGGTGCTGGCTCATATTTC AGGCGATGAACATTTAATTGCTGCTTTTAAGGAAGGAGCAGACATTCACACCTCTACAGCCATGCGTGTCTTTGGTATTG AAAGACCAGAAGACGTCACTCCTAATGACCGCCGCAATGCTAAGGCTGTTAACTTTGGTGTGGTTTATGGCATTTCTGAT TTTGGTCTGGCTAATAATTTGGGTATTAGCCGCAAAGCCGCTAAGAATTACATTGAAACCTATTTTGAACGTTATCCGGG AATTAAAAATTATATGGATAGAGTGGTGCGAGAAGCGCGTGATAAGGGTTATGTTGAAACGCTCTTTCATCGCCGCCGTG AATTACCGGATATCAATTCACGCAATTTCAATATTCGGTCTTTTGCGGAGCGAACAGCTATTAACTCGCCTATTCAGGGT AGCGCCGCTGATATTCTTAAAGTGGCCATGATTCATCTCGATCAAGCCTTGAAAAAAGGAGATTATCAATCGCGGATGCT CCTGCAGGTGCATGATGAAATTGTCCTTGAGGTGCCAAATGCTGAACTTGAAGCGATCCAAAAGTTGGTCAAGGAAACCA TGGAATCTGCTATTGAACTTTCTGTACCACTTGTGGCAGATGAAAATGCAGGGCAGACTTGGTATGAGGCAAAGTAA Protein sequence : MTNKKKLLLIDGSSVAYRAFFALYNQIDRFKNPAGLHTNAIYGFHLMLDHMMKRVEPTHVLVAFDAGKTTFRTEMFADYK AGRAKTPEEFREQLPYIREMLTALGVSYYDLENYEADDIIGTLDKLAENEDEYDVTIVSGDKDLIQLTDSNTTVEISKKG VAEFEEFTPDYLMEKMGLTPKQFIDLKALMGDKSDNIPGVTKIGEKTGLKLLHEHGSLEAIYEHIDSFKTTKMKENLIND KEKAFLSKTLATIDTQAPITITLDDIDYSGPQLDALAKFYDEMDFRQFRSQLDSSPKTENFEVSYTEVTELKPDMFAPDQ FFYFEILNDNYHTQEMIGLAWGDDQAIYATTDTSLLTHDLFKEALSKPIKTYDFKRGKVLLSHLGIDLPTASFDSRLAKY LLSTVENNNISTIARLYTDLPLETDDDVYGKGAKRAIPEKNVLLSHLAKKISVLLASEEPMRQKLSANDQLDLLFEMELP LANVLAKMEIAGISVRKETLQDMERANEIELQALTQEIYDLAGEAFNINSPKQLGVILFEKLGLPLSATKKTKTGYSTAV DVLERLAHRSPIVAKILEYRQIAKLQSTYIIGLQDSISFDGKIHTRYLQDLTQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEQGRLIRKA FVPEWKESVLLSSDYSQIELRVLAHISGDEHLIAAFKEGADIHTSTAMRVFGIERPEDVTPNDRRNAKAVNFGVVYGISD FGLANNLGISRKAAKNYIETYFERYPGIKNYMDRVVREARDKGYVETLFHRRRELPDINSRNFNIRSFAERTAINSPIQG SAADILKVAMIHLDQALKKGDYQSRMLLQVHDEIVLEVPNAELEAIQKLVKETMESAIELSVPLVADENAGQTWYEAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 77 |
